| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 前言 | 第8-9页 |
| 第1章 文献综述 | 第9-23页 |
| 1.1 基因组重排 | 第9-14页 |
| 1.1.1 基因组重排的概念 | 第9-10页 |
| 1.1.2 人工基因组重排的方式 | 第10-13页 |
| 1.1.3 基因拷贝数变异 | 第13-14页 |
| 1.2 合成型酿酒酵母基因组重排 | 第14-17页 |
| 1.2.1 人工设计合成基因组研究进展 | 第14-16页 |
| 1.2.2 Cre/Lox Psym位点特异性重排系统 | 第16页 |
| 1.2.3 SCRa Mb LE技术应用研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 紫色杆菌素简介 | 第17-21页 |
| 1.3.1 紫色杆菌素的化学结构和合成 | 第17-20页 |
| 1.3.2 紫色杆菌素的药理作用和异源表达 | 第20-21页 |
| 1.4 本课题的主要研究内容与意义 | 第21-23页 |
| 1.4.1 主要研究内容 | 第21-22页 |
| 1.4.2 研究意义 | 第22-23页 |
| 第2章 材料与方法 | 第23-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-29页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第23页 |
| 2.1.2 实验质粒 | 第23-24页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第24-25页 |
| 2.1.4 实验试剂 | 第25-27页 |
| 2.1.5 实验试剂配制 | 第27-29页 |
| 2.2 分子操作方法 | 第29-32页 |
| 2.2.1 酵母内源基因元件的PCR扩增 | 第29页 |
| 2.2.2 酶切与连接 | 第29-30页 |
| 2.2.3 细胞转化 | 第30-31页 |
| 2.2.4 菌落PCR验证 | 第31-32页 |
| 2.2.5 酿酒酵母基因组提取 | 第32页 |
| 2.3 合成型染色体酵母基因组重排（SCRa Mb LE） | 第32-33页 |
| 2.3.1 基因组重排实验步骤 | 第32-33页 |
| 2.3.2 颜色标尺的制作 | 第33页 |
| 2.4 菌株发酵与产物检测 | 第33-35页 |
| 2.4.1 液体发酵 | 第33-34页 |
| 2.4.2 脱氧紫色杆菌素前体的提取 | 第34页 |
| 2.4.3 产物检测 | 第34-35页 |
| 第3章 合成型V号染色体迭代重排与表型多样性 | 第35-49页 |
| 3.1 脱氧紫色杆菌素前体代谢路径的构建和整合型表达 | 第35-37页 |
| 3.1.1 外源代谢路径基因的获取与一步快速组装 | 第35-36页 |
| 3.1.2 外源代谢路径的整合型表达 | 第36-37页 |
| 3.2 合成型V号染色体酵母基因组迭代重排系统的建立 | 第37-39页 |
| 3.2.1 合成型V号染色体重排结构的分析 | 第37页 |
| 3.2.2 精确调控下的基因组重排和重排流程设计 | 第37-39页 |
| 3.3 重排条件的探究与方法建立 | 第39-42页 |
| 3.3.1 相对致死率与基因组重排时间的关系 | 第39-40页 |
| 3.3.2 表型多样性与重排时间的关系 | 第40-41页 |
| 3.3.3 基因组迭代重排表型频率统计 | 第41-42页 |
| 3.4 合成型V号酵母基因组重排表型分化 | 第42-46页 |
| 3.4.1 基因组单轮重排多样性表型展示 | 第42-44页 |
| 3.4.2 基因组迭代重排菌株持续进化 | 第44-46页 |
| 3.5 小结 | 第46-49页 |
| 第4章 合成型V号染色体迭代重排与基因拷贝数变异 | 第49-57页 |
| 4.1 线形合成型V染色体重排测序结果展示 | 第49-52页 |
| 4.1.1 基因拷贝数的变异 | 第49-52页 |
| 4.1.2 基因删除的PCRTag验证 | 第52页 |
| 4.2 环形合成型V染色体重排测序结果展示 | 第52-54页 |
| 4.2.1 基因拷贝数的变异与验证 | 第52-54页 |
| 4.2.2 基因删除的PCRTag验证 | 第54页 |
| 4.3 小结 | 第54-57页 |
| 第5章 合成型V号酵母基因组重排表型与基因型的关系 | 第57-61页 |
| 5.1 基因变异与产物产量的关系 | 第57-59页 |
| 5.1.1 基因敲除与产物产量的关系 | 第57-58页 |
| 5.1.2 代谢通路复制与产物产量的关系 | 第58-59页 |
| 5.2 小结 | 第59-61页 |
| 第6章 结论与展望 | 第61-63页 |
| 6.1 结论 | 第61页 |
| 6.2 展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-69页 |
| 附录A | 第69-83页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第83-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
