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胆碱酯酶中谷氨酸197/202的质子化状态研究

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第一章 绪论第12-20页
    1.1 BChE在阿尔兹海默症中的作用第12-14页
        1.1.1 阿尔兹海默症现状第12-13页
        1.1.2 BChE与阿尔兹海默症第13-14页
        1.1.3 BChE的结构特点第14页
    1.2 分子动力学模拟的理论与方法概述第14-20页
        1.2.1 分子动力学模拟第14-16页
        1.2.2 恒定pH分子动力学模拟第16-20页
            1.2.2.1 离散型CpHMD第17-19页
            1.2.2.2 连续型CpHMD第19-20页
第二章 BChE-他克林复合物晶体结构中甲酰基-脯氨酸分子的影响第20-28页
    2.1 引言第20-21页
    2.2 方法第21-22页
        2.2.1 结构准备第21-22页
        2.2.3 常规的MD模拟第22页
    2.3 结果与讨论第22-26页
        2.3.1 Glu197去质子化的MD模拟第22-24页
        2.3.2 导致上述模拟失败的可能因素第24-25页
        2.3.3 Glu197质子化的MD模拟第25-26页
    2.4 结论第26-28页
第三章 水的氢键网络的重要作用第28-32页
    3.1 引言第28页
    3.2 方法第28页
    3.3 结果与讨论第28-31页
        3.3.1 水的氢键网络第28-30页
        3.3.2 CpHMD模拟计算Glu197的质子化状态比例第30-31页
    3.4 结论第31-32页
第四章 apoBChE中Glu197的质子化状态第32-37页
    4.1 引言第32-33页
    4.2 方法第33页
    4.3 结果与讨论第33-36页
    4.4 结论第36-37页
第五章 AChE中Glu202的质子化状态第37-47页
    5.1 引言第37-39页
    5.2 方法第39-41页
        5.2.1 CpHMD模拟第39-40页
        5.2.2 常规MD模拟第40-41页
    5.3 结果与讨论第41-46页
        5.3.1 Glu202的质子化状态第41-42页
        5.3.2 Glu202质子化状态的重要作用第42-46页
            5.3.2.1 使用Reduce确定的质子化状态的MD模拟第42-44页
            5.3.2.2 使用CpHMD确定的质子化状态的MD模拟第44-45页
            5.3.2.3 Glu202质子化状态对HI6结合状态的影响第45-46页
    5.4 结论第46-47页
全文总结第47-49页
参考文献第49-56页
致谢第56-57页
附录1 (攻读学位期间发表论文目录)第57页

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