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HBVX基因准种的变异特征、遗传进化及其在肝癌病程进展中的作用研究

个人简历第3-7页
中文摘要第7-10页
英文摘要第10-12页
前言第13-16页
1 材料与方法第16-37页
    1.1 研究对象第16-17页
    1.2 实验仪器和实验试剂第17-18页
    1.3 实验方法第18-35页
        1.3.1 肝癌筛查血清学指标检测第18-23页
            1.3.1.1 HBV血清标志物HBsAg检测第18-19页
            1.3.1.2 HBeAg抗原检测第19-20页
            1.3.1.3 丙氨酸氨基转移酶(ALT)的检测第20-22页
            1.3.1.4 甲胎蛋白诊断第22-23页
        1.3.2 HBV病毒复制水平的检测第23-26页
        1.3.3 HBV核酸提取第26-28页
        1.3.4 HBVX基因区的巢式PCR扩增第28-29页
        1.3.5 琼脂糖凝胶电泳第29-30页
        1.3.6 PCR产物纯化回收第30-32页
        1.3.7 DNA浓度检测第32页
        1.3.8 二代测序第32-34页
        1.3.9 TA克隆第34-35页
        1.3.10 Sanger测序第35页
    1.4 测序数据的处理第35-36页
    1.5 系统进化树的构建第36页
    1.6 准种复杂性及多样性指标的计算第36页
    1.7 统计学分析第36-37页
2 结果第37-52页
    2.1 研究对象人口学及基线信息第37-38页
    2.2 HBVX基因区巢式PCR扩增结果第38页
    2.3 HBVX基因区二代测序结果第38-39页
    2.4 TA克隆及Sanger测序结果第39页
    2.5 NGS及CBS两种方法获得的合格准种数量比较第39-40页
    2.6 两种方法获得的准种复杂度值比较和差异性比较第40页
    2.7 两种方法获得的HBVX区变异位点比较第40-42页
    2.8 HBVX基因变异位点在肝癌病程进展中的变化第42-44页
    2.9 NGS和CBS两种方法发现的插入突变比较第44-45页
    2.10 HBVX区准种及其进化树分析第45-49页
    2.11 优势株序列比对情况第49-52页
3 讨论第52-56页
4 结论第56-57页
参考文献第57-64页
附录第64-66页
文献综述第66-79页
    参考文献第73-79页
致谢第79-81页
攻读学位期间发表的学术论文第81页

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