个人简历 | 第3-7页 |
中文摘要 | 第7-10页 |
英文摘要 | 第10-12页 |
前言 | 第13-16页 |
1 材料与方法 | 第16-37页 |
1.1 研究对象 | 第16-17页 |
1.2 实验仪器和实验试剂 | 第17-18页 |
1.3 实验方法 | 第18-35页 |
1.3.1 肝癌筛查血清学指标检测 | 第18-23页 |
1.3.1.1 HBV血清标志物HBsAg检测 | 第18-19页 |
1.3.1.2 HBeAg抗原检测 | 第19-20页 |
1.3.1.3 丙氨酸氨基转移酶(ALT)的检测 | 第20-22页 |
1.3.1.4 甲胎蛋白诊断 | 第22-23页 |
1.3.2 HBV病毒复制水平的检测 | 第23-26页 |
1.3.3 HBV核酸提取 | 第26-28页 |
1.3.4 HBVX基因区的巢式PCR扩增 | 第28-29页 |
1.3.5 琼脂糖凝胶电泳 | 第29-30页 |
1.3.6 PCR产物纯化回收 | 第30-32页 |
1.3.7 DNA浓度检测 | 第32页 |
1.3.8 二代测序 | 第32-34页 |
1.3.9 TA克隆 | 第34-35页 |
1.3.10 Sanger测序 | 第35页 |
1.4 测序数据的处理 | 第35-36页 |
1.5 系统进化树的构建 | 第36页 |
1.6 准种复杂性及多样性指标的计算 | 第36页 |
1.7 统计学分析 | 第36-37页 |
2 结果 | 第37-52页 |
2.1 研究对象人口学及基线信息 | 第37-38页 |
2.2 HBVX基因区巢式PCR扩增结果 | 第38页 |
2.3 HBVX基因区二代测序结果 | 第38-39页 |
2.4 TA克隆及Sanger测序结果 | 第39页 |
2.5 NGS及CBS两种方法获得的合格准种数量比较 | 第39-40页 |
2.6 两种方法获得的准种复杂度值比较和差异性比较 | 第40页 |
2.7 两种方法获得的HBVX区变异位点比较 | 第40-42页 |
2.8 HBVX基因变异位点在肝癌病程进展中的变化 | 第42-44页 |
2.9 NGS和CBS两种方法发现的插入突变比较 | 第44-45页 |
2.10 HBVX区准种及其进化树分析 | 第45-49页 |
2.11 优势株序列比对情况 | 第49-52页 |
3 讨论 | 第52-56页 |
4 结论 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-64页 |
附录 | 第64-66页 |
文献综述 | 第66-79页 |
参考文献 | 第73-79页 |
致谢 | 第79-81页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第81页 |