| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 缩略词表 | 第16-17页 |
| 1 前言 | 第17-41页 |
| 1.1 植物分枝角度研究 | 第17-27页 |
| 1.1.1 分枝角度对作物生产的影响 | 第17-18页 |
| 1.1.2 分枝角度调控机理研究 | 第18-21页 |
| 1.1.2.1 重力反应过程 | 第18-19页 |
| 1.1.2.2 分枝角度调控的GSA模型 | 第19-21页 |
| 1.1.3 分枝角度的遗传调控 | 第21-25页 |
| 1.1.3.1 重力感受及信号转导阶段对分枝角度的调控 | 第21-22页 |
| 1.1.3.2 重力感受后生长素梯度形成前对分枝角度的调控 | 第22-23页 |
| 1.1.3.3 生长素梯度形成阶段对分枝角度的调控 | 第23-24页 |
| 1.1.3.4 其他途径对分枝角度的调控 | 第24-25页 |
| 1.1.4 油菜分枝角度研究进展 | 第25-27页 |
| 1.1.4.1 油菜分枝角度的遗传分析 | 第25-26页 |
| 1.1.4.2 油菜分枝角度的全基因组定位和转录组研究 | 第26-27页 |
| 1.2 植物倒伏研究进展 | 第27-40页 |
| 1.2.1 倒伏及其对作物生产的影响 | 第27-29页 |
| 1.2.1.1 倒伏概念及其分类 | 第27页 |
| 1.2.1.2 倒伏对作物生产的影响 | 第27-29页 |
| 1.2.2 株高及茎秆机械强度对倒伏的影响 | 第29-30页 |
| 1.2.3 植物抗倒伏的基因研究 | 第30-38页 |
| 1.2.3.1 纤维素合成途径的基因调控 | 第30-32页 |
| 1.2.3.2 木质素合成途径的基因调控 | 第32-34页 |
| 1.2.3.3 木聚糖合成和乙酰化途径以及果胶代谢途径的基因调控 | 第34-36页 |
| 1.2.3.4 转录调控途径 | 第36-38页 |
| 1.2.4 油菜抗倒伏研究进展 | 第38-40页 |
| 1.2.4.1 油菜抗倒伏的遗传分析 | 第39页 |
| 1.2.4.2 油菜抗倒伏的全基因组定位 | 第39-40页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第40-41页 |
| 2 甘蓝型油菜分枝角度的遗传分析 | 第41-50页 |
| 2.1 引言 | 第41页 |
| 2.2 材料与方法 | 第41-43页 |
| 2.2.1 试验材料和田间试验 | 第41-42页 |
| 2.2.2 分枝角度性状鉴定 | 第42页 |
| 2.2.3 数据统计和遗传分析 | 第42-43页 |
| 2.3 结果与分析 | 第43-48页 |
| 2.3.1 分枝角度表型变异分析 | 第43-45页 |
| 2.3.2 遗传模型的选择 | 第45页 |
| 2.3.3 遗传模型的适合性检验 | 第45-47页 |
| 2.3.4 遗传参数估计 | 第47-48页 |
| 2.4 讨论 | 第48-50页 |
| 3 甘蓝型油菜分枝角度的全基因组关联分析 | 第50-73页 |
| 3.1 引言 | 第50-51页 |
| 3.2 材料与方法 | 第51-55页 |
| 3.2.1 试验材料和田间试验 | 第51页 |
| 3.2.2 性状测量和统计分析 | 第51-52页 |
| 3.2.3 基因型数据分析 | 第52页 |
| 3.2.4 群体结构、系统进化树、主成分和亲缘关系分析 | 第52-53页 |
| 3.2.5 单倍型块结构分析 | 第53页 |
| 3.2.6 全基因组关联分析 | 第53-54页 |
| 3.2.7 候选基因鉴定 | 第54页 |
| 3.2.8 qRT-PCR验证 | 第54-55页 |
| 3.3 结果与分析 | 第55-69页 |
| 3.3.1 单株不同分枝部位的角度变异 | 第55-57页 |
| 3.3.2 关联作图群体的分枝角度变异 | 第57-58页 |
| 3.3.3 群体结构、NJ进化树、PCA和亲缘关系分析 | 第58-60页 |
| 3.3.4 单倍型块分析 | 第60-61页 |
| 3.3.5 全基因组关联分析 | 第61-64页 |
| 3.3.6 候选基因鉴定 | 第64-67页 |
| 3.3.7 候选基因qRT-PCR验证 | 第67-68页 |
| 3.3.8 与前人研究结果的比较 | 第68-69页 |
| 3.4 讨论 | 第69-73页 |
| 3.4.1 MLM方法下的阈值设定 | 第69页 |
| 3.4.2 MRMLM方法的选择 | 第69-70页 |
| 3.4.3 关联作物群体的群体结构 | 第70页 |
| 3.4.4 单倍型块结构分析 | 第70-71页 |
| 3.4.5 分枝角度性状的遗传 | 第71页 |
| 3.4.6 分枝角度的遗传调控 | 第71-73页 |
| 4 甘蓝型油菜分枝角度差异材料的转录组分析 | 第73-84页 |
| 4.1 引言 | 第73页 |
| 4.2 材料与方法 | 第73-75页 |
| 4.2.1 试验材料 | 第73-74页 |
| 4.2.2 RNA质量检测、文库构建和高通量测序 | 第74页 |
| 4.2.3 测序数据的分析 | 第74-75页 |
| 4.3 结果与分析 | 第75-79页 |
| 4.3.1 RNA质量和测序数据分析 | 第75页 |
| 4.3.2 差异表达基因分析 | 第75-78页 |
| 4.3.3 结合GWAS共同鉴定候选基因 | 第78-79页 |
| 4.4 讨论 | 第79-84页 |
| 4.4.1 分枝角度差异材料间的协同表达基因 | 第79-80页 |
| 4.4.2 分枝背地侧和近地侧间的协同表达基因 | 第80-81页 |
| 4.4.3 联合GWAS和RNA-seq共同鉴定候选基因 | 第81-82页 |
| 4.4.4 甘蓝型油菜分枝角度调控网络 | 第82-84页 |
| 5 甘蓝型油菜茎秆抗折力的遗传分析 | 第84-94页 |
| 5.1 引言 | 第84-85页 |
| 5.2 材料与方法 | 第85-86页 |
| 5.2.1 试验材料和田间试验 | 第85页 |
| 5.2.2 茎秆抗折力性状鉴定 | 第85页 |
| 5.2.3 数据统计和遗传分析 | 第85-86页 |
| 5.3 结果与分析 | 第86-92页 |
| 5.3.1 茎秆抗折力表型变异分析 | 第86-87页 |
| 5.3.2 遗传模型的选择 | 第87-88页 |
| 5.3.3 遗传模型的适合性检验 | 第88-90页 |
| 5.3.4 遗传参数估计 | 第90-92页 |
| 5.4 讨论 | 第92-94页 |
| 5.4.1 甘蓝型油菜抗倒伏指标的选取 | 第92页 |
| 5.4.2 甘蓝型油菜抗倒伏性状的遗传 | 第92-94页 |
| 6 甘蓝型油菜茎秆倒伏性状的全基因组关联分析 | 第94-112页 |
| 6.1 引言 | 第94页 |
| 6.2 材料与方法 | 第94-96页 |
| 6.2.1 试验材料和田间试验 | 第94-95页 |
| 6.2.2 性状测量和统计分析 | 第95页 |
| 6.2.3 基因型数据分析 | 第95页 |
| 6.2.4 群体结构、系统进化树、主成分和亲缘关系分析 | 第95页 |
| 6.2.5 全基因组关联分析 | 第95-96页 |
| 6.2.6 候选基因鉴定 | 第96页 |
| 6.3 结果与分析 | 第96-110页 |
| 6.3.1 关联作图群体的表型变异 | 第96-99页 |
| 6.3.2 性状间的相关性分析 | 第99-100页 |
| 6.3.3 全基因组关联分析 | 第100-106页 |
| 6.3.4 候选基因鉴定 | 第106-110页 |
| 6.4 讨论 | 第110-112页 |
| 6.4.1 分析模型选择 | 第110页 |
| 6.4.2 茎秆倒伏调控 | 第110-112页 |
| 7 甘蓝型油菜茎秆抗折力差异材料的转录组分析 | 第112-125页 |
| 7.1 引言 | 第112页 |
| 7.2 材料与方法 | 第112-114页 |
| 7.2.1 试验材料 | 第112-113页 |
| 7.2.2 RNA质量检测、文库构建和高通量测序 | 第113页 |
| 7.2.3 测序数据的分析 | 第113页 |
| 7.2.4 基因共表达网络构建 | 第113页 |
| 7.2.5 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第113-114页 |
| 7.3 结果与分析 | 第114-122页 |
| 7.3.1 RNA质量和测序数据分析 | 第114页 |
| 7.3.2 差异表达基因分析 | 第114-117页 |
| 7.3.3 基因共表达网络构建和分析 | 第117页 |
| 7.3.4 ‘绿色’模块分析 | 第117-121页 |
| 7.3.5 联合RNA-Seq、WGCNA和GWAS共同鉴定候选基因 | 第121页 |
| 7.3.6 DEG的qRT-PCR验证 | 第121-122页 |
| 7.4 讨论 | 第122-125页 |
| 7.4.1 差异表达基因在花期和角果期的协同表达 | 第122-123页 |
| 7.4.2 联合GWAS、RNA-Seq和WGCNA共同鉴定候选基因 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-151页 |
| 附录Ⅰ | 第151-152页 |
| 附录Ⅱ | 第152-158页 |
| 附录Ⅲ | 第158-159页 |
| 致谢 | 第159-161页 |
