| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 根结线虫概述 | 第13-15页 |
| 1.1.1 根结线虫的分类地位及分布 | 第13页 |
| 1.1.2 根结线虫的形态特征 | 第13页 |
| 1.1.3 根结线虫的生活史 | 第13-14页 |
| 1.1.4 根结线虫的危害 | 第14-15页 |
| 1.2 根结线虫的防治方法 | 第15-16页 |
| 1.2.1 物理防治 | 第15页 |
| 1.2.2 化学防治 | 第15页 |
| 1.2.3 生物防治 | 第15-16页 |
| 1.2.4 抗线虫育种 | 第16页 |
| 1.3 植物对病原菌的免疫防卫反应 | 第16-18页 |
| 1.3.1 植物抵抗病原菌侵染的基础抗性(PTI) | 第17页 |
| 1.3.2 由效应子激发的植物免疫反应(ETI) | 第17-18页 |
| 1.4 植物寄生线虫效应子研究现状 | 第18-20页 |
| 1.4.1 根结线虫效应子研究进展 | 第18-19页 |
| 1.4.2 C型凝集素(C-type lectin)效应子 | 第19-20页 |
| 1.5 辣椒抗线虫基因研究 | 第20页 |
| 1.6 研究背景及目的意义 | 第20-23页 |
| 1.6.1 科学问题的提出 | 第21页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第21-22页 |
| 1.6.3 技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 南方根结线虫特异效应子的功能鉴定--研究方法 | 第23-49页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-25页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第23页 |
| 2.1.2 主要生化试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.3 菌株及载体 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-49页 |
| 2.2.1 南方根结线虫非毒性群体、Me3毒性群体近等基因系的构建 | 第25页 |
| 2.2.2 南方根结线虫总RNA提取 | 第25页 |
| 2.2.3 第一链cDNA合成 | 第25-26页 |
| 2.2.4 测序及数据分析 | 第26-27页 |
| 2.2.5 差异表达基因qRT-PCR验证 | 第27-28页 |
| 2.2.6 与寄主互作条件下,差异表达基因在不同侵染时期的表达模式 | 第28页 |
| 2.2.7 组织原位杂交 | 第28-30页 |
| 2.2.8 候选基因序列鉴定及克隆 | 第30-32页 |
| 2.2.9 PVX表达系统检测候选效应子免疫抑制作用 | 第32-35页 |
| 2.2.10 亚细胞定位 | 第35-36页 |
| 2.2.11 谷枯菌系统检测候选效应子免疫抑制作用 | 第36-37页 |
| 2.2.12 烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)介导的基因沉默(VIGS) | 第37-39页 |
| 2.2.13 酵母系统分泌实验 | 第39-41页 |
| 2.2.14 稻瘟菌系统鉴定分泌特性 | 第41-43页 |
| 2.2.15 拟南芥超表达实验 | 第43-45页 |
| 2.2.16 拟南芥系统RNAi干扰实验 | 第45-46页 |
| 2.2.17 候选效应子与辣椒抗线虫基因互作 | 第46-49页 |
| 第三章 南方根结线虫非毒性、Me3毒性种群特异效应子的筛选 | 第49-59页 |
| 3.1 南方根结线虫非毒性、Me3毒性线虫总RNA提取 | 第49页 |
| 3.2 转录组测序、组装与功能注释 | 第49-50页 |
| 3.3 差异表达基因预测 | 第50页 |
| 3.4 差异表达基因的功能分类 | 第50-52页 |
| 3.5 差异表达基因的KEGG通路分析 | 第52-54页 |
| 3.6 结构域家族(Pfam)分析 | 第54-55页 |
| 3.7 分泌蛋白预测 | 第55-56页 |
| 3.8 部分差异表达基因的验证 | 第56-58页 |
| 3.9 小结 | 第58-59页 |
| 3.9.1 南方根结线虫非毒性、Me3毒性群体转录组测序分析 | 第58页 |
| 3.9.2 差异表达基因的功能分类 | 第58页 |
| 3.9.3 分泌蛋白的预测及候选效应子的筛选 | 第58-59页 |
| 第四章 南方根结线虫Me3毒性种群特异效应子的功能鉴定 | 第59-67页 |
| 4.1 前期研究基础 | 第59页 |
| 4.2 Minc03867、Minc11785序列分析 | 第59页 |
| 4.3 Minc03867、Minc11785定位于烟草细胞膜 | 第59-60页 |
| 4.4 Minc03867、Minc11785的分泌特性 | 第60-65页 |
| 4.4.1 Minc03867、Minc11785效应子不能通过谷枯菌系统分泌 | 第60-61页 |
| 4.4.2 Minc03867、Minc11785的信号肽能够被酵母系统识别并分泌 | 第61-62页 |
| 4.4.3 Minc11785能够通过稻瘟菌系统分泌进入植物细胞 | 第62-63页 |
| 4.4.4 Minc03867、Minc11785的VIGS效应 | 第63-64页 |
| 4.4.5 Minc03867能够增加转基因拟南芥的感病性 | 第64-65页 |
| 4.5 小结与讨论 | 第65-67页 |
| 4.5.1 Minc03867功能分析 | 第65页 |
| 4.5.2 Minc11785功能分析 | 第65-66页 |
| 4.5.3 下一步研究计划 | 第66-67页 |
| 第五章 南方根结线虫非毒性种群特异效应子的功能鉴定 | 第67-82页 |
| 5.1 非毒性线虫特异效应子的克隆 | 第67-68页 |
| 5.2 烟草瞬时表达系统检测候选效应子的免疫抑制作用 | 第68-69页 |
| 5.3 Minc10750能够引起抗性辣椒HDA149产生HR反应 | 第69-70页 |
| 5.4 Minc10750序列分析 | 第70页 |
| 5.5 Minc10750进化分析 | 第70-72页 |
| 5.6 Minc10750在南方根结线虫的亚腹食道腺中特异表达 | 第72页 |
| 5.7 Minc10750亚细胞定位在烟草细胞膜 | 第72-73页 |
| 5.8 Minc10750在侵染初期上调表达 | 第73-74页 |
| 5.9 Minc10750基因沉默能够增加非毒性线虫对抗病辣椒HDA149的侵染能力 | 第74-75页 |
| 5.10 Minc10750功能验证 | 第75-81页 |
| 5.10.1 辣椒抗线虫基因Me3候选基因的预测 | 第75-79页 |
| 5.10.2 Me3候选基因表达载体构建 | 第79-80页 |
| 5.10.3 Minc10750与Capana09g000163和Capana09g000164候选基因的互作 | 第80-81页 |
| 5.11 小结与讨论 | 第81-82页 |
| 5.11.1 Minc10750功能分析 | 第81页 |
| 5.11.2 下一步研究计划 | 第81-82页 |
| 第六章 植物内生真菌交枝顶孢Clock-controlled Protein生防机理研究 | 第82-97页 |
| 前言 | 第82-83页 |
| 6.1 实验材料及试剂 | 第83-84页 |
| 6.1.1 供试材料 | 第83页 |
| 6.1.2 主要生化试剂 | 第83-84页 |
| 6.1.3 菌株及载体 | 第84页 |
| 6.2 实验方法 | 第84-89页 |
| 6.2.1 盆栽试验 | 第84页 |
| 6.2.2 发酵液、提取液杀线虫活性测定 | 第84-85页 |
| 6.2.3 ACR-02291基因敲除突变体构建 | 第85-88页 |
| 6.2.4 番茄分根实验 | 第88页 |
| 6.2.5 ACR-02291基因拟南芥超表达 | 第88-89页 |
| 6.2.6 本研究所用引物信息 | 第89页 |
| 6.3 结果与分析 | 第89-95页 |
| 6.3.1 交枝顶孢菌(A. implicatum)对南方根结线虫的防治效果 | 第89-90页 |
| 6.3.2 交枝顶孢菌(A. implicatum)发酵液、提取液对南方根结线虫的作用 | 第90-91页 |
| 6.3.3 交枝顶孢菌(A. implicatum)分泌蛋白预测 | 第91-92页 |
| 6.3.4 Clock-controlled Protein ACR-02291序列分析 | 第92-93页 |
| 6.3.5 ACR-02291基因敲除突变体的构建 | 第93页 |
| 6.3.6 交枝顶孢Clock-controlled protein能够诱导番茄产生系统抗性 | 第93-95页 |
| 6.3.7 ACR-02291基因拟南芥超表达载体构建 | 第95页 |
| 6.4 小结与讨论 | 第95-97页 |
| 6.4.1 交枝顶孢菌(A. implicatum)对南方根结线虫的生防效果 | 第95页 |
| 6.4.2 交枝顶孢分泌蛋白预测及生防因子的发掘 | 第95-96页 |
| 6.3.3 Clock-controlled protein ACR-02291功能分析 | 第96页 |
| 6.4.4 下一步研究计划 | 第96-97页 |
| 第七章 全文结论 | 第97-99页 |
| 参考文献 | 第99-106页 |
| 附录1 本研究所用引物信息 | 第106-110页 |
| 附录2 主要培养基及生化试剂配制 | 第110-112页 |
| 致谢 | 第112-113页 |
| 作者简介 | 第113页 |
