| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 0 引言 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-33页 |
| 1.1 养殖环境氮循环 | 第13-14页 |
| 1.1.1 养殖环境氮的生物地球化学特征 | 第13页 |
| 1.1.2 养殖环境氮循环 | 第13-14页 |
| 1.2 养殖环境氨氮失衡 | 第14-18页 |
| 1.2.1 养殖环境氨氮失衡 | 第14-16页 |
| 1.2.2 养殖环境氨氮处理方法 | 第16-18页 |
| 1.3 厌氧氨氧化细菌研究进展 | 第18-32页 |
| 1.3.1 厌氧氨氧化细菌的发现和分类研究 | 第18-21页 |
| 1.3.2 厌氧氨氧化细菌探测方法研究现状 | 第21-28页 |
| 1.3.3 厌氧氨氧化细菌菌群结构、多样性和定量研究进展 | 第28-32页 |
| 1.4 课题研究背景和意义 | 第32-33页 |
| 2 实验材料和方法 | 第33-49页 |
| 2.1 实验材料 | 第33-38页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第33-34页 |
| 2.1.2 环境因子测定 | 第34-35页 |
| 2.1.3 实验主要生物学试剂盒 | 第35页 |
| 2.1.4 实验主要培养基 | 第35页 |
| 2.1.5 实验主要仪器 | 第35-37页 |
| 2.1.6 实验主要试剂 | 第37页 |
| 2.1.7 实验主要引物 | 第37-38页 |
| 2.2 实验方法 | 第38-49页 |
| 2.2.1 沉积物中宏基因组的提取 | 第38-39页 |
| 2.2.2 hzo 基因序列的 PCR 扩增 | 第39-40页 |
| 2.2.3 hzo 基因 PCR 扩增产物的乙醇沉淀 | 第40页 |
| 2.2.4 hzo 基因切胶纯化 | 第40-42页 |
| 2.2.5 连接转化 | 第42-43页 |
| 2.2.6 克隆的 PCR 扩增 | 第43-44页 |
| 2.2.7 PCR 扩增产物的限制性酶酶切反应及分析 | 第44-45页 |
| 2.2.8 测序及保种 | 第45页 |
| 2.2.9 hzo 基因荧光实时定量 PCR | 第45-47页 |
| 2.2.10 hzo 基因序列分析 | 第47-49页 |
| 3 实验结果 | 第49-71页 |
| 3.1 养殖区沉积物样品环境因子测定结果及分析 | 第49-54页 |
| 3.1.1 养殖区沉积物样品及间隙水环境因子测定结果 | 第49-53页 |
| 3.1.2 养殖区沉积物样品及间隙水环境因子聚类分析 | 第53-54页 |
| 3.2 厌氧氨氧化细菌 hzo 基因文库的构建及分析 | 第54-58页 |
| 3.2.1 F2 站位宏基因组的提取 | 第54页 |
| 3.2.2 F2 站位 hzo 基因梯度和平行 PCR 扩增 | 第54-55页 |
| 3.2.3 F2 站位 hzo 基因切胶纯化 | 第55-56页 |
| 3.2.4 F2 站位 hzo 基因连接转化 | 第56页 |
| 3.2.5 F2 站位 hzo 基因克隆 PCR 扩增 | 第56页 |
| 3.2.6 F2 站位 hzo 基因限制性酶酶切反应及分析 | 第56-58页 |
| 3.2.7 F2 站位 hzo 基因的测序和保种 | 第58页 |
| 3.3 厌氧氨氧化细菌 hzo 基因序列分析 | 第58-67页 |
| 3.3.1 hzo 基因百分覆盖率和稀释曲线分析 | 第58-60页 |
| 3.3.2 hzo 基因多样性指数分析 | 第60-61页 |
| 3.3.3 hzo 基因 Unifrac 聚类分析 | 第61-62页 |
| 3.3.4 hzo 基因的系统发育分析 | 第62-67页 |
| 3.4 厌氧氨氧化细菌 hzo 基因荧光实时定量 PCR 及分析 | 第67-71页 |
| 3.4.1 hzo 基因 qPCR 标准曲线构建 | 第67页 |
| 3.4.2 hzo 基因 qPCR 结果分析 | 第67-70页 |
| 3.4.3 hzo 基因丰度与环境因子相关性分析 | 第70-71页 |
| 4 结论 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 个人简历 | 第83-84页 |
