| 致谢 | 第8-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第13-29页 |
| 1.1 环状RNA简介 | 第13-21页 |
| 1.1.1 环状RNA的定义和再发现 | 第13-14页 |
| 1.1.2 环状RNA的特征 | 第14-15页 |
| 1.1.3 环状RNA的形成机制 | 第15-18页 |
| 1.1.4 环状RNA的功能和分子机制 | 第18-21页 |
| 1.2 环状RNA的生物信息学预测方法简介 | 第21-28页 |
| 1.2.1 环状RNA预测所遇到的挑战和困难 | 第21-24页 |
| 1.2.2 环状RNA的预测方法 | 第24-27页 |
| 1.2.3 环状RNA方面的数据库 | 第27-28页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第28-29页 |
| 2 植物环状RNA大规模鉴定与分析 | 第29-42页 |
| 2.1 实验材料与数据 | 第29-30页 |
| 2.1.1 实验的材料 | 第29-30页 |
| 2.1.2 实验的数据 | 第30页 |
| 2.2 实验方法 | 第30-31页 |
| 2.2.1 计算鉴定环状RNA的方法 | 第30页 |
| 2.2.2 环状RNA的实验验证 | 第30-31页 |
| 2.2.3 序列分析 | 第31页 |
| 2.2.4 表达分析 | 第31页 |
| 2.3 结果和分析 | 第31-40页 |
| 2.3.1 植物中环状RNA的鉴定 | 第31-35页 |
| 2.3.2 植物中环状RNA的保守性 | 第35-36页 |
| 2.3.3 植物中环状RNA两端内含子的序列特征 | 第36-38页 |
| 2.3.4 植物中环状RNA的表达特征 | 第38-40页 |
| 2.4 小结和讨论 | 第40-42页 |
| 3 植物外显子类型环状RNA预测方法的研发 | 第42-53页 |
| 3.1 PcircRNA_finder：预测植物外显子类型环状RNA | 第42-46页 |
| 3.2 模拟数据预测结果的比较 | 第46-47页 |
| 3.3 真实数据预测结果的比较 | 第47-51页 |
| 3.4 小结和讨论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 附件 | 第57-64页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第64页 |