| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 大麦特性及其旗叶性状研究进展 | 第12-14页 |
| 1.1.1 大麦物种及其特性 | 第12页 |
| 1.1.2 大麦旗叶重要性状国内外研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2 DNA分子标记的类型及应用研究 | 第14-17页 |
| 1.2.1 基于Southern杂交技术的分子标记 | 第14-15页 |
| 1.2.2 基于DNA聚合酶链式反应的分子标记 | 第15-16页 |
| 1.2.3 基于PCR与限制性酶切技术相结合的分子标记 | 第16页 |
| 1.2.4 基于单核苷酸多态性的分子标记 | 第16-17页 |
| 1.3 简化基因组测序技术的概括及其应用进展 | 第17-21页 |
| 1.3.1 简化基因组测序的原理、分类及其特点 | 第17-18页 |
| 1.3.2 RAD-seq技术的研究进展及其在分子育种中的应用 | 第18-21页 |
| 1.3.2.1 RAD-seq技术在高密度图谱构建上的应用 | 第18-19页 |
| 1.3.2.2 RAD-seq技术在动植物重要性状QTL定位上的应用 | 第19-20页 |
| 1.3.2.3 RAD-seq技术在群体遗传多样性上的应用 | 第20页 |
| 1.3.2.4 RAD-seq技术在分子标记开发和基因分型上的应用 | 第20-21页 |
| 1.4 遗传连锁图谱构建 | 第21-23页 |
| 1.4.1 亲本的选配 | 第21页 |
| 1.4.2 群体的类型 | 第21-22页 |
| 1.4.3 群体的大小 | 第22-23页 |
| 1.5 QTL定位软件 | 第23-24页 |
| 1.5.1 Windows QTL Cartographer | 第23页 |
| 1.5.2 QTL IciMapping | 第23页 |
| 1.5.3 QTLNetwork | 第23-24页 |
| 1.5.4 MapQTL | 第24页 |
| 1.6 大麦遗传连锁图谱构建进展 | 第24-26页 |
| 1.7 本论文研究的意义及其重要内容 | 第26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-38页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-31页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第27页 |
| 2.2.2 RAD文库的构建与测序 | 第27-30页 |
| 2.2.2.1 酶切基因组DNA及连接P1接头 | 第28页 |
| 2.2.2.2 样品混合及DNA片段化 | 第28页 |
| 2.2.2.3 末端加A修复及连接P2接头 | 第28-29页 |
| 2.2.2.4 富集DNA片段并测序 | 第29页 |
| 2.2.2.5 数据过滤及基因组比对 | 第29页 |
| 2.2.2.6 SNP标记的挖掘及基因分型 | 第29-30页 |
| 2.2.3 遗传连锁图谱的构建 | 第30页 |
| 2.2.4 SNP标记的偏分离分析 | 第30页 |
| 2.2.5 SNP与SSR标记遗传连锁图谱的整合 | 第30-31页 |
| 2.3 大麦遗传连锁图谱的构建 | 第31-36页 |
| 2.3.1 RAD测序与SNP标记统计分析 | 第31-32页 |
| 2.3.2 比对基因组结果及深度统计 | 第32页 |
| 2.3.3 染色体偏分离标记分布情况 | 第32-33页 |
| 2.3.4 大麦高密度遗传整合图谱的构建 | 第33-35页 |
| 2.3.5 三种遗传图谱比较 | 第35-36页 |
| 2.4 生理与形态性状测定 | 第36-37页 |
| 2.4.1 光合性状的测定 | 第36页 |
| 2.4.2 相对含水量的测定 | 第36-37页 |
| 2.4.3 相对叶绿素含量的测定 | 第37页 |
| 2.4.4 叶片含氮量的测定 | 第37页 |
| 2.4.5 形态性状的测定 | 第37页 |
| 2.5 生理和形态性状数据分析 | 第37-38页 |
| 2.5.1 数据统计及相关分析 | 第37-38页 |
| 2.5.2 性状数据QTL分析 | 第38页 |
| 2.5.3 QTL命名 | 第38页 |
| 3 QTL定位结果与分析 | 第38-59页 |
| 3.1 双亲及DH群体的表型分析 | 第38-42页 |
| 3.2 性状间的相关分析 | 第42-43页 |
| 3.3 基于SSR框架遗传图谱的QTL定位分析 | 第43-48页 |
| 3.3.1 净光合速率QTL分析 | 第43-44页 |
| 3.3.2 气孔导度QTL分析 | 第44页 |
| 3.3.3 胞间二氧化碳浓度QTL分析 | 第44页 |
| 3.3.4 蒸腾速率QTL分析 | 第44页 |
| 3.3.5 叶面积QTL分析 | 第44-45页 |
| 3.3.6 叶长QTL分析 | 第45页 |
| 3.3.7 叶宽QTL分析 | 第45页 |
| 3.3.8 相对含水量QTL分析 | 第45页 |
| 3.3.9 相对叶绿素含量QTL分析 | 第45-46页 |
| 3.3.10 叶片含氮量QTL分析 | 第46-48页 |
| 3.4 基于SNP + SSR高密度遗传整合图谱的QTL定位分析 | 第48-59页 |
| 3.4.1 净光合速率QTL分析 | 第49页 |
| 3.4.2 气孔导度QTL分析 | 第49页 |
| 3.4.3 胞间二氧化碳浓度QTL分析 | 第49-50页 |
| 3.4.4 蒸腾速率QTL分析 | 第50页 |
| 3.4.5 叶面积QTL分析 | 第50-56页 |
| 3.4.6 叶长QTL分析 | 第56-57页 |
| 3.4.7 叶宽QTL分析 | 第57页 |
| 3.4.8 相对含水量QTL分析 | 第57-58页 |
| 3.4.9 相对叶绿素含量QTL分析 | 第58页 |
| 3.4.10 叶片含氮量QTL分析 | 第58-59页 |
| 4 讨论 | 第59-68页 |
| 4.1 利用简化基因组RAD-seq技术策略开发SNP标记的优势 | 第59-60页 |
| 4.2 大麦高密度遗传整合图谱 | 第60-61页 |
| 4.3 大麦遗传图谱偏分离现象分析 | 第61-62页 |
| 4.4 DH群体生理与形态性状的遗传变异 | 第62-63页 |
| 4.5 生理与形态性状的QTL分析 | 第63-68页 |
| 4.5.1 生理与形态QTL统计与比较 | 第63-66页 |
| 4.5.2 不同性状QTL聚集现象 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-83页 |
| 附录 | 第83-100页 |
| 致谢 | 第100-102页 |
