| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 第一章 我国淡水龟鳖种质资源与研究进展 | 第16-31页 |
| 一、我国龟鳖类的资源状况 | 第16-20页 |
| 1. 平胸龟科(Platysternidae) | 第16-17页 |
| 2. 潮龟科(Geoemydidae) | 第17-19页 |
| 3. 鳖科(Trionychidae) | 第19-20页 |
| 二、龟鳖类种质资源研究现状 | 第20-25页 |
| 1. 无效种的确定 | 第21页 |
| 2. 平胸龟分类地位 | 第21-23页 |
| 3. 黄喉拟水龟与安南龟分类研究现状 | 第23-24页 |
| 4. 三线闭壳龟分类研究 | 第24-25页 |
| 三、龟鳖类种质资源研究方法 | 第25-31页 |
| 1.形态分析 | 第25-26页 |
| 2.DNA多态性分析 | 第26-31页 |
| 第二章 黄喉拟水龟各种群的形态变异分析 | 第31-41页 |
| 1.前言 | 第31-32页 |
| 2.材料与方法 | 第32-33页 |
| 3.结果 | 第33-39页 |
| 4.讨论 | 第39-41页 |
| 第三章 基于微卫星分子标记的黄喉拟水龟不同种群遗传多样性分析 | 第41-49页 |
| 1.引言 | 第41-42页 |
| 2.材料与方法 | 第42-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第42页 |
| 2.2 微卫星标记开发 | 第42-43页 |
| 2.3 微卫星引物扩增 | 第43-44页 |
| 2.4 微卫星数据分析 | 第44页 |
| 3.结果 | 第44-47页 |
| 3.1 微卫星引物筛选 | 第44-45页 |
| 3.2 黄喉拟水龟4个种群的微卫星遗传多样性 | 第45-47页 |
| 4.讨论 | 第47-49页 |
| 第四章 基于线粒体和核基因保守序列对黄喉拟水龟与安南龟的遗传关系研究 36 | 第49-61页 |
| 1.引言 | 第49-50页 |
| 2.材料与方法 | 第50-52页 |
| 3.结果 | 第52-55页 |
| 4.讨论 | 第55-61页 |
| 4.1 线粒体与核基因碱基多态性的特点 | 第55页 |
| 4.2 DNA条形码基因对黄喉拟水龟与安南龟的鉴定 | 第55-56页 |
| 4.3 安南龟的分类地位 | 第56-61页 |
| 第五章 黄喉拟水龟及安南龟线粒体全序列测定及进化分析 | 第61-75页 |
| 1.引言 | 第61-62页 |
| 2.材料与方法 | 第62-65页 |
| 2.1 实验材料 | 第62页 |
| 2.2 线粒体全序列测定 | 第62-63页 |
| 2.3 线粒体全序列重测序 | 第63-65页 |
| 3.结果 | 第65-72页 |
| 3.1 黄喉拟水龟三个种群及安南龟线粒体全序列特征 | 第65-68页 |
| 3.2 基于线粒体全序列的近缘种进化分析 | 第68-71页 |
| 3.3 线粒体DNA重测序 | 第71-72页 |
| 4.讨论 | 第72-75页 |
| 第六章 基于简化基因组测序分析黄喉拟水龟各种群与安南龟的关系 | 第75-84页 |
| 1.引言 | 第75-76页 |
| 2.材料与方法 | 第76-77页 |
| 2.1 实验材料 | 第76页 |
| 2.2 文库构建与测序 | 第76页 |
| 2.3 测序片断的从头组装 | 第76-77页 |
| 2.4 组装片断的功能注释 | 第77页 |
| 2.5 SNP鉴定与进化分析 | 第77页 |
| 2.6 微卫星分子标记筛选与验证 | 第77页 |
| 3.结果 | 第77-82页 |
| 3.1 测序片断与从头组装 | 第77-78页 |
| 3.2 片断功能注释 | 第78-79页 |
| 3.3 SNP鉴定和进化分析 | 第79-81页 |
| 3.4 微卫星标记验证 | 第81-82页 |
| 4.讨论 | 第82-84页 |
| 第七章 黄喉拟水龟雌雄个体脑-性腺转录组测序与分析 | 第84-93页 |
| 1.引言 | 第84-85页 |
| 2.材料与方法 | 第85-86页 |
| 2.1 实验样品及总RNA提取 | 第85页 |
| 2.2 文库构建、库检及测序 | 第85页 |
| 2.3 数据分析 | 第85-86页 |
| 3.结果 | 第86-91页 |
| 3.1 转录组组装 | 第86-87页 |
| 3.2 基因注释 | 第87-88页 |
| 3.3 雌雄个体基因表达差异 | 第88-90页 |
| 3.4 SNP标记鉴定 | 第90页 |
| 3.5 微卫星标记鉴定 | 第90-91页 |
| 3.6 与繁殖活动相关的基因与分子标记 | 第91页 |
| 4.讨论 | 第91-93页 |
| 全文总结 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-110页 |
| 读博期间研究成果 | 第110-112页 |
| 本研究课题来源 | 第112-113页 |
| 致谢 | 第113页 |
