| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-19页 |
| 1.1 水稻转录组测序及功能标记开发 | 第11-13页 |
| 1.1.1 高通量测序技术的比较 | 第11-12页 |
| 1.1.2 功能标记的开发应用 | 第12-13页 |
| 1.2 水稻种子休眠研究进展 | 第13-15页 |
| 1.2.1 影响水稻种子休眠的因素 | 第13-14页 |
| 1.2.2 水稻种子休眠性QTL研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3 稻米品质遗传研究进展 | 第15-17页 |
| 1.3.1 稻米品质评价标准 | 第15-16页 |
| 1.3.2 稻米品质QTL研究进展 | 第16-17页 |
| 1.4 水稻重要农艺性状QTL研究进展 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-24页 |
| 2.1 试验材料及田间种植 | 第19页 |
| 2.1.1 重组自交系 | 第19页 |
| 2.1.2 田间种植 | 第19页 |
| 2.2 遗传连锁图谱 | 第19-22页 |
| 2.2.1 RNA-Seq及数据分析 | 第19页 |
| 2.2.2 水稻DNA提取及PCR反应 | 第19-20页 |
| 2.2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）检测 | 第20-21页 |
| 2.2.4 Indel标记的开发及RILs基因型鉴定 | 第21-22页 |
| 2.2.5 QTL Ici Mapping 4.0 作图 | 第22页 |
| 2.3 RILs性状的考察及数据处理 | 第22-23页 |
| 2.3.1 种子休眠 | 第22页 |
| 2.3.2 稻米加工及外观品质性状考察 | 第22-23页 |
| 2.3.3 重要农艺性状考察 | 第23页 |
| 2.4 主效性QTL分析 | 第23-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-46页 |
| 3.1 水稻Indel标记开发及遗传连锁图谱构建 | 第24-29页 |
| 3.1.1 水稻Indel标记开发 | 第24-27页 |
| 3.1.2 遗传连锁图谱构建 | 第27-28页 |
| 3.1.3 标记偏分离 | 第28-29页 |
| 3.2 种子休眠性QTL分析 | 第29-32页 |
| 3.2.1 种子发芽试验 | 第29-31页 |
| 3.2.2 种子休眠性QTL结果分析 | 第31-32页 |
| 3.3 稻米品质相关性状间相关性分析 | 第32页 |
| 3.4 稻米品质QTL分析 | 第32-36页 |
| 3.4.1 亲本及RILs群体稻米品质性状表现 | 第32-34页 |
| 3.4.2 稻米品质QTL分析 | 第34-36页 |
| 3.5 水稻重要农艺性状间相关性分析 | 第36-37页 |
| 3.6 水稻重要农艺性状QTL分析 | 第37-42页 |
| 3.6.1 亲本及RILs群体重要农艺性状的表现 | 第37-40页 |
| 3.6.2 重要农艺性状QTL分析 | 第40-42页 |
| 3.7 QTL定位结果汇总 | 第42-46页 |
| 4 讨论与总结 | 第46-52页 |
| 4.1 Indel分子标记的开发 | 第46-47页 |
| 4.1.1 基于RNA-Seq技术开发Indel标记 | 第46页 |
| 4.1.2 分子标记多态性检测 | 第46-47页 |
| 4.2 种子休眠性QTL分析 | 第47页 |
| 4.3 稻米品质QTL分析 | 第47-49页 |
| 4.3.1 稻米加工品质QTL定位结果比较 | 第47页 |
| 4.3.2 稻米外观品质QTL定位结果比较 | 第47-48页 |
| 4.3.3 QTL位点多效性 | 第48-49页 |
| 4.4 重要农艺性状QTL分析 | 第49-50页 |
| 4.5 总结 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 附录 | 第59-74页 |
| 已发表文章 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
