| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第11-17页 |
| 1.1 研究对象及方法 | 第17-24页 |
| 1.1.1 用于基因表达谱芯片的组织标本 | 第17页 |
| 1.1.2 用于实验的lncRNA芯片 | 第17-18页 |
| 1.1.2.1 lncRNA基因组芯片的型号、规格 | 第17-18页 |
| 1.1.2.2 lncRNA基因组芯片的数据来源 | 第18页 |
| 1.1.2.3 芯片原理 | 第18页 |
| 1.1.3 lncRNA的表达和分析 | 第18-19页 |
| 1.1.3.1 差异筛选 | 第18页 |
| 1.1.3.2 差异lncRNAs的共表达分析 | 第18-19页 |
| 1.1.3.2.1 差异基因的Gene Ontolygy（GO）分析 | 第19页 |
| 1.1.3.2.2 差异基因的Pathway分析 | 第19页 |
| 1.1.3.2.3 差异基因通过cis机制调控的基因 | 第19页 |
| 1.1.3.2.4 差异基因通过trans机制调控的基因 | 第19页 |
| 1.1.4 主要实验试剂及器材 | 第19-21页 |
| 1.1.4.1 lncRNA芯片实验试剂 | 第19-20页 |
| 1.1.4.2 试剂配制 | 第20页 |
| 1.1.4.3 主要仪器耗材 | 第20-21页 |
| 1.1.5 研究方法 | 第21-24页 |
| 1.1.5.1 食管鳞癌及癌旁组织总RNA提取 | 第21-22页 |
| 1.1.5.2 反转录合成双链cDNA | 第22页 |
| 1.1.5.3 cRNA的合成 | 第22-23页 |
| 1.1.5.4 cRNA的纯化 | 第23页 |
| 1.1.5.5 cRNA的质检 | 第23页 |
| 1.1.5.6 芯片的杂交和洗涤 | 第23-24页 |
| 1.1.5.7 芯片扫描 | 第24页 |
| 1.1.5.8 实时荧光定量PCR实验对芯片结果进行验证 | 第24页 |
| 1.1.6 统计学处理 | 第24页 |
| 1.2 结果 | 第24-34页 |
| 1.2.1 样本RNA质检结果 | 第24-25页 |
| 1.2.2 ESCC中差异表达的lncRNA和mRNA | 第25-26页 |
| 1.2.3 qRT-PCR对基因芯片检测结果的验证 | 第26-28页 |
| 1.2.4. ESCC组与癌旁对照组差异表达的lncRNAs的共表达基因的GO和pathway分析 | 第28-31页 |
| 1.2.5 ESCC中显著差异表达lncRNAs与其临近编码基因的共表达精细作图 | 第31-32页 |
| 1.2.6 ESCC组与癌旁正常组织组差异lncRNAs与通过trans机制调控的靶基因 | 第32-34页 |
| 1.3 讨论 | 第34-35页 |
| 1.4 结论 | 第35-37页 |
| 参考文献 | 第37-42页 |
| 附录：综述 | 第42-53页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 在校期间公开发表的学术论文 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
