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盐胁迫下耐盐玉米自交系DNA甲基化变异的研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 文献综述第9-21页
    1.1 研究背景第9页
    1.2 盐碱胁迫对植物的影响第9-11页
        1.2.1 对种子萌发的影响第9-10页
        1.2.2 对植物生长发育的影响第10页
        1.2.3 对生物膜的影响第10-11页
    1.3 玉米耐盐碱胁迫研究进展第11-13页
        1.3.1 作物耐盐胁迫研究进展第11-12页
        1.3.2 植物抗盐相关基因第12-13页
        1.3.3 耐碱胁迫研究进展第13页
    1.4 DNA甲基化概况第13-17页
        1.4.1 表观遗传学与DNA甲基化第13-14页
        1.4.2 DNA甲基化原理及机制第14页
        1.4.3 DNA甲基化的生物学功能第14-16页
            1.4.3.1 DNA甲基化与植物生长发育第14-15页
            1.4.3.2 DNA甲基化与植物非生物胁迫第15-16页
            1.4.3.3 DNA甲基化与基因组防御第16页
            1.4.3.4 DNA甲基化与基因组印记第16页
        1.4.4 DNA去甲基化第16-17页
        1.4.5 去甲基化酶ROS1基因家族第17页
    1.5 DNA甲基化的研究方法第17-19页
        1.5.1 MSAP技术第17-18页
        1.5.2 重亚硫酸氢盐修饰法第18-19页
        1.5.3 免疫共沉淀技术第19页
        1.5.4 高效液相色谱法第19页
    1.6 研究目的第19-20页
    1.7 技术路线第20-21页
第二章 玉米去甲基化酶ROS1家族生物信息学分析第21-33页
    2.1 实验材料第21页
        2.1.1 供试材料第21页
        2.1.2 实验试剂第21页
    2.2 主要仪器第21页
    2.3 实验方法第21-25页
        2.3.1 玉米去甲基化酶ROS1家族的生物信息学预测第21-22页
            2.3.1.1 玉米去甲基化酶基因ROS1家族的获取与定位第22页
            2.3.1.2 玉米去甲基化酶ROS1家族的理化特性、信号序列及亚细胞定位第22页
            2.3.1.3 玉米去甲基化酶ROS1家族的二级结构及氨基酸序列分析第22页
            2.3.1.4 玉米去甲基化酶ROS1家族的分子进化分析第22页
        2.3.2 qRT-PCR表达验证第22-25页
            2.3.2.1 玉米幼苗培养第22-23页
            2.3.2.2 总RNA提取第23-24页
            2.3.2.3 cDNA合成第24页
            2.3.2.4 Real-time PCR分析第24-25页
    2.4 实验结果与分析第25-30页
        2.4.1 玉米去甲基化酶基因ROS1的生物信息学分析第25-29页
            2.4.1.1 玉米去甲基化酶基因ROS1的获取第25页
            2.4.1.2 玉米去甲基化酶ROS1的理化特性、信号序列及亚细胞定位分析第25-26页
            2.4.1.3 玉米去甲基化酶ROS1的二级结构及结构域分析第26-27页
            2.4.1.4 玉米去甲基化酶ROS1家族的分子进化分析第27-29页
        2.4.2 qRT-PCR表达验证分析第29-30页
            2.4.2.1 RNA提取及cDNA一链合成第29-30页
            2.4.2.2 基因表达分析第30页
    2.5 结论与讨论第30-33页
        2.5.1 结论第30页
        2.5.2 讨论第30-33页
            2.5.2.1 ROS1参与DNA去甲基化的作用机制第30-31页
            2.5.2.2 ROS1的生物信息学预测第31-33页
第三章 盐胁迫下玉米DNA甲基化变异的研究第33-55页
    3.1 实验材料第33页
        3.1.1 供试材料第33页
        3.1.2 实验试剂第33页
    3.2 主要仪器第33页
    3.3 实验方法第33-44页
        3.3.1 玉米幼苗培养第33页
        3.3.2 玉米基因组DNA提取第33-35页
        3.3.3 DNA酶切及人工接头连接第35-36页
        3.3.4 预扩增第36页
        3.3.5 选择性扩增第36-37页
        3.3.6 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)第37-39页
        3.3.7 PAGE银染第39页
        3.3.8 目的条带的回收第39-40页
        3.3.9 目的片段琼脂糖回收测序第40页
        3.3.10 大肠杆菌感受态细胞的制备第40-41页
        3.3.11 质粒转化验证第41页
        3.3.12 与T载体连接第41-42页
        3.3.13 平板转化第42-43页
        3.3.14 测序结果分析第43页
        3.3.15 荧光定量PCR验证第43-44页
    3.4 实验结果与分析第44-51页
        3.4.1 苗期长势第44页
        3.4.2 基因组DNA的提取、纯化、酶切及连接第44-45页
        3.4.3 预扩增第45页
        3.4.4 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第45-46页
        3.4.5 不同浓度盐处理下基因组DNA甲基化水平分析第46-47页
        3.4.6 基因组DNA甲基化类型的变化分析第47-48页
        3.4.7 差异片段的回收测序第48-49页
        3.4.8 测序结果同源性分析第49-51页
        3.4.9 候选基因qRT-PCR第51页
    3.5 结论与讨论第51-55页
        3.5.1 结论第51-52页
        3.5.2 讨论第52-55页
            3.5.2.1 MSAP技术应用探讨第52页
            3.5.2.2 DNA去甲基化在植物研究中的意义第52页
            3.5.2.3 植物甲基化变化与耐盐性关系第52-55页
第四章 结论第55-57页
    4.1 玉米ROS1基因家族的生物信息学分析第55页
    4.2 盐胁迫下DNA甲基化变异的研究第55-57页
参考文献第57-67页
致谢第67-69页
个人简历第69页

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