| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-20页 |
| 1.1 课题研究背景及意义 | 第9-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-17页 |
| 1.2.1 国外研究现状 | 第13-17页 |
| 1.2.2 国内研究现状 | 第17页 |
| 1.3 主要研究内容 | 第17-18页 |
| 1.4 章节安排 | 第18-20页 |
| 第2章 相关技术及原理 | 第20-30页 |
| 2.1 大数据相关技术介绍 | 第20-22页 |
| 2.1.1 Map Reduce计算框架 | 第20-21页 |
| 2.1.2 HBase数据库 | 第21-22页 |
| 2.2 变异分析相关技术 | 第22-25页 |
| 2.2.1 变异检测技术 | 第23-24页 |
| 2.2.2 相关文件格式介绍 | 第24-25页 |
| 2.3 大数据索引技术 | 第25-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 组学大数据变异分析关键技术研究 | 第30-45页 |
| 3.1 数据的存储管理 | 第30-32页 |
| 3.1.1 数据的存储结构 | 第30-31页 |
| 3.1.2 数据的导入 | 第31-32页 |
| 3.2 GATK的并行化 | 第32-35页 |
| 3.3 搜索引擎索引分析 | 第35-40页 |
| 3.3.1 分布式索引 | 第35-37页 |
| 3.3.2 HBase二级索引构建 | 第37-40页 |
| 3.4 等位基因频率分析 | 第40-43页 |
| 3.4.1 Fisher精确检验 | 第41-43页 |
| 3.4.2 等位基因频率分析算法 | 第43页 |
| 3.5 本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 组学大数据变异分析系统实现 | 第45-59页 |
| 4.1 数据存储管理实现 | 第45-48页 |
| 4.2 基于Elastic Search的索引系统实现 | 第48-50页 |
| 4.3 搜索引擎实现 | 第50-51页 |
| 4.4 GATK-Spark实现 | 第51-55页 |
| 4.5 等位基因频率分析实现 | 第55-57页 |
| 4.6 本章小结 | 第57-59页 |
| 第5章 系统测试与优化 | 第59-67页 |
| 5.1 测试环境 | 第59-61页 |
| 5.2 功能测试 | 第61-64页 |
| 5.3 性能测试 | 第64-66页 |
| 5.4 本章小结 | 第66-67页 |
| 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-75页 |
| 致谢 | 第75页 |