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基于单细胞测序技术分析小鼠不同二细胞克隆胚胎转录组差异

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第1章 引言第9-15页
    1.1 哺乳动物的早期胚胎发育第9-10页
    1.2 体细胞核重编程的分子机制第10-12页
    1.3 克隆效率低下与 2-CELL阻滞第12-13页
    1.4 立项依据与研究意义第13-15页
第2章 实验材料与方法第15-30页
    2.1 实验材料与设备第15-18页
        2.1.1 实验动物第15页
        2.1.2 仪器与设备第15-16页
        2.1.3 试剂与耗材第16-17页
        2.1.4 实验所需的引物第17-18页
    2.2 实验技术路线第18-19页
    2.3 实验方法第19-23页
        2.3.1 体内胚胎的采集第19-20页
        2.3.2 卵丘细胞核移植胚胎制备第20页
        2.3.3 MEF核移植胚胎制备第20-23页
    2.4 单胚胎样品制备第23-24页
        2.4.1 单细胞裂解液配制第23-24页
        2.4.2 单胚胎样品准备第24页
    2.5 单胚胎样品扩增第24-29页
    2.6 单胚胎样品测序第29页
    2.7 转录组数据分析方法第29-30页
第3章 实验结果第30-63页
    3.1 单细胞测序扩增质量控制第30-35页
        3.1.1 单胚胎RNA转录组扩增质量检验第30-31页
        3.1.2 饱和度第31-32页
        3.1.3 Reads数量与分布第32-35页
    3.2 总体描述第35-38页
        3.2.1 外显子比例第35-36页
        3.2.2 聚类第36-37页
        3.2.3 转录组差异表达基因第37-38页
    3.3 数据分析部分第38-63页
        3.3.1 转录组数据整体分析第38-43页
        3.3.2 核移植胚胎显著下调表达体内胚胎高表达的基因第43-46页
        3.3.3 核移植胚胎基因表达差异显著第46-51页
        3.3.4 2-cell阻滞相关基因表达差异显著第51-59页
        3.3.5 新转录本的表达水平在三组胚胎中存在显著差异第59-63页
第4章 讨论第63-69页
第5章 结论第69-70页
致谢第70-72页
参考文献第72-81页
附录第81-85页
缩略词表第85-87页
在校期间公开发表论文及著作情况第87-88页
硕士期间参与科研情况第88页

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