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鸡攻击行为的全基因组关联分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
常用缩写词第7-10页
1 前言第10-12页
2 材料与方法第12-26页
    2.1 实验材料第12页
        2.1.1 实验动物第12页
        2.1.2 饲养管理第12页
    2.2 主要仪器设备及试剂配制第12-13页
        2.2.1 主要仪器设备第12-13页
        2.2.2 主要试剂及配制第13页
    2.3 实验方法第13-26页
        2.3.1 家禽采食行为的测定第13-15页
            2.3.3.1 性状测定安排第13-14页
            2.3.3.2 采食量性状测定第14-15页
        2.3.2 家禽攻击行为的行为观测及记录第15-17页
        2.3.3 基因分型第17-18页
            2.3.3.1 鸡血液采集和基因组DNA抽提第17页
            2.3.3.2 SNP分型方法第17-18页
            2.3.3.3 质量控制第18页
        2.3.4 统计分析第18-22页
            2.3.4.1 表型数据预处理第18-19页
            2.3.4.2 相关分析第19-20页
            2.3.4.3 单点关联分析第20-21页
            2.3.4.4 群体结构的分析第21页
            2.3.4.5 显著性水平P值阈值设定第21-22页
            2.3.4.6 IPA分析第22页
        2.3.5 打斗行为相关候选基因SORCS2的表达分析第22-24页
            2.3.5.1 RNA抽提第22页
            2.3.5.2 反转录第22-23页
            2.3.5.3 mRNA定量引物设计第23页
            2.3.5.4 荧光定量PCR第23-24页
            2.3.5.5 荧光定量的计算分析方法第24页
        2.3.6 siRNA干扰SORCS2基因第24-26页
            2.3.6.1 化学合成siRNA分子第24-25页
            2.3.6.2 siRNA干扰效率的浓度梯度检测第25页
            2.3.6.3 荧光定量PCR引物设计第25-26页
            2.3.6.4 荧光定量PCR第26页
            2.3.6.5 定量统计分析方法第26页
3 结果与分析第26-46页
    3.1 相关分析结果第26-27页
    3.2 GWAS分析结果第27-41页
    3.3 基因网络分析第41-43页
    3.4 SORCS2基因垂体组织表达分析第43页
    3.5 siRNA干扰SORCS2基因的表达第43-46页
        3.5.1 siRNA-SORCS2的干扰效率检测第43-44页
        3.5.2 干扰SORCS2后,IPA基因网络中攻击行为相关基因的表达检测第44-45页
        3.5.3 干扰SORCS2后,多巴胺受体基因的表达变化检测第45-46页
4 讨论第46-48页
    4.1 表型数据的相关分析第46页
    4.2 SORCS2与鸡攻击行为的关系第46-47页
    4.3 多巴胺与鸡攻击行为的关系第47页
    4.4 IPA分析结果第47-48页
5 结论第48-49页
致谢第49-50页
参考文献第50-55页
附录 硕士期间论文发表情况第55页

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