| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 动物线粒体基因组 | 第12-14页 |
| 1.1.1 动物线粒体基因组简介 | 第12页 |
| 1.1.2 动物线粒体基因组的研究概况 | 第12-14页 |
| 1.2 线虫线粒体基因组 | 第14-18页 |
| 1.2.1 线虫线粒体基因组的主要特征 | 第14-16页 |
| 1.2.2 线虫线粒体基因组的应用 | 第16-18页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第18-21页 |
| 1.3.1 广杆属线虫 | 第18-20页 |
| 1.3.2 研究目的和意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 线虫来源和培养 | 第21页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第21-22页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-30页 |
| 2.2.1 实验设计 | 第22-23页 |
| 2.2.2 基因组总DNA提取 | 第23页 |
| 2.2.3 C. tropicalis n.sp.和C.remanei线粒体全基因组扩增 | 第23-26页 |
| 2.2.4 克隆 | 第26-27页 |
| 2.2.5 序列拼接 | 第27-28页 |
| 2.2.6 序列注释 | 第28页 |
| 2.2.7 序列分析 | 第28-29页 |
| 2.2.8 广杆属线虫线粒体基因组比较分析 | 第29页 |
| 2.2.9 广杆属线虫线粒体基因组的系统发育关系分析 | 第29-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-65页 |
| 3.1 C. tropicalis n.sp.(JU1836)线粒体基因组 | 第30-41页 |
| 3.1.1 PCR扩增结果 | 第30-32页 |
| 3.1.2 测序结果分析 | 第32-41页 |
| 3.2 C remanei(SB146)线粒体基因组 | 第41-53页 |
| 3.2.1 PCR扩增结果 | 第41-44页 |
| 3.2.2 测序结果分析 | 第44-53页 |
| 3.3 广杆属线虫线粒体基因组比较分析 | 第53-65页 |
| 3.3.1 基本特征比较 | 第53页 |
| 3.3.2 核苷酸变异位点分析 | 第53-54页 |
| 3.3.3 核酸变异性(Pi)分析 | 第54-55页 |
| 3.3.4 蛋白编码基因氨基酸变异位点比较 | 第55-56页 |
| 3.3.5 Ka/Ks分析 | 第56页 |
| 3.3.6 AT富含区比较分析 | 第56-57页 |
| 3.3.7 非编码区比较分析 | 第57-58页 |
| 3.3.8 基于广杆属线虫线粒体全基因组的系统发育关系 | 第58-65页 |
| 4 讨论 | 第65-71页 |
| 4.1 广杆属线虫线粒体基因组特征 | 第65-67页 |
| 4.2 广杆属线虫线粒体基因组的AT富含区 | 第67-68页 |
| 4.3 基于线粒体全基因组的广杆属线虫系统发育关系 | 第68-69页 |
| 4.4 小结与展望 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-78页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
