中文摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-12页 |
引言 | 第12-15页 |
1 本课题的研究背景 | 第12-13页 |
2 本课题的主要研究内容与方法 | 第13-14页 |
3 本课题的研究意义 | 第14-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-43页 |
1 糖蛋白质组学 | 第15-27页 |
·糖蛋白定义及主要类型 | 第15-21页 |
·蛋白质糖基化的生物学作用 | 第21-22页 |
·蛋白质组学、糖组学与糖蛋白质组学 | 第22-23页 |
·蛋白质糖基化研究的内容和策略 | 第23-27页 |
2 糖蛋白/糖肽富集方法 | 第27-35页 |
·基于凝集素亲和色谱的方法 | 第27-28页 |
·基于免疫亲和色谱的方法 | 第28-29页 |
·基于硼酸亲和色谱的方法 | 第29页 |
·基于分子排阻的方法 | 第29-30页 |
·基于静电排斥色谱的方法 | 第30页 |
·基于亲水亲和的方法 | 第30-31页 |
·基于酰肼化学的方法 | 第31-32页 |
·末端唾液酸化糖蛋白/末端唾液酸化糖肽富集方法 | 第32-35页 |
3 糖基化位点鉴定技术研究进展 | 第35-37页 |
·用于糖基化位点鉴定的质谱技术 | 第35页 |
·引入质量标记鉴定糖基化位点 | 第35-37页 |
4 肝细胞癌糖蛋白质组研究进展 | 第37-43页 |
·对癌症的最新认识 | 第37-38页 |
·肝细胞癌糖蛋白质研究进展 | 第38-43页 |
第二章 肝癌细胞N-糖蛋白及N-糖基化位点鉴定 | 第43-86页 |
1 实验部分 | 第43-49页 |
·实验样品 | 第43页 |
·试剂与仪器 | 第43-44页 |
·常用试剂配制方法 | 第44-45页 |
·酰肼树脂酰肼基团含量测定 | 第45页 |
·HepG2细胞和L02细胞的培养 | 第45页 |
·总蛋白质胰蛋白酶酶解 | 第45-46页 |
·酶解后肽段除盐 | 第46页 |
·酰肼化学固相萃取分离富集糖肽 | 第46页 |
·亲水相互作用固相萃取分离富集糖肽 | 第46-47页 |
·LC-MS/MS分析 | 第47页 |
·质谱数据的数据库检索和糖基化位点鉴定 | 第47页 |
·鉴定N-糖基化位点的基序分析 | 第47页 |
·鉴定N-糖肽的相对定量分析 | 第47-48页 |
·鉴定N-糖蛋白的GO分析 | 第48-49页 |
2 实验结果 | 第49-82页 |
·树脂酰肼基团含量 | 第49页 |
·运用标准蛋白评价C18固相萃取小柱除盐时样品回收率 | 第49页 |
·HepG2与LO2细胞总蛋白含量 | 第49-50页 |
·质谱鉴定结果概述 | 第50-51页 |
·与Uniprot数据库比对结果 | 第51-52页 |
·糖基化位点基序分析 | 第52-53页 |
·提取的糖蛋白和糖肽等电点与相对分子质量分析 | 第53-54页 |
·细胞中糖蛋白种类差异分析 | 第54-69页 |
·鉴定糖肽的非标记定量 | 第69-77页 |
·细胞中糖蛋白的功能差异分析 | 第77-79页 |
·KEGG通路分析 | 第79-82页 |
3 讨论 | 第82-84页 |
4 小结 | 第84-86页 |
第三章 肝癌细胞唾液酸化糖蛋白初步研究 | 第86-99页 |
1 引言 | 第86-88页 |
2 实验部分 | 第88-89页 |
·试剂与器材 | 第88页 |
·HepG2细胞和L02细胞的培养 | 第88页 |
·细胞总蛋白提取 | 第88页 |
·细胞糖蛋白的酶解 | 第88页 |
·酰肼树脂提取细胞唾液酸化糖肽 | 第88页 |
·LC-MS/MS分析 | 第88页 |
·质谱数据的数据库检索和糖基化位点鉴定 | 第88页 |
·鉴定N-糖蛋白的GO分析 | 第88-89页 |
3 实验结果 | 第89-98页 |
·提取的糖蛋白和糖肽比较 | 第89-93页 |
·与Uniprot数据库比对结果 | 第93-94页 |
·肝癌细胞唾液酸化糖蛋白的GO分析 | 第94页 |
·细胞中N-糖蛋白与唾液酸化N-糖蛋白种类分析 | 第94-98页 |
4 讨论 | 第98页 |
5 小结 | 第98-99页 |
全文总结 | 第99-100页 |
参考文献 | 第100-118页 |
攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第118-119页 |
致谢 | 第119页 |