伊氏线虫真菌比较基因组及其内生细菌的研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第16-38页 |
| 1.1 研究背景 | 第16-17页 |
| 1.2 国内外研究现状及评述 | 第17-35页 |
| 1.2.1 真菌基因组 | 第17-27页 |
| 1.2.2 生物之间的内共生 | 第27-35页 |
| 1.3 研究目标和主要研究内容 | 第35-36页 |
| 1.3.1 关键的科学问题与研究目标 | 第35-36页 |
| 1.3.2 主要研究内容 | 第36页 |
| 1.4 研究技术路线 | 第36-37页 |
| 1.5 论文的创新点 | 第37-38页 |
| 第二章 Ev核基因组测序组装和注释 | 第38-50页 |
| 2.1 试验材料与方法 | 第38-41页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第38页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第38-41页 |
| 2.2 结果 | 第41-49页 |
| 2.2.1 下机数据统计 | 第41-43页 |
| 2.2.2 基因组组装结果 | 第43-44页 |
| 2.2.3 重复序列分析 | 第44-45页 |
| 2.2.4 基因结构预测 | 第45-46页 |
| 2.2.5 基因功能注释结果统计 | 第46-48页 |
| 2.2.6 tRNA及rRNA预测 | 第48-49页 |
| 2.3 小结 | 第49-50页 |
| 第三章 食线虫真菌比较基因组分析 | 第50-96页 |
| 3.1 试验材料与方法 | 第52-55页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第52页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第52-55页 |
| 3.2 结果与分析 | 第55-91页 |
| 3.2.1 致病性基因的比较分析 | 第55-76页 |
| 3.2.2 转运蛋白 | 第76-77页 |
| 3.2.3 抗生素抗性基因 | 第77-79页 |
| 3.2.4 不同宿主致病性分化的关键因素 | 第79-80页 |
| 3.2.5 次级代谢分析 | 第80-81页 |
| 3.2.6 分泌蛋白 | 第81-83页 |
| 3.2.7 系统发育和分化时间估计 | 第83-84页 |
| 3.2.8 基因家族扩张 | 第84-89页 |
| 3.2.9 正向选择 | 第89-91页 |
| 3.3 讨论 | 第91-95页 |
| 3.4 小结 | 第95-96页 |
| 第四章 Ev线粒体组装、注释和进化分析 | 第96-99页 |
| 4.1 材料与方法 | 第96-97页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第96页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第96-97页 |
| 4.2 结果与分析 | 第97-98页 |
| 4.3 小结 | 第98-99页 |
| 第五章 Ev胞内存在内生细菌 | 第99-119页 |
| 5.1 材料方法 | 第100-104页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第100-101页 |
| 5.1.2 试验方法 | 第101-104页 |
| 5.2 结果与分析 | 第104-115页 |
| 5.2.1 内共生细菌的鉴定 | 第104-107页 |
| 5.2.2 荧光原位杂交 | 第107-108页 |
| 5.2.3 内毒素检测 | 第108页 |
| 5.2.4 培养和消除内共生细菌 | 第108页 |
| 5.2.5 内共生细菌的超微结构形态 | 第108-111页 |
| 5.2.6 内共生细菌先于新隔膜形成迁移 | 第111-113页 |
| 5.2.7 内共生细菌与弯孢的形成和萌发 | 第113-114页 |
| 5.2.8 内共生细菌的分布 | 第114-115页 |
| 5.3 讨论 | 第115-118页 |
| 5.4 小结 | 第118-119页 |
| 第六章 结论与讨论 | 第119-121页 |
| 6.1 主要结论 | 第119页 |
| 6.2 讨论 | 第119-120页 |
| 6.3 展望 | 第120-121页 |
| 参考文献 | 第121-148页 |
| 在读期间的学术研究 | 第148-149页 |
| 致谢 | 第149页 |
