畜禽基因组选择信号检测策略与应用研究
摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-13页 |
縮略语表(Abbreviation) | 第13-14页 |
第一章 文献综述 | 第14-29页 |
·引言 | 第14-15页 |
·选择信号 | 第15页 |
·选择信号的检测方法 | 第15-22页 |
·基于位点频率谱的方法 | 第16-19页 |
·基于连锁不平衡的方法 | 第19-21页 |
·基于群体分化的方法 | 第21-22页 |
·畜禽基因组选择信号检测 | 第22-26页 |
·畜禽驯化与选择信号 | 第22-23页 |
·牛与群体选择信号检测 | 第23-24页 |
·猪与群体选择信号检测 | 第24-25页 |
·鸡与群体选择信号的检测 | 第25-26页 |
·基因组选择信号检测存在的问题与展望 | 第26-28页 |
·选择信号检测存在的问题 | 第26-27页 |
·选择信号检测的展望 | 第27-28页 |
·本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
第二章 常用选择信号检测方法的比较 | 第29-43页 |
·引言 | 第29-30页 |
·数据模拟 | 第30-32页 |
·常用选择信号检测方法的计算 | 第32-33页 |
·基于位点频率谱的雇佣方法 | 第32页 |
·基于连锁不平衡的雇佣方法 | 第32-33页 |
·基于群体分化的雇佣方法 | 第33页 |
·统计方法经验分布的构建与检测效力的计算 | 第33页 |
·结果与分析 | 第33-42页 |
·标记间距对各统计量的影响 | 第34-36页 |
·选择等位基因频率对各统计量的影响 | 第36-37页 |
·样本大小对各统计量的影响 | 第37-38页 |
·选择系数对各统计量的影响 | 第38-39页 |
·各情景下XPCLR低效率的原因 | 第39页 |
·平行选择情景下各统计量表现 | 第39-42页 |
·小结 | 第42-43页 |
第三章 选择信号检测复合策略DCMS的构建 | 第43-56页 |
·引言 | 第43页 |
·数据模拟 | 第43-44页 |
·去相关复合统计量(DCMS)的构建 | 第44-45页 |
·DCMS策略的实现 | 第45页 |
·基于位点频率谱的雇佣方法 | 第45页 |
·基于连锁不平衡的雇佣方法 | 第45页 |
·基于群体分化的雇佣方法 | 第45页 |
·复合策略DCMS权重因子与统计量的计算 | 第45页 |
·DCMS经验分布的构建与检测效力的计算 | 第45页 |
·其它选择信号复合方法的构建与实现 | 第45-47页 |
·Meta-ss方法 | 第46页 |
·CSS方法 | 第46-47页 |
·结果与分析 | 第47-53页 |
·DCMS策略与各雇佣方法检测效力的比较 | 第47页 |
·DCMS策略与各雇佣方法的检测精确度 | 第47-48页 |
·DCMS策略与其它复合方法的比较 | 第48-51页 |
·DCMS策略与CMS方法 | 第51页 |
·LCT基因验证DCMS策略的可靠性 | 第51-53页 |
·小结 | 第53-56页 |
第四章 猪和鸡基因组选择信号检测 | 第56-86页 |
·引言 | 第56-57页 |
·多方法策略检测猪全基因组选择信号 | 第57-77页 |
·试验群体 | 第57页 |
·基因分型与质量控制 | 第57页 |
·选择信号检测 | 第57-58页 |
·选择信号的鉴定 | 第58-59页 |
·选择信号候选区域功能注释 | 第59页 |
·结果与分析 | 第59-77页 |
·DCMS策略检测鸡全基因组选择信号 | 第77-84页 |
·试验群体与质量控制 | 第77-78页 |
·选择信号检测 | 第78-79页 |
·选择信号候选区域功能注释 | 第79页 |
·结果与分析 | 第79-84页 |
·小结 | 第84-86页 |
第五章 讨论与结论 | 第86-94页 |
·关于模拟数据考虑因素的讨论 | 第86-87页 |
·关于选择信号检测方法与复合策略的讨论 | 第87-88页 |
·关于复合策略DCMS与其它方法比较的讨论 | 第88-89页 |
·关于选择信号检测与功能基因定位的讨论 | 第89-91页 |
·选择信号检测与生物信息学分析 | 第90页 |
·选择信号检测与表型性状 | 第90-91页 |
·选择信号与全基因组关联分析 | 第91页 |
·关于畜禽基因组选择信号检测的讨论 | 第91-92页 |
·关于猪基因组选择信号检测的讨论 | 第91-92页 |
·关于鸡基因组选择信号检测的讨论 | 第92页 |
·结论 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-102页 |
致谢 | 第102-104页 |
作者简介 | 第104页 |