| 中文摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-15页 |
| 1 前言 | 第15-37页 |
| ·‘红阳’猕猴桃概述 | 第15-16页 |
| ·转录组研究概述 | 第16-19页 |
| ·转录组及转录组测序(RNA-Seq) | 第16-17页 |
| ·RNA-Seq的应用 | 第17-19页 |
| ·RNA-Seq在果树分子生物学研究中的应用 | 第19-21页 |
| ·RNA-Seq在果实发育与品质研究中的应用 | 第19-20页 |
| ·RNA-Seq在果实应对环境胁迫研究中的应用 | 第20-21页 |
| ·果实发育分子生物学研究 | 第21-33页 |
| ·果实发育中激素变化研究 | 第21-27页 |
| ·果实发育中糖-淀粉合成代谢研究 | 第27-28页 |
| ·果实发育中维生素C合成代谢研究 | 第28-30页 |
| ·花青素生物合成研究进展 | 第30-33页 |
| ·花青素合成基因研究 | 第30-32页 |
| ·花青素合成的调控因子 | 第32-33页 |
| ·研究的目的和意义 | 第33-34页 |
| ·主要研究内容 | 第34-35页 |
| ·技术路线 | 第35-37页 |
| 2 材料与方法 | 第37-52页 |
| ·材料与试剂 | 第37-40页 |
| ·植物材料 | 第37页 |
| ·载体及菌株 | 第37页 |
| ·酶及试剂 | 第37-38页 |
| ·培养基及试剂配制 | 第38页 |
| ·寡核苷酸引物 | 第38-40页 |
| ·仪器设备 | 第40-41页 |
| ·方法和步骤 | 第41-52页 |
| ·猕猴桃RNA-Seq测序方法 | 第41-44页 |
| ·cDNA文库构建和测序 | 第41页 |
| ·转录组测序质量评估 | 第41-42页 |
| ·转录组基因功能注释和表达量分析 | 第42页 |
| ·差异基因表达分析 | 第42页 |
| ·基因差异表达pathway及基因表达聚类分析 | 第42-43页 |
| ·基因结构优化和新转录本注释 | 第43页 |
| ·可变剪接和SNP分析 | 第43-44页 |
| ·分子生物学实验方法 | 第44-49页 |
| ·RNA样品的制备和检测 | 第44-45页 |
| ·RNA反转录反应 | 第45页 |
| ·实时荧光定量PCR反应 | 第45-46页 |
| ·基因克隆转化大肠杆菌 | 第46页 |
| ·农杆菌感受态细胞的制备(冻融法) | 第46-47页 |
| ·农杆菌转化法(冻融法) | 第47页 |
| ·拟南芥转化法(滴液法) | 第47页 |
| ·拟南芥抗性株系的筛选 | 第47-48页 |
| ·拟南芥单拷贝株系的筛选 | 第48页 |
| ·烟草叶片表皮细胞瞬时表达检测 | 第48-49页 |
| ·AcMYB10转基因拟南芥功能验证 | 第49页 |
| ·猕猴桃生理学实验 | 第49-52页 |
| ·猕猴桃内源激素HPLC测定法 | 第49-50页 |
| ·猕猴桃果实维生素C的HPLC测定法 | 第50页 |
| ·猕猴桃果实可溶性糖及淀粉测定 | 第50-51页 |
| ·猕猴桃原花青素测定 | 第51页 |
| ·猕猴桃花青素提取和测定 | 第51-52页 |
| 3 结果与分析 | 第52-92页 |
| ·猕猴桃果实发育 | 第52-53页 |
| ·RNA-Seq分析结果 | 第53-62页 |
| ·RNA质量及浓度检测 | 第53-54页 |
| ·猕猴桃RNA-Seq质量分析 | 第54-55页 |
| ·转录组中基因结构优化、新转录及SNP分析 | 第55-57页 |
| ·差异基因表达分析 | 第57-62页 |
| ·猕猴桃发育相关基因表达分析 | 第62-76页 |
| ·激素发育与基因表达分析 | 第62-70页 |
| ·AUX合成候选基因与基因表达水平 | 第62-63页 |
| ·CK合成候选基因与基因表达水平 | 第63-65页 |
| ·ABA合成候选基因与基因表达水平 | 第65-67页 |
| ·GA合成候选基因与基因表达水平 | 第67-68页 |
| ·ET合成候选基因与基因表达水平 | 第68-70页 |
| ·猕猴桃果实糖、淀粉相关基因表达分析 | 第70-74页 |
| ·猕猴桃果实Vc候选基因及表达分析 | 第74-76页 |
| ·类黄酮合成相关基因及转录调控因子功能研究 | 第76-85页 |
| ·类黄酮合成候选基因 | 第76-79页 |
| ·类黄酮合成候选基因在果实发育过程中的表达水平 | 第79-82页 |
| ·类黄酮合成转录调控因子研究 | 第82-84页 |
| ·转录调控因子的转录水平分析 | 第84-85页 |
| ·转录因AcMYB10功能研究 | 第85-92页 |
| ·转录因子AcMYB10序列克隆及生物信息学分析 | 第85-86页 |
| ·AcMYB10植物表达载体的构建及亚细胞定位 | 第86-88页 |
| ·AcMYB10功能验证 | 第88-92页 |
| ·AcMYB10在转基因拟南芥中的表达量分析 | 第88-89页 |
| ·AcMYB10过表达拟南芥表型分析 | 第89-90页 |
| ·AcMYB10过表达拟南芥花青素合成基因表达分析 | 第90-92页 |
| 4 讨论 | 第92-98页 |
| ·‘红阳’猕猴桃转录组测序特点 | 第92页 |
| ·猕猴桃果实内源激素相关基因发掘 | 第92-94页 |
| ·猕猴桃果实中糖及淀粉积累相关基因 | 第94-95页 |
| ·猕猴桃果实中Vc合成及代谢相关基因 | 第95-96页 |
| ·猕猴桃果实花青素累积机理 | 第96-98页 |
| 参考文献 | 第98-109页 |
| 附录 | 第109-117页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118页 |