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芸薹属多倍体植物进化及适应性的分子机制研究

论文创新点第1-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-12页
目录第12-15页
第1章 文献综述第15-31页
   ·多倍体的形成与进化第15-20页
     ·多倍体的形成第15-16页
     ·多倍化带来的“机遇”和“挑战”第16-18页
     ·人工合成多倍体在多倍体研究中的应用第18-20页
   ·多倍体基因表达研究第20-26页
     ·基因表达研究的技术手段第20-22页
     ·多倍体中基因表达变化特点第22-24页
     ·表达发生变化的基因类型第24-25页
     ·多倍体中基因表达发生变化的原因第25-26页
   ·逆境胁迫对多倍体植物的影响第26-29页
     ·低温胁迫对多倍体植物的影响第27页
     ·盐胁迫对多倍体植物的影响第27-28页
     ·干旱胁迫对多倍体植物的影响第28-29页
   ·本研究的目的和意义第29-31页
第2章 芸薹属六倍体植物与其亲本的全基因组规模基因差异表达研究第31-55页
   ·材料与方法第31-36页
     ·实验材料第31页
     ·总RNA的提取第31-32页
     ·RNA中DNA的消化及质量检测第32-33页
     ·cDNA文库构建及测序第33页
     ·Reads比对和基因的表达量分析第33页
     ·基因注释第33-34页
     ·差异表达基因分析第34页
     ·单链cDNA的合成第34页
     ·实时荧光定量PCR验证第34-36页
   ·结果与分析第36-50页
     ·测序数据分析第36-38页
     ·六倍体植物及两亲本中表达的基因与其功能分析第38-41页
     ·六倍体植物与其亲本中差异表达的基因及其功能分析第41-44页
     ·差异表达基因聚类分析第44-46页
     ·芸薹属六倍体中基因加性表达情况第46-47页
     ·转录因子家族及甲基化酶基因的研究第47-49页
     ·实时荧光定量PCR验证第49-50页
   ·讨论第50-55页
     ·RNA-Seq技术的可行性与有效性第50-51页
     ·六倍体植物中基因表达水平偏向其母本第51-53页
     ·差异表达的转录因子基因及甲基化酶基因对六倍体植物的可能影响第53-55页
第3章 芸薹属六倍体植物抗逆性的分子基础研究第55-80页
   ·材料与方法第55-62页
     ·多倍体植物材料及低温、盐、干旱胁迫处理第55-56页
     ·总RNA的提取第56页
     ·RNA 中 DNA的消化及质量检测第56-57页
     ·单链cDNA的合成第57页
     ·基因片段的扩增第57-58页
     ·琼脂糖凝胶回收PCR产物和克隆测序第58-60页
     ·实时荧光定量PCR第60-62页
   ·结果与分析第62-77页
     ·芸薹属六倍体两亲本同源基因之间的序列差异第62-69页
     ·六倍体植物与其亲本在正常生长条件下基因差异表达第69-71页
     ·六倍体植物与其亲本中基因表达对低温胁迫的响应第71-73页
     ·六倍体植物与其亲本中基因表达对盐胁迫的响应第73-76页
     ·六倍体植物与其亲本中基因表达对干旱胁迫的响应第76-77页
   ·讨论第77-80页
第4章 萝卜芥蓝四倍体植物抗逆性的分子基础研究第80-105页
   ·材料与方法第80-84页
     ·多倍体植物材料及低温、盐、干旱胁迫处理第80-81页
     ·总RNA的提取第81-82页
     ·RNA中DNA的消化及质量检测第82页
     ·单链cDNA的合成第82页
     ·基因片段的扩增第82页
     ·琼脂糖凝胶回收PCR产物和克隆测序第82页
     ·实时荧光定量PCR第82-84页
   ·结果与分析第84-101页
     ·萝卜芥蓝四倍体两亲本同源基因之间的序列差异第84-91页
     ·四倍体植物与其亲本在正常生长条件下基因差异表达第91-94页
     ·四倍体植物与其亲本中基因表达对低温胁迫的响应第94-96页
     ·四倍体植物与其亲本中基因表达对盐胁迫的响应第96-99页
     ·四倍体植物与其亲本中基因表达对干旱胁迫的响应第99-101页
   ·讨论第101-105页
第5章 结论与展望第105-108页
   ·本文主要结论第105-106页
   ·研究展望第106-108页
参考文献第108-118页
在读期间发表及投稿论文第118-119页
致谢第119页

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