| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 縮略语表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-21页 |
| ·植物抗黄萎病研究进展 | 第10-11页 |
| ·植物抗病基因的克隆与鉴定 | 第11-15页 |
| ·利用转座子标签技术克隆植物抗病基因 | 第11-12页 |
| ·利用图位克隆法克隆植物抗病基因 | 第12-13页 |
| ·利用同源序列法克隆植物抗病基因 | 第13页 |
| ·通过表达谱测序分离植物抗病基因 | 第13-15页 |
| ·构建抑制消减杂交文库(SSH)分离植物抗病基因 | 第13-14页 |
| ·通过RNA-seq表达谱测序分离植物抗病基因 | 第14-15页 |
| ·454转录组测序方法介绍 | 第15-18页 |
| ·454转录组测序的实验步骤 | 第16页 |
| ·454转录组测序的运用 | 第16-18页 |
| ·对物种进行基因组测序及重测序 | 第16-17页 |
| ·通过转录组测序发掘新基因、研究基因的表达调控模式 | 第17-18页 |
| ·SNP位点,挖掘分子标记 | 第18页 |
| ·发现sRNA | 第18页 |
| ·植物类受体蛋白及其研究进展 | 第18-19页 |
| ·病毒介导的基因沉默技术(Virus-induced gene silencing,VIGS) | 第19-21页 |
| ·植物转录后的基因沉默现象(PTGS) | 第19-20页 |
| ·VIGS机制及其应用研究进展 | 第20-21页 |
| ·研究的目的与意义 | 第21页 |
| 2 实验材料与方法 | 第21-27页 |
| ·实验材料 | 第21-22页 |
| ·棉花材料和菌种 | 第21页 |
| ·培养基 | 第21页 |
| ·实验试剂 | 第21-22页 |
| ·实验方法 | 第22-27页 |
| ·转录组的制备 | 第22-23页 |
| ·黄萎病菌活化及培养 | 第22页 |
| ·棉花接菌处理 | 第22页 |
| ·RNA提取及纯化 | 第22-23页 |
| ·转录组的测序与分析 | 第23-24页 |
| ·测序和拼接 | 第23-24页 |
| ·数据分析 | 第24页 |
| ·转录组中根特异基因的分析及组织表达验证 | 第24页 |
| ·基于Gene Ontology基因功能富集分析 | 第24页 |
| ·棉花类受体蛋白的分离与分析 | 第24-27页 |
| ·类受体蛋白的进化树分析 | 第24页 |
| ·类受体蛋白基因表达模式分析 | 第24-25页 |
| ·棉花类受体蛋白对黄萎病和激素响应的表达分析 | 第25页 |
| ·用VIGS方法验证类受体蛋白的基因功能 | 第25-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-42页 |
| ·454转录组测序及拼接结果分析 | 第27-28页 |
| ·转录组数据的生物注释分析 | 第28-33页 |
| ·转录组拼接数据与棉花纤维表达数据比对分析 | 第28-29页 |
| ·454拼接的contigs与拟南芥数据库TAIR10、棉花unique sequence、NCBI非冗余蛋白(Nt)比对分析 | 第29-30页 |
| ·根转录组数据中根特异基因的分离与验证 | 第30-31页 |
| ·转录组中来自Verticillium dahliae的表达序列及其分析 | 第31-32页 |
| ·基于Gene Ontology基因功能富集分析 | 第32-33页 |
| ·棉花类受体蛋白(RLP)基因的分离与分析 | 第33-42页 |
| ·棉花类受体蛋白(RLP)基因的分离 | 第33页 |
| ·棉花类受体蛋白(RLP)基因与棉花D基因组同源基因的比对分析 | 第33-34页 |
| ·10个棉花类受体蛋白的结构分析 | 第34-36页 |
| ·棉花类受体蛋白与番茄Vel和其他植物类受体蛋白基因的聚类分析 | 第36-38页 |
| ·棉花类受体蛋白基因的组织表达模式分析和诱导表达模式分析 | 第38-41页 |
| ·在棉花中验证VIGS技术 | 第41-42页 |
| 4 讨论 | 第42-47页 |
| ·根转录组测序的应用 | 第42-43页 |
| ·根转录组数据的分析 | 第43-44页 |
| ·棉花类受体蛋白的分离鉴定 | 第44-45页 |
| ·VIGS技术的运用 | 第45-46页 |
| ·下一步实验计划 | 第46-47页 |
| 附录 | 第47-51页 |
| 参考文献 | 第51-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
