| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 插图索引 | 第9-10页 |
| 附表索引 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| ·课题研究背景及意义 | 第11-12页 |
| ·国内外研究现状 | 第12-15页 |
| ·本文主要工作和内容安排 | 第15-17页 |
| 第2章 随机森林方法介绍 | 第17-25页 |
| ·全基因组遗传数据 | 第17-18页 |
| ·随机森林方法及其各组成部分 | 第18-23页 |
| ·偏差-方差分解 | 第19-21页 |
| ·分类回归树 | 第21页 |
| ·分类回归树的 Bagging 集成方法 | 第21-22页 |
| ·分类回归树的随机性注入 | 第22-23页 |
| ·随机森林方法的框架体系 | 第23页 |
| ·小结 | 第23-25页 |
| 第3章 基于随机森林的致病单位点 SNP 检测 | 第25-35页 |
| ·变量重要性值 | 第25-26页 |
| ·Gini importance 值 | 第25页 |
| ·Permutation importance 值 | 第25-26页 |
| ·随机森林的参数调节 | 第26-28页 |
| ·对参数 mtry 的调节 | 第26-27页 |
| ·CART 数目的调节 | 第27-28页 |
| ·随机森林树的规模控制 | 第28页 |
| ·基于随机森林的单点致病 SNP 检测 | 第28-29页 |
| ·数据预处理 | 第28-29页 |
| ·基于随机森林的单致病 SNP 检测方法 | 第29页 |
| ·实验与分析 | 第29-33页 |
| ·模拟数据集的实验和结果分析 | 第29-31页 |
| ·真实数据集的实验和结果分析 | 第31-33页 |
| ·小结 | 第33-35页 |
| 第4章 基于随机森林的致病 SNP 相互作用检测 | 第35-48页 |
| ·基因间相互作用介绍 | 第35-36页 |
| ·基因间相互作用的统计学模型 | 第36-37页 |
| ·基于随机森林参数调节的属性过滤 | 第37-44页 |
| ·参数调节的属性过滤方法 | 第37-38页 |
| ·实验和结果分析 | 第38-44页 |
| ·SNP-SNP 间相互作用关系检测 | 第44-46页 |
| ·SNP-SNP 间相互作用关系检测方法 | 第44页 |
| ·实验和结果分析 | 第44-46页 |
| ·小结 | 第46-48页 |
| 结论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 附录 A 攻读学位期间发表的论文 | 第55-56页 |
| 附录 B 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第56页 |