大刍草苗期转录组RNA-Seq数据的De novo组装和分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 前言 | 第8-26页 |
| ·玉米的进化 | 第8-14页 |
| ·测序技术进展 | 第14-22页 |
| ·Sanger测序技术 | 第14-15页 |
| ·第二代测序技术 | 第15-21页 |
| ·第三代测序 | 第21页 |
| ·高通量测序的应用 | 第21-22页 |
| ·转录组和RNA-Seq技术 | 第22-24页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-33页 |
| ·大刍草材料 | 第26页 |
| ·RNA的抽提 | 第26-27页 |
| ·cDNA文库的构建和测序 | 第27页 |
| ·测序数据的质量控制和拼接 | 第27-30页 |
| ·表达量的统计 | 第30页 |
| ·拼接转录本的注释 | 第30-31页 |
| ·对拼接结果的验证 | 第31-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-42页 |
| ·测序结果以及质量控制 | 第33-35页 |
| ·表达量的估计 | 第35-36页 |
| ·转录本的比对和注释 | 第36-39页 |
| ·拼接结果的验证 | 第39-42页 |
| 4 讨论 | 第42-46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| 附录 | 第52-67页 |
| 附录1 实验验证的引物序列 | 第52-53页 |
| 附录2 RNA的反转录 | 第53-54页 |
| 附录3 RT-PCR反应体系 | 第54页 |
| 附录4 胶回收步骤 | 第54-55页 |
| 附录5 载体连接步骤和体系 | 第55页 |
| 附录6 TA克隆步骤及菌液PCR体系 | 第55-57页 |
| 附录7 GO分类 | 第57-67页 |
| 在读期间发表的论文 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
