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极端环境中嗜铁钩端螺旋菌的选择性分离、鉴定与特性研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-14页
第一章 文献综述第14-31页
   ·微生物冶金的定义第14页
   ·微生物冶金的历史与现状第14-29页
     ·微生物冶金的历史第14-15页
     ·微生物冶金的现状第15-19页
     ·微生物冶金的反应机理第19-22页
     ·冶金微生物的研究现状第22-29页
   ·本论文研究的目的与意义第29-30页
   ·本论文的主要研究内容第30页
     ·嗜铁钩端螺旋菌的选择性分离第30页
     ·螺旋状铁氧化细菌的生理特性与鉴定第30页
     ·嗜铁钩端螺旋菌gyrB基因的克隆与序列分析第30页
     ·嗜铁钩端螺旋菌的遗传多样性第30页
     ·嗜铁钩端螺旋菌中磁性纳米颗粒的分离第30页
     ·不同铁氧化细菌合成的沉淀差异性分析第30页
     ·一株分离于酸性矿坑水的酵母菌的特性与分子鉴定第30页
   ·论文课题来源第30-31页
第二章 嗜铁钩端螺旋菌的选择性分离第31-38页
   ·前言第31页
   ·材料与方法第31-37页
     ·液体样品来源第31-32页
     ·仪器、试剂与培养基第32-33页
     ·培养技术路线第33-34页
     ·结果与分析第34-37页
   ·本章小结第37-38页
第三章 螺旋状铁氧化细菌的生理特性与分子鉴定第38-53页
   ·前言第38页
   ·材料与方法第38-40页
     ·菌株与培养基第38页
     ·试剂与仪器第38页
     ·生理生化特征第38-39页
     ·对黄铁矿的浸出效果第39页
     ·对黄铜矿的浸出效果第39页
     ·基因组DNA的提取第39页
     ·基因组G+C含量的测定第39-40页
     ·16S rDNA的PCR扩增、克隆、测序与序列分析第40页
     ·16S-23S基因间隔区序列的PCR扩增与电泳分析第40页
   ·结果与讨论第40-51页
     ·生理特征第40-48页
     ·YSK基因组G+C相对百分含量第48-50页
     ·16S rDNA PCR产物的序列分析第50-51页
     ·16S-23S间隔区(IR)PCR产物的电泳分析第51页
   ·本章小结第51-53页
第四章 嗜铁钩端螺旋菌(L.ferriphilum)gyrB基因的PCR扩增、克隆与序列分析第53-60页
   ·前言第53-54页
   ·材料与方法第54-55页
     ·菌种和培养条件第54页
     ·试剂和引物合成第54页
     ·嗜铁钩端螺旋菌YSK基因组DNA的提取第54页
     ·GyrB基因PCR扩增的简并引物的设计第54页
     ·GyrB基因的PCR扩增第54页
     ·PCR产物的克隆与测序第54-55页
   ·结果与分析第55-56页
     ·GyrB基因PCR扩增的简并引物的设计第55页
     ·YSK菌株gyrB基因的PCR扩增第55-56页
     ·GyrB基因的序列分析第56页
   ·讨论第56-59页
   ·本章小结第59-60页
第五章 嗜铁钩端螺旋菌的遗传多样性分析第60-66页
   ·前言第60页
   ·材料与方法第60-62页
     ·菌株第60-61页
     ·基因组DNA提取第61页
     ·PCR扩增第61-62页
     ·PCR产物的克隆与测序第62页
     ·序列分析第62页
   ·结果与讨论第62-65页
     ·16S rDNA序列分析第62-65页
   ·本章小结第65-66页
第六章 嗜铁钩端螺旋菌(L.ferriphilum)中天然磁性纳米颗粒的分离与纯化第66-73页
   ·前言第66-67页
   ·实验材料和方法第67-68页
     ·菌株与生长条件第67页
     ·无铁离子细胞的制备第67-68页
     ·超薄切片样品的制备第68页
     ·磁性颗粒的提取与纯化第68页
     ·透射电镜观察与X-ray能谱分析第68页
   ·结果与讨论第68-71页
     ·扫描电镜下L.ferriphilum的基本形态第68-69页
     ·透射电镜下L.ferriphilum细胞内的磁性颗粒形态第69页
     ·磁性颗粒的透射电镜观察与能谱分析第69-71页
   ·本章小节第71-73页
第七章 不同铁氧化细菌作用下形成的沉淀差异性分析第73-80页
   ·前言第73页
   ·实验材料与方法第73-74页
     ·仪器第73-74页
     ·菌种第74页
     ·培养基与细菌培养条件第74页
   ·沉淀的收集第74页
   ·沉淀的鉴定第74-75页
   ·实验结果与分析第75-79页
     ·沉淀的化学成分分析第75页
     ·沉淀的扫描电镜分析第75-76页
     ·沉淀的XRD分析第76-77页
     ·沉淀的FTIR分析第77-79页
   ·本章小节第79-80页
第八章 一株分离于酸性矿坑水的异养菌的特性与分子鉴定第80-88页
   ·前言第80页
   ·材料与方法第80-82页
     ·HJM菌株的分离与纯化第80页
     ·HJM菌株基因组DNA的提取第80页
     ·18S rDNA和26S rDNA的D1/D2区的PCR扩增第80-81页
     ·PCR扩增产物的纯化与测序第81页
     ·序列分析和系统树的构建第81页
     ·pH值对HJM菌株的生长活性影响第81页
     ·HJM菌株对不同金属离子的抗性特征第81-82页
   ·结果与分析第82-85页
     ·菌株的形态学特征第82页
     ·系统发育分析第82-85页
   ·讨论第85-86页
   ·结论第86-88页
参考文献第88-104页
致谢第104-105页
攻读学位期间主要的研究成果第105-106页

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