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新疆地区若干盐湖基于16S rDNA的原核微生物多样性研究

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一章 绪论第10-26页
   ·盐湖微生物的研究历史、现状及前景第10-13页
     ·盐湖微生物多样性第10-12页
     ·嗜盐古菌的多样性第12-13页
   ·中国盐湖微生物研究现状第13-17页
     ·我国盐湖的分布状况第13-14页
     ·新疆地区盐湖的地形地貌第14-15页
     ·中国盐湖微生物研究历史及现状第15-17页
   ·微生物多样性的研究方法概述第17-25页
     ·经典微生物生态学多样性研究方法第18-19页
     ·非培养分析法概述第19-23页
     ·非培养微生物研究的理论基础第23-24页
     ·rRNA基因序列法在微生物分子生态学的应用第24-25页
   ·研究目的及意义第25-26页
第二章 材料与方法第26-33页
   ·新疆地区八个盐湖样品的采集和保存第26页
   ·仪器和试剂第26-28页
     ·主要仪器设备第26-27页
     ·试剂第27-28页
     ·PCR及测序引物第28页
   ·方法第28-33页
     ·土样 DNA的制备第28-29页
     ·水样 DNA的制备第29页
     ·PCR扩增条件第29页
     ·PCR产物回收和纯化第29-30页
     ·16s rDNA文库的构建第30-31页
     ·质粒 DNA的提取及电泳验证第31页
     ·克隆片段序列的测定第31页
     ·序列的比较分析和系统发育树的构建第31-32页
     ·原核微生物的多样性比较分析第32-33页
第三章 实验结果第33-69页
   ·新疆地区八个盐湖采集位点第33-35页
   ·盐湖样品中微生物总DNA的提取第35-36页
   ·16s rRNA基因的扩增第36页
   ·16s rRNA基因文库克隆质粒的筛选第36-37页
   ·细菌文库16S rDNA序列的测定第37-38页
   ·新疆八个盐湖采样点细菌16S rDNA序列 Blast相似性结果第38-47页
     ·兔子湖位点第38-39页
     ·销库尔咸湖位点第39-40页
     ·罗布泊钾矿大盐池位点第40-41页
     ·巴里坤盐湖位点第41-42页
     ·伊吾盐湖位点第42-43页
     ·阿牙克库木湖位点第43-44页
     ·玛纳斯盐湖位点第44-45页
     ·阿洪库鲁木湖位点第45-47页
   ·新疆各盐湖位点的细菌16S rDNA文库系统发育分析第47-62页
     ·兔子湖位点16s rDNA系统进化分析第47页
     ·销库尔咸湖位点16s rDNA系统进化分析第47-48页
     ·罗布泊钾矿大盐池位点16s rDNA系统进化分析第48页
     ·巴里坤湖位点16s rDNA系统进化分析第48页
     ·伊吾盐湖位点16s rDNA系统进化分析第48-55页
     ·阿牙克库木湖位点16s rDNA系统进化分析第55页
     ·玛纳斯盐湖位点16s rDNA系统进化分析第55页
     ·阿洪库鲁木湖位点16s rDNA系统进化分析第55-62页
   ·嗜盐古菌16S rDNA序列相似性及系统发育分析第62-67页
     ·玛纳斯盐湖位点嗜盐古菌16s rDNA序列相似性 Blast结果第62页
     ·玛纳斯盐湖位点嗜盐古菌16s rDNA系统进化分析第62-64页
     ·阿洪库鲁木湖位点嗜盐古菌16s rDNA序列相似性 Blast结果第64-65页
     ·阿洪库鲁木湖位点嗜盐古菌16s rDNA系统进化分析第65-67页
   ·新疆八个盐湖位点多样性比较结果第67-69页
     ·细菌多样性比较结果第67页
     ·嗜盐古菌多样性比较结果第67-69页
第四章 讨论第69-78页
   ·盐湖微生物多样性研究方法的优点及其局限性第69-70页
   ·对盐湖样品16S rRNA基因文库构建过程的探讨第70-71页
     ·总 DNA的提取和纯化第70-71页
     ·PCR反应的偏向性第71页
   ·16S rRNA基因数据的处理及分析第71-73页
     ·选择16S rRNA基因作为分类指标的优势第71-72页
     ·构建系统发育树图方法的探讨第72-73页
     ·16S rRNA基因数据的统计学分析第73页
   ·各个盐湖位点的细菌类群多样性第73-76页
     ·新疆地区盐湖位点总体的细菌类群多样性第73-74页
     ·盐湖中的优势类群—变形细菌(Proteobacteria)第74-75页
     ·盐湖中的另一优势类群—革兰氏阳性细菌第75-76页
     ·盐湖中的其他类群第76页
   ·玛纳斯盐湖位点和阿洪库鲁木湖位点嗜盐古菌多样性比较探讨第76-78页
第五章 总结与展望第78-79页
参考文献(References)第79-89页
附录在读硕士学位期间发表文章第89-90页
致谢第90页

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