| 中文摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-18页 |
| ·非编码RNA的概述 | 第12-14页 |
| ·长非编码RNA的功能研究进展 | 第14-16页 |
| ·参与X染色体随机失活 | 第14-15页 |
| ·参与基因组印记调控 | 第15页 |
| ·参与RNA/蛋白质复合体形成 | 第15-16页 |
| ·猪肌肉表型调控的研究进展 | 第16-17页 |
| ·TncRNA的研究进展 | 第17-18页 |
| 2 研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 3 材料与方法 | 第19-36页 |
| ·材料与试剂 | 第19-23页 |
| ·DNA样和组织样 | 第19页 |
| ·DNA样品 | 第19页 |
| ·组织样品 | 第19页 |
| ·载体和菌株 | 第19-21页 |
| ·主要试剂及来源 | 第21-22页 |
| ·常用试剂的配制 | 第22页 |
| ·主要仪器设备 | 第22页 |
| ·主要分子生物学数据库及生物学软件 | 第22-23页 |
| ·主要数据库 | 第22-23页 |
| ·常用分析软件 | 第23页 |
| ·方法 | 第23-36页 |
| ·总RNA提取、完整性检测和DNaseⅠ处理 | 第23-25页 |
| ·总RNA提取采用两种方法 | 第23-24页 |
| ·RNA的完整性检测 | 第24页 |
| ·总RNA的无RNase的DNase-Ⅰ处理及其纯化 | 第24页 |
| ·RNA的反转录 | 第24-25页 |
| ·ncRNA的分离 | 第25页 |
| ·TncRNA的鉴定 | 第25-29页 |
| ·TncRNA的基因组序列分离 | 第25-28页 |
| ·3'RACE实验 | 第28页 |
| ·RT-PCR和QPCR分析 | 第28-29页 |
| ·TncRNA的生物信息学分析 | 第29页 |
| ·TncRNA的RH定位 | 第29页 |
| ·人类TncRNA启动子的活性分析 | 第29-33页 |
| ·人类TncRNA启动子的克隆 | 第29-30页 |
| ·人类TncRNA启动子报告载体的构建 | 第30-32页 |
| ·细胞培养和瞬时转染 | 第32页 |
| ·荧光素酶相对活性的检测 | 第32-33页 |
| ·人类TncRNA RNAi的靶序列设计以及载体构建 | 第33-34页 |
| ·人类TncRNA RNAi的靶序列设计 | 第33页 |
| ·pSilencer 4.1-CMV-neo载体的改造和验证 | 第33-34页 |
| ·人类TncRNA shRNA载体的构建 | 第34页 |
| ·猪TncRNA SNP鉴定、分型和关联分析 | 第34-36页 |
| ·引物设计 | 第34页 |
| ·PCR扩增 | 第34页 |
| ·试验猪群与测定性状 | 第34-35页 |
| ·数据处理和统计分析 | 第35-36页 |
| 4 结果 | 第36-65页 |
| ·猪TncRNA的分离鉴定 | 第36-52页 |
| ·猪ncRNA的分离 | 第36-37页 |
| ·TncRNA的基因组结构分析和全长cDNA预测 | 第37-45页 |
| ·各物种TncRNA ESTs的钓取与基因组结构分析 | 第37-41页 |
| ·TncRNA的选择性剪接分析 | 第41-43页 |
| ·各物种间TncRNA的序列比对 | 第43-45页 |
| ·猪TncRNA的染色体定位 | 第45-46页 |
| ·TncRNA时空表达谱结果 | 第46-49页 |
| ·猪TncRNA的时空表达谱结果 | 第46-48页 |
| ·人类TncRNA的表达谱结果 | 第48-49页 |
| ·TncRNA RNA二级结构的预测结果 | 第49-52页 |
| ·物种间保守区RNA二级结构预测 | 第49-50页 |
| ·全序列范围RNA二级结构以及功能位点预测 | 第50-52页 |
| ·人类TncRNA启动子活性分析 | 第52-59页 |
| ·启动子克隆和生物信息学分析 | 第52-53页 |
| ·缺失表达载体的构建 | 第53-54页 |
| ·荧光素酶相对活性检测结果 | 第54-57页 |
| ·核心区反式作用因子分析 | 第57-59页 |
| ·TncRNA RNA干扰载体的构建 | 第59-62页 |
| ·干扰载体的改造 | 第59-60页 |
| ·TncRNA RNAi干扰载体的初步构建 | 第60-62页 |
| ·猪TncRNA的多态检测和关联分析 | 第62-65页 |
| ·猪TncRNA的的遗传多态性检测结果 | 第62-63页 |
| ·猪TncRNA多态与部分性状的关联分析 | 第63-65页 |
| 5 讨论 | 第65-69页 |
| 6 小结 | 第69-71页 |
| ·本研究获得的主要结果 | 第69页 |
| ·本研究的创新点与特色 | 第69-70页 |
| ·本研究的不足之处 | 第70页 |
| ·下一步的思路 | 第70-71页 |
| 7 研究生期间开展的其他工作 | 第71-74页 |
| ·GLGI实验 | 第71-72页 |
| ·猪CAV3启动子的克隆与分析 | 第72-73页 |
| ·其他基因克隆方面的工作 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 附录 | 第83-87页 |
