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人Coactosin Like Protein及MICAL1 Calponin Homolgy结构域的结构与功能研究

摘要第1-8页
Abstract第8-11页
第一章 综述:含ADF-H结构域蛋白质家族的结构和功能第11-38页
 1.含ADF-H结构域的蛋白质家族的来源和分类第11-13页
 2.含ADF-H结构域的蛋白质家族的功能第13-22页
   ·ADF/cofilin的功能第13-17页
   ·twinfilin的功能第17-20页
   ·Drebrin/Abpls的功能第20-21页
   ·Coactosin/CLPs的功能第21-22页
 3.ADF-H结构域的结构以及它们与actin的相互作用第22-25页
 4.ADF/cofilin的磷酸化和pH效应第25-26页
 5.ADF/cofilin和其它ABPs的关系第26-29页
   ·ADF/cofilin-actin与其它ABP的三重复合物第27-28页
   ·ADF/cofilin对Tropomyosin与F-actin结合的调控第28-29页
 6.展望第29页
 参考文献第29-38页
第二章 human coactosin like protein(hCLP)的溶液结构及其与F-actin的结合模型第38-92页
 第一部分:hCLP介绍第38-39页
 第二部分:材料和方法第39-62页
  1.hCLP基因的引物设计及PCR第39-41页
  2.PCR产物胶回收和含hCLP基因的T载体的克隆第41-42页
  3.表达载体的构建第42-45页
  4.大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒(连接反应物)的转化第45页
  5.hCLP的表达与纯化第45-46页
  6.蛋白质浓度的测定第46-47页
  7.hCLP的稳定性实验第47页
  8.~(15)N-标记和~(15)N,~(13)C双标记重组人hCLP蛋白质的生产第47-48页
  9.NMR实验与数据变换第48-50页
  10.主链顺序认证及侧链化学位移的获得第50-53页
  11.氢氘交换实验第53页
  12.CSI进行二级结构预测第53-54页
  13.结构计算第54-57页
  14.主链驰豫的测定第57页
  15.肌动蛋白的抽提和纯化第57-59页
  16.hCLP的点突变和突变蛋白质的表达第59页
  17.圆二色光谱(CD)第59-60页
  18.超速离心共沉降实验第60页
  19.NMR滴定实验第60-61页
  20.Docking实验第61-62页
 第三部分:结果和讨论第62-88页
  1.hCLP的基因克隆和表达载体构建第62页
  2.hCLP的表达和纯化第62-63页
  3.hCLP容易被蛋白酶从C末端降解,而EDTA可以抑制这种降解第63-64页
  4.hCLP的均一性分析第64-65页
  5.hCLP D123N的化学位移认证第65-66页
  6.hCLP的氢氘交换实验第66页
  7.CSI方法对hCLP的二级结构分析第66-67页
  8.hCLP的蛋白质的结构计算和结构描述第67-70页
  9.hCLP的结构与ADF-H家族蛋白质的结构比较第70-72页
  10.hCLP的结构与gelsolin家族的结构比较第72-74页
  11.hCLP的主链动力学实验说明hCLP的β4和β5之间的区域有很大的柔性第74-76页
  12.actin的纯化以及NMR滴定实验第76-79页
  13.hCLP点突变的选择以及突变蛋白质的纯化第79页
  14.hCLP以及其突变蛋白质与F-actin的超速离心共沉降实验第79-81页
  15.hCLP与F-actin的复合物的结构模型第81-84页
  16.对于实验结果的讨论第84-88页
 参考文献第88-92页
第三章 综述:CH结构域的结构与功能第92-108页
 1.CH结构域的来源及含CH结构域蛋白的分类第92页
 2.CH结构域的结构特点第92-93页
 3.由CH1和CH2结构域组成的actin结合结构域第93-98页
   ·ABD与F-actin的结合第94-96页
   ·ABD的调控第96-97页
   ·Fimbrin第97-98页
   ·CH结构域之间的linker第98页
 4.单独地CH2类结构域第98-99页
   ·Smoothelin第99页
   ·MICAL第99页
   ·EB家族第99页
 5.CH3类蛋白质家族第99-101页
   ·Calponin第100页
   ·Vav家族第100-101页
   ·IQGAP第101页
 6.CH4/CH5结构域第101页
 7.总结和展望第101-102页
 参考文献第102-108页
第四章 MICAL_1 CH结构域的溶液结构和功能研究第108-138页
 第一部分:引言第108-110页
 第二部分:材料和方法第110-119页
  1.MICAL_1的CH结构域的克隆和表达载体的构建第110-111页
  2.MICAL_1 CH的表达与纯化第111-113页
  3.蛋白质浓度的测定第113页
  4.MICAL_1 CH的稳定性实验第113页
  5.GST MICAL_1 CH的构建和表达纯化第113-114页
  6.MICAL_1 CH的均一性实验第114页
  7.~(15)N-标记和~(15)N,~(13)C双标记重组人MICAL_1 CH蛋白质的生产第114页
  8.NMR实验与结构计算第114-117页
  9.vimentin的构建、表达和纯化第117页
  10.MICA_1 CH和vimentin的GST pull down实验第117-118页
  11.MICA_1 CH和filament actin的共沉降实验第118页
  12.F-actin对MICAL_1 CH的滴定第118-119页
  13.PiP_2的粗产物的抽提以及对MICAL_1 CH的滴定第119页
 第三部分:结果和讨论第119-134页
  1.一组蛋白质结构域的克隆和表达的结果第119-120页
  2.MICA_1 CH的表达和纯化第120-121页
  3.MICA_1 CH在溶液中是以单体存在的第121-122页
  4.MICAL_1 CH的近紫外CD结果第122-123页
  5.MICAL_1 CH的化学位移认证第123-125页
  6.MICAL_1 CH的氢氘交换实验第125页
  7.MICAL_1 CH的蛋白质的结构计算和结构描述第125-127页
  8.MICAL_1 CH的结构与其它CH结构域的结构比较第127-129页
  9.MICAL_1 CH的不能独自与F-actin作用第129-132页
  10.MICAL_1 CH可能不与vimentin作用第132-133页
  11.MICAL_1 CH的可能的功能第133-134页
 参考文献第134-138页
致谢第138-139页
发表论文第139页
学术会议第139页

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