| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-10页 |
| 缩略语表 | 第10-12页 |
| 中文目录 | 第12-20页 |
| 第一部分 研究综述 | 第20-38页 |
| 第一章 微卫星DNA遗传分析在原生动物学中的研究进展 | 第20-32页 |
| 1 微卫星DNA遗传标记简介 | 第21-23页 |
| ·微卫星DNA的发现 | 第21-22页 |
| ·微卫星DNA的性质 | 第22-23页 |
| ·微卫星DNA的研究方法 | 第23页 |
| 2 微卫星DNA在原生动物研究中的应用 | 第23-29页 |
| ·群体遗传学研究 | 第24-25页 |
| ·检测寄生原生动物 | 第25-26页 |
| ·高分辨率的种株鉴定和基因分型 | 第26-28页 |
| ·寄生原生动物与寄主关系分析 | 第28-29页 |
| ·基因定位用于构建遗传连锁图谱 | 第29页 |
| 3 研究前景 | 第29-32页 |
| ·对微卫星局限性的改进方法 | 第29-30页 |
| ·微卫星DNA在原生动物学研究中的展望 | 第30-32页 |
| ·遗传多样性 | 第30页 |
| ·原生动物遗传关系的研究 | 第30-32页 |
| 第二章 ISSR分子标记技术研究进展 | 第32-38页 |
| 1 ISSR分子标记技术的原理和特点 | 第32-33页 |
| 2 ISSR的实验技术要点 | 第33-34页 |
| 3 ISSR的应用 | 第34-38页 |
| ·种株鉴定 | 第34页 |
| ·物种和种群亲缘关系研究 | 第34-35页 |
| ·检测种群的遗传多样性 | 第35-38页 |
| 第二部分 微卫星DNA | 第38-76页 |
| 第三章 寄生类原生动物的微卫星引物在自由生活原生动物中适用性研究 | 第38-48页 |
| 1 前言 | 第38页 |
| 2 实验材料和方法 | 第38-40页 |
| ·实验材料的培养 | 第38-39页 |
| ·DNA提取 | 第39页 |
| ·PCR和电泳条件 | 第39-40页 |
| ·连接和转化 | 第40页 |
| ·克隆测序 | 第40页 |
| 3 结果 | 第40-44页 |
| 4 讨论 | 第44-48页 |
| ·微卫星引物的适用性和微卫星位点的特异性 | 第44-46页 |
| ·微卫星位点的筛选 | 第46-48页 |
| 第四章 小眼虫和嗜热四膜虫微卫星DNA的筛选、克隆和特征分析 | 第48-64页 |
| 1 实验材料和方法 | 第48-53页 |
| ·实验材料的培养 | 第48-50页 |
| ·DNA的提取 | 第50页 |
| ·RAPD扩增和电泳的条件 | 第50页 |
| ·Southern杂交 | 第50-52页 |
| ·连接和转化 | 第52页 |
| ·原位杂交和阳性克隆的测序 | 第52页 |
| ·微卫星的扩增 | 第52-53页 |
| 2 结果 | 第53-59页 |
| ·RAPD指纹图谱 | 第53-54页 |
| ·Southern杂交和原位杂交 | 第54-55页 |
| ·原位杂交 | 第55-56页 |
| ·微卫星位点 | 第56-58页 |
| ·小眼虫基因组中微卫星DNA的丰度 | 第58页 |
| ·单核苷酸重复 | 第58-59页 |
| 3 讨论 | 第59-64页 |
| ·微卫星DNA的丰度 | 第60-61页 |
| ·单核苷酸重复 | 第61-62页 |
| ·纤毛虫和鞭毛虫之间的比较 | 第62页 |
| ·关于RAMS方法 | 第62-64页 |
| 第五章 七株眼虫基于微卫星DNA指纹图谱的区分和关系分析 | 第64-76页 |
| 1 实验材料和方法 | 第64-67页 |
| ·种株来源 | 第64-65页 |
| ·DNA提取 | 第65-66页 |
| ·PCR扩增 | 第66页 |
| ·聚丙烯酰胺电泳 | 第66-67页 |
| ·数据分析 | 第67页 |
| 2 实验结果 | 第67-71页 |
| ·形态比较 | 第67-68页 |
| ·微卫星DNA指纹 | 第68-69页 |
| ·遗传变异 | 第69-71页 |
| ·相似树 | 第71页 |
| 3 讨论 | 第71-76页 |
| ·株系区分和微卫星DNA指纹标记的优点 | 第72-73页 |
| ·种之间的关系 | 第73-76页 |
| 第三部分 ISSR技术 | 第76-112页 |
| 第六章 五株纤毛虫遗传关系的ISSR分析 | 第76-86页 |
| 1 材料和方法 | 第77-78页 |
| ·样品的采集、分离和DNA提取 | 第77页 |
| ·ISSR-PCR扩增 | 第77-78页 |
| ·数据分析 | 第78页 |
| 2 结果 | 第78-81页 |
| ·电泳结果 | 第78-79页 |
| ·遗传距离 | 第79-80页 |
| ·遗传关系树 | 第80-81页 |
| 3 讨论 | 第81-86页 |
| ·缘毛类纤毛虫分类地位分析 | 第81-82页 |
| ·寡膜纲中三亚纲纤毛虫间的遗传关系分析 | 第82-83页 |
| ·纤毛虫基因组中微卫星DNA | 第83-86页 |
| 第七章 五种缘毛类纤毛虫遗传关系的ISSR研究 | 第86-96页 |
| 1 实验材料和方法 | 第86-90页 |
| ·种类来源和DNA提取 | 第86-87页 |
| ·ISSR-PCR扩增 | 第87-89页 |
| ·电泳条件 | 第89页 |
| ·ISSR数据分析 | 第89页 |
| ·SSrRNA基因数据分析 | 第89-90页 |
| 2 实验结果 | 第90-93页 |
| ·ISSR指纹图谱 | 第90页 |
| ·遗传变异 | 第90-92页 |
| ·系统发育树 | 第92-93页 |
| 3 讨论 | 第93-96页 |
| ·Carchesium polypinum的系统发育地位 | 第93-94页 |
| ·三种Epistylis的遗传关系 | 第94-95页 |
| ·SSrRNA基因序列分子树的缺点和ISSR分子标记的优点 | 第95-96页 |
| 第八章 螅状独缩虫种群遗传结构的ISSR分析：多样性高而种群分化低 | 第96-112页 |
| 1 实验材料和方法 | 第97-101页 |
| ·样品来源 | 第97-98页 |
| ·DNA提取 | 第98页 |
| ·ISSR-PCR扩增和PCR条件的优化 | 第98-100页 |
| ·电泳条件 | 第100页 |
| ·数据分析 | 第100-101页 |
| 2 实验结果 | 第101-108页 |
| ·ISSR扩增图谱 | 第101页 |
| ·遗传多样性和遗传变异 | 第101-105页 |
| ·株之间的遗传关系 | 第105-107页 |
| ·遗传距离和地理距离之间的关系 | 第107-108页 |
| 3 讨论 | 第108-112页 |
| ·高遗传多样性 | 第108-109页 |
| ·低种群分化 | 第109-110页 |
| ·遗传距离和地理距离之间的关系 | 第110页 |
| ·生物地理格局 | 第110-112页 |
| 总结 | 第112-116页 |
| 参考文献 | 第116-134页 |
| 附件一 攻读博士期间发表文章及奖励 | 第134-137页 |
| 致谢 | 第137-139页 |
