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苎麻纤维素合成酶基因cDNA的克隆及功能分析

中文摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一章 文献综述第11-27页
 1 纤维素生物合成研究进展第11-13页
   ·纤维素的结构及其作用第11-12页
   ·纤维素体外合成的研究概况第12页
   ·植物纤维素生物合成途径研究进展第12-13页
 2 植物纤维素合成酶基因研究进展第13-24页
   ·植物纤维素合成酶基因的发现第13-15页
   ·植物纤维素合成酶的基因结构第15-16页
   ·纤维素合成酶的超家族和纤维素合成酶相似蛋白第16-19页
     ·CesA与Csl蛋白的超家族第18-19页
   ·植物纤维素合成酶的时空表达规律第19-20页
   ·纤维素的生物合成是多个纤维素合成酶基因协同作用的结果第20-23页
   ·参与纤维素生物合成的其它基因第23-24页
 3 问题与展望第24-25页
 4 本研究拟解决的问题第25-27页
第二章 苎麻纤维素合成酶基因BnCesA1的克隆及序列分析第27-58页
 1 材料与试剂第27-28页
   ·植物材料第27页
   ·菌株第27页
   ·酶与试剂盒第27页
   ·试剂第27-28页
 2 实验方法第28-40页
   ·苎麻RNA的提取及RNA质量检测第28-29页
     ·植物RNA的抽提第28页
     ·检测所抽提的RNA质量第28-29页
     ·RNA电泳点样第29页
     ·测定所抽提RNA的OD_(260)及OD_(260)/OD_(280)值第29页
   ·用RT-PCR的方法获得苎麻纤维素合成酶基因中间保守片段第29-34页
     ·简并引物的设计第29页
     ·苎麻cDNA第一链的合成第29-30页
     ·苎麻BnCesA1基因中间保守片段的PCR扩增第30-31页
       ·简并引物最佳退火的确定第30-31页
       ·PCR反应最佳Mg~(2+)浓度的确定第31页
       ·BnCesA1基因中间保守片段的PCR扩增第31页
     ·切胶回收目的基因片段第31-32页
     ·将回收的目的基因片段克隆到pMD18-T Vector上第32页
     ·大肠杆菌CaCl_2法制备及转化感受态细胞第32页
     ·目的基因的鉴定及测序第32-34页
       ·菌落PCR鉴定第32-33页
       ·质粒双酶切鉴定第33-34页
   ·5′RACE获得5′端目的基因第34-38页
     ·5′RACE法原理示意图第34页
     ·引物设计及PCR扩增第34-38页
       ·引物设计第34-35页
       ·苎麻mRNA的分离第35-36页
       ·苎麻cDNA第一链的合成第36页
       ·Hybrid RNA的分解第36-37页
       ·单链cDNA环化第37页
       ·第一轮反向PCR扩增反应第37页
       ·第二轮反向PCR扩增反应第37-38页
   ·3′RACE获得3′端目的基因第38-40页
     ·3′RACE原理图第38页
     ·引物设计及PCR扩增第38-40页
       ·引物设计第38页
       ·苎麻cDNA第一链的合成及目的片段扩增第38-40页
   ·苎麻纤维素合成酶基因(BnCesA1)序列的生物信息学分析第40页
 3 结果与分析第40-55页
   ·苎麻总RNA提取第40页
   ·BnCesA1基因中间片段的克隆第40-42页
   ·BnCesA1基因3′端序列的克隆第42页
   ·BnCesA1基因5′端序列的克隆第42-44页
   ·BnCesA1基因序列拼接及生物信息学分析第44-55页
     ·核苷酸序列分析第44-47页
     ·氨基酸序列分析第47-53页
     ·BnCesA1基因编码蛋白质结构特征分析第53-55页
       ·功能性模体的搜索第53-54页
       ·跨膜区的预测第54-55页
       ·保守结构域的预测第55页
 4 讨论第55-58页
   ·关于RACE技术第55-56页
   ·对于TAKARA公司5′RACE技术的探讨第56-58页
第三章 BnCesA1基因组织表达情况的研究第58-71页
 1 材料与试剂第58页
   ·酶与试剂第58页
 2 实验方法第58-62页
   ·不同组织总RNA的提取第58-59页
   ·苎麻cDNA第一链的合成第59页
   ·半定量RT-PCR表达分析引物设计第59页
   ·表达分析PCR扩增反应条件优化第59-61页
     ·EX1-2引物最佳退火温度的优化第59-60页
     ·PCR扩增反应Mg~(2+)浓度优化第60页
     ·PCR反应循环数的确定第60页
     ·内参18S rRNA基因扩增第60-61页
       ·18S rRNA基因扩增反应Mg~(2+)浓度优化第61页
   ·不同组织BnCesA1基因的扩增第61-62页
   ·数据分析第62页
 3 结果与分析第62-68页
   ·不同组织RNA提取结果第62页
   ·PCR扩增体系的优化第62页
   ·EX1、EX2引物反应条件优化结果第62-68页
     ·Mg~(2+)浓度优化第62-63页
     ·EX1-2引物退火温度优化第63页
     ·内参18S rRNA基因扩增条件优化第63-64页
       ·Mg~(2+)梯度优化第63-64页
     ·循环数对平台期的影响第64-66页
     ·对苎麻BnCesA1基因在不同组织表达定量的结果第66-68页
 4 讨论第68-71页
   ·关于半定量RT-PCR第68-69页
   ·关于BnCesA1基因的表达第69-71页
第四章 BnCesA1基因核心区段反义表达载体的构建及对烟草的转化第71-91页
 1 材料与试剂第71-72页
   ·菌株与质粒第71页
   ·植物材料及培养基第71-72页
   ·酶与试剂盒第72页
   ·试剂第72页
 2 实验方法第72-78页
   ·引物设计及反义片段的PCR扩增第72-73页
     ·引物设计第72页
     ·目的基因BnCesA的扩增第72-73页
   ·反义植物表达载体pWM-BnCesA的构建及检测第73-74页
     ·反义表达载体pWM-BnCesA的构建第73-74页
     ·反义表达载体pWM-BnCesA的菌落PCR及酶切检测第74页
   ·反义表达载体pWM-BnCesA转化根癌农杆菌第74-75页
     ·农杆菌感受态细胞的制备和转化第75页
   ·叶盘法转化烟草第75-76页
     ·农杆菌的培养第75-76页
     ·共培养第76页
     ·诱导丛生芽第76页
     ·诱导生根第76页
     ·再生植株的移栽第76页
   ·转基因烟草的PCR检测第76-78页
     ·CTAB法抽提植物总DNA第76-77页
     ·转基因烟草的PCR检测第77-78页
       ·标记基因Hyg~r的PCR检测第77-78页
       ·目的基因BnCesA1的检测第78页
   ·转基因烟草组织切片检测第78页
   ·转基因烟草表型观察第78页
 3 结果与分析第78-87页
   ·反义植物表达载体pWM-BnCes的构建流程第78-79页
   ·BnCesA1基因反义片段与pWM101载体的双酶切结果第79-80页
   ·反义表达载体pWM-BnCesA的菌落PCR和酶切检测第80-81页
   ·反义表达载体pWM-BnCesA转化农杆菌LBA4404的检测第81页
   ·叶盘法转化烟草第81-84页
     ·共培养第81-82页
     ·诱导丛生芽第82-83页
     ·诱导生根第83页
     ·移栽第83-84页
   ·反义转基因烟草的PCR检测第84-85页
   ·转基因烟草茎部组织切片观察第85-86页
   ·转基因烟草表型观察第86-87页
 4 讨论第87-91页
   ·反义RNA技术的基本原理第87-88页
     ·反义RNA技术的基本原理第87页
     ·反义RNA靶序列的确定第87-88页
     ·反义表达载体的构建第88页
   ·叶盘法转化烟草第88-91页
     ·共培养第88-89页
     ·诱导丛生芽第89页
     ·诱导生根第89页
     ·移栽第89-91页
第五章 结论第91-92页
参考文献第92-97页
附录A.BnCesA1基因中间片段测序报告第97-101页
附录B.BnCesA1基因3′RACE测序报告第101-104页
附录C.BnCesA1基因5′RACE测序报告第104-105页
附录D.BnCesA1基因登陆GenBank第105-107页
附录E.转基因烟草反义片段测序报告第107-108页
附录F.缩略词表第108-109页
附录G.主要试剂配置第109-111页
附录H.载体图谱第111-112页
致谢第112-113页
作者简介第113页

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