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树干毕赤酵母cDNA文库构建及EST序列测定

前言第1-11页
第一章 文献综述第11-24页
 1 木糖发酵第11-13页
   ·燃料酒精第11页
   ·植物纤维原料第11-12页
   ·木糖代谢途径第12-13页
   ·菌种选育第13页
 2 树干毕赤酵母第13-15页
   ·遗传基因研究第13-14页
   ·基因改良第14-15页
 3 cDNA 文库第15-20页
   ·基因组文库与cDNA文库第15-16页
   ·cDNA文库的载体系统第16-17页
   ·cDNA文库构建方法进展第17-19页
     ·差减cDNA 文库第17-18页
     ·标准化cDNA 文库第18页
     ·标准化cDNA 差减文库第18页
     ·cDNA PCR文库与RACE cDNA 文库第18-19页
   ·cDNA 文库的质量第19页
   ·cDNA 文库的应用第19-20页
     ·筛选与性状相关的重要基因第20页
     ·结合芯片技术对生物体基因的时空表达进行研究第20页
     ·为EST的开发提供材料第20页
 4 EST技术及其应用第20-24页
   ·EST技术第20-21页
   ·EST技术的应用第21-22页
     ·构建遗传学图谱第21页
     ·分离与鉴定新基因第21-22页
     ·基因差异表达的研究第22页
     ·用于制备DNA 芯片第22页
   ·酵母基因组计划与EST第22-24页
第二章 树干毕赤酵母 RNA提取第24-35页
 1 基本原理第24页
 2 试剂及实验准备第24页
   ·试剂第24页
   ·实验准备第24页
 3 检测方法第24-25页
 4 菌种及细胞培养第25页
 5 操作步骤第25-26页
   ·以TRIZOL 试剂提取RNA第25页
   ·用变性裂解液提取RNA第25-26页
 6 结果与讨论第26-34页
   ·不同菌株的RNA 提取第26-28页
   ·不同方法提取RNA第28-31页
     ·匀浆法第28-29页
     ·玻砂法第29-30页
     ·液氮法第30-31页
     ·液氮速冻加液氮研磨第31页
   ·试剂选择第31-32页
   ·比例放大第32-34页
 7 小结第34-35页
第三章 树干毕赤酵母cDNA 文库构建第35-52页
 1 基本原理第35页
 2 实验试剂第35页
 3 检测方法第35-36页
 4 实验材料第36页
 5 操作步骤第36-41页
   ·mRNA分离与纯化第36-37页
     ·冲冼链霉亲和素磁珠第36页
     ·探针退火第36页
     ·捕获并清洗已退火的Oligo (dT)-m RNA杂合体第36页
     ·mRNA的洗脱第36页
     ·浓缩mRNA第36-37页
   ·第一链cDNA 的合成第37页
   ·第二链cDNA 的合成第37页
   ·cDNA 末端的补平第37-38页
   ·EcoR I 接头的连接第38页
   ·EcoR I 末端磷酸化第38页
   ·用Xho I 消化第38页
   ·cDNA 大小片段筛选第38-39页
   ·cDNA 与质粒载体相连第39页
   ·连接产物纯化第39页
   ·转化宿主菌第39页
   ·文库库滴度测定第39-40页
   ·插入片段大小检测第40页
   ·文库扩增第40-41页
 6 结果与讨论第41-51页
   ·mRNA纯化第41-42页
   ·cDNA 双链合成第42-44页
   ·cDNA 片段大小筛选第44-46页
   ·cDNA 文库滴度测定第46-50页
     ·初级文库滴度第47-48页
     ·扩增文库总克隆数测定第48-50页
   ·插入片段大小检测第50-51页
 7 小结第51-52页
第四章 EST 序列测定及后期设想第52-67页
 1 EST序列测定第52-65页
   ·基本原理第52页
   ·实验试剂及仪器第52页
   ·材料第52页
   ·操作步骤第52-55页
     ·铺布蓝白斑平板第53页
     ·大规模质粒提取第53-54页
     ·大规模质粒测序PCR反应第54页
     ·大规模测序PCR反应产物纯化第54-55页
     ·测序样品上机运行第55页
   ·结果与讨论第55-65页
     ·质粒提取第55-56页
     ·大规模EST序列获得第56-65页
 2 后期设想第65-66页
   ·EST数据分析第65-66页
     ·连续重叠群与EST的聚类第65页
     ·EST与数据库同源性比较第65-66页
   ·DNA 芯片制备第66页
 3 小结第66-67页
第五章 总结第67-69页
 1 RNA 提取第67页
 2 cDNA 文库构建第67页
 3 EST序列测定第67-68页
 4 cDNA 文库及EST应用第68页
 5 几点创新第68-69页
参考文献第69-73页
详 细 摘 要第73-76页

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