| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 目录 | 第8-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-58页 |
| ·鱼类线粒体DNA研究新进展 | 第14-35页 |
| ·鱼类mtDNA的组成及特征 | 第14-24页 |
| ·鱼类mtDNA非编码区结构研究进展 | 第24-28页 |
| ·鱼类mtDNA多态性及其应用进展 | 第28-35页 |
| ·性别决定基因的研究进展 | 第35-56页 |
| ·SRY／Sry基因 | 第36-38页 |
| ·SOX／Sox基因家族 | 第38-47页 |
| ·与性别决定相关的其它基因 | 第47-49页 |
| ·鱼类性别决定基因的研究进展 | 第49-56页 |
| ·本研究的目的和内容 | 第56-58页 |
| 第二章 异源四倍体鲫鲤线粒体基因组的全序列和结构研究 | 第58-94页 |
| ·材料与方法 | 第58-60页 |
| ·实验材料 | 第58-59页 |
| ·总DNA的提取 | 第59页 |
| ·引物设计和PCR扩增 | 第59-60页 |
| ·线粒体基因组各片段的测序 | 第60页 |
| ·全序列的拼接 | 第60页 |
| ·全序列分析方法 | 第60页 |
| ·结果与分析 | 第60-79页 |
| ·引物的筛选和分析 | 第60-63页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组全序列的PCR扩增结果 | 第63页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组结构 | 第63-66页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组酶切图谱分析 | 第66-70页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组的控制区分析 | 第70页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组中蛋白质编码基因的分析 | 第70-72页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组中tRNA基因的组成及二级结构分析 | 第72-77页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体基因组中rRNA基因及二级结构分析 | 第77-79页 |
| ·讨论 | 第79-94页 |
| 第三章 异源四倍体鲫鲤与其父母本线粒体基因组的比较研究 | 第94-120页 |
| ·材料与方法 | 第94-95页 |
| ·实验材料 | 第94页 |
| ·实验方法 | 第94-95页 |
| ·结果与分析 | 第95-104页 |
| ·红鲫线粒体基因组结构 | 第95页 |
| ·异源四倍体鲫鲤与其父母本线粒体基因组结构的比较 | 第95-97页 |
| ·异源四倍体鲫鲤与其父母本线粒体基因组碱基组成的比较 | 第97-98页 |
| ·异源四倍体鲫鲤与其父母本线粒体基因组蛋白质编码基因的比较 | 第98-101页 |
| ·异源四倍体鲫鲤与其父母本线粒体基因中rRNA基因的比较 | 第101-102页 |
| ·异源四倍体鲫鲤与其父母本线粒体基因组tRNA基因的比较 | 第102-103页 |
| ·异源四倍体鲫鲤与其父母本mtDNA各合并序列的比较 | 第103-104页 |
| ·系统进化树分析 | 第104页 |
| ·讨论 | 第104-120页 |
| 第四章 三倍体湘云鲫线粒体基因组遗传重组的证据 | 第120-146页 |
| ·材料与方法 | 第120-121页 |
| ·实验材料 | 第120页 |
| ·实验方法 | 第120-121页 |
| ·结果与分析 | 第121-130页 |
| ·三倍体湘云鲫COⅢ基因的PCR结果及序列分析 | 第121-122页 |
| ·三倍体湘云鲫线粒体基因组结构 | 第122页 |
| ·三倍体湘云鲫与其父母本线粒体基因组结构的比较 | 第122-124页 |
| ·三倍体湘云鲫与其父母本线粒体基因组碱基组成的比较 | 第124-126页 |
| ·三倍体湘云鲫与其父母本线粒体基因组蛋白质编码基因密码子使用的比较 | 第126-128页 |
| ·三倍体湘云鲫与其父母本mtDNA各区核苷酸的比较分析 | 第128-129页 |
| ·系统进化树分析 | 第129-130页 |
| ·讨论 | 第130-146页 |
| 第五章 三倍体鲤鱼(T_3)线粒体DNA遗传变异的分析 | 第146-163页 |
| ·材料与方法 | 第146-147页 |
| ·实验材料 | 第146页 |
| ·实验方法 | 第146-147页 |
| ·结果与分析 | 第147-160页 |
| ·三倍体鲤鱼(T_3)COⅢ基因的PCR结果及序列分析 | 第147-148页 |
| ·三倍体鲤鱼(T_3)mtDNA其它部分基因的PCR结果及序列分析 | 第148-149页 |
| ·三倍体鲤鱼(T_3)与其父母本mtDNA各区核苷酸序列的比较 | 第149-160页 |
| ·系统进化树分析 | 第160页 |
| ·讨论 | 第160-163页 |
| 第六章 不同倍性鲤科鱼类线粒体DNA控制区的比较研究 | 第163-176页 |
| ·材料与方法 | 第163-165页 |
| ·总DNA的提取 | 第163页 |
| ·引物设计、PCR扩增和序列测定 | 第163-164页 |
| ·序列的排列 | 第164-165页 |
| ·结果与分析 | 第165-174页 |
| ·线粒体DNA控制区的PCR结果 | 第165页 |
| ·线粒体DNA控制区的序列长度和碱基组成 | 第165-167页 |
| ·线粒体DNA控制区的终止序列区 | 第167-172页 |
| ·线粒体DNA控制区的中央保守区 | 第172-173页 |
| ·线粒体DNA控制区的保守序列区 | 第173页 |
| ·线粒体DNA控制区的系统进化树分析 | 第173-174页 |
| ·讨论 | 第174-176页 |
| 第七章 异源四倍体鲫鲤线粒体DNA群体遗传多样性研究 | 第176-186页 |
| ·材料与方法 | 第177-178页 |
| ·实验材料 | 第177页 |
| ·总DNA的提取 | 第177页 |
| ·引物设计、PCR扩增和序列测定 | 第177-178页 |
| ·数据分析方法 | 第178页 |
| ·结果与分析 | 第178-183页 |
| ·异源四倍体鲫鲤总DNA的抽提结果 | 第178页 |
| ·异源四倍体鲫鲤线粒体tRNA-Thr基因、tRNA-Phe基因以及控制区部分序列PCR扩增结果 | 第178-179页 |
| ·异源四倍体鲫鲤群体序列及其变异隋况 | 第179-183页 |
| ·讨论 | 第183-186页 |
| 第八章 三倍体湘云鲫线粒体DNA群体遗传多样性研究 | 第186-195页 |
| ·材料与方法 | 第186-187页 |
| ·实验材料 | 第186-187页 |
| ·总DNA的提取 | 第187页 |
| ·引物设计、PCR扩增和序列测定 | 第187页 |
| ·数据分析方法 | 第187页 |
| ·结果与分析 | 第187-193页 |
| ·三倍体湘云鲫总DNA的抽提结果 | 第187-188页 |
| ·三倍体湘云鲫线粒体tRNA-Thr基因、tRNA-Phe基因以及控制区部分序列PCR扩增结果 | 第188页 |
| ·三倍体湘云鲫群体序列及其变异情况 | 第188-193页 |
| ·讨论 | 第193-195页 |
| 第九章 三倍体湘云鲫3个Sox基因保守区的序列分析 | 第195-202页 |
| ·材料和方法 | 第195-196页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第195-196页 |
| ·PCR扩增和克隆 | 第196页 |
| ·测序和序列分析 | 第196页 |
| ·结果与分析 | 第196-199页 |
| ·三倍体湘云鲫及其原始亲本Sox基因HMG-box的扩增 | 第196-197页 |
| ·三倍体湘云鲫Sox基因HMG-box的克隆及序列分析 | 第197-198页 |
| ·不同物种SOX／Sox基因的同源性分析 | 第198-199页 |
| ·讨论 | 第199-202页 |
| 第十章 三倍体湘云鲫Sox9a全长基因的克隆及表达分析 | 第202-219页 |
| ·材料和方法 | 第203-206页 |
| ·基因组DNA的提取及Sox基因HMG-box的PCR扩增 | 第203页 |
| ·Sox基因HMG-box PCR产物的克隆和序列分析 | 第203页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因组DNA序列的克隆 | 第203-204页 |
| ·总RNA提取和RT-PCR反应 | 第204页 |
| ·Northern印迹分析 | 第204-205页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因3'-RACE和5'-RACE | 第205-206页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因的序列分析 | 第206页 |
| ·结果与分析 | 第206-216页 |
| ·三倍体湘云鲫及其原始亲本Sox基因HMG-box的扩增 | 第206页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因HMG-box的克隆及序列分析 | 第206页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因组DNA全序列的克隆 | 第206-207页 |
| ·三倍体湘云鲫不同组织RT-PCR扩增结果 | 第207-208页 |
| ·TCSox9a基因在三倍体湘云鲫成体组织中的表达特征 | 第208-209页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因cDNA的克隆 | 第209页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9a基因5'-RACE和3'-RACE结果 | 第209-212页 |
| ·不同动物SOX／Sox9蛋白质序列的比较 | 第212-216页 |
| ·讨论 | 第216-219页 |
| 第十一章 三倍体湘云鲫Sox9b基因保守区序列的克隆及其表达分析 | 第219-229页 |
| ·材料和方法 | 第219-220页 |
| ·基因组DNA的提取及Sox基因保守区的PCR扩增 | 第219页 |
| ·PCR产物的克隆及测序和序列分析 | 第219页 |
| ·DNA斑点杂交 | 第219-220页 |
| ·Northern印迹分析 | 第220页 |
| ·结果与分析 | 第220-224页 |
| ·三倍体湘云鲫及其原始亲本Sox基因HMG-box的PCR扩增 | 第220页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9b基因HMG-box的克隆及序列分析 | 第220-222页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9b基因HMG内含子多态性分析 | 第222-223页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9b基因DNA斑点杂交 | 第223-224页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox9b基因在成体中的组织特异性表达 | 第224页 |
| ·讨论 | 第224-229页 |
| 第十二章 三倍体湘云鲫Sox4b基因部分序列及其5′端调控区的克隆与分析 | 第229-234页 |
| ·材料和方法 | 第229页 |
| ·基因组DNA提取及Sox基因保守区的PCR扩增 | 第229页 |
| ·PCR产物的克隆及测序和序列分析 | 第229页 |
| ·结果与分析 | 第229-232页 |
| ·三倍体湘云鲫及其原始亲本Sox基因HMG-box的PCR扩增 | 第229页 |
| ·三倍体湘云鲫TCSox4b基因部分序列及其5′端调控区的克隆与分析 | 第229-232页 |
| ·讨论 | 第232-234页 |
| 第十三章 总结 | 第234-238页 |
| 参考文献 | 第238-260页 |
| 缩略词表 | 第260-261页 |
| 主要实验试剂和仪器 | 第261-262页 |
| 主要生物信息学软件 | 第262-263页 |
| 博士学习期间发表的主要论文及获奖情况 | 第263-264页 |
| 致谢 | 第264-266页 |
| 湖南师范大学学位论文原创性声明 | 第266页 |
