| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-24页 |
| ·真核生物剪接机制 | 第10-11页 |
| ·选择性剪接的概念 | 第11-13页 |
| ·选择性剪接的调节机制和生物学意义 | 第13-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-17页 |
| ·选择性剪接的数据来源 | 第14页 |
| ·基于EST数据的建库方法 | 第14-16页 |
| ·非基于EST的选择性剪接研究 | 第16-17页 |
| ·常用选择性剪接数据库 | 第17-20页 |
| ·ASD数据库 | 第20-22页 |
| ·AltSplice子数据库 | 第20-21页 |
| ·AltExtron子数据库 | 第21页 |
| ·AEDB子数据库 | 第21-22页 |
| ·ASAP数据库 | 第22页 |
| ·论文的研究内容与安排 | 第22-24页 |
| 第二章 算法 | 第24-36页 |
| ·分类算法小结 | 第24-25页 |
| ·位置权重矩阵 | 第25-26页 |
| ·离散量与离散增量 | 第26-28页 |
| ·离散量 | 第26-27页 |
| ·离散增量 | 第27-28页 |
| ·支持向量机 | 第28-29页 |
| ·SVM理论 | 第28-29页 |
| ·SVM软件 | 第29页 |
| ·组合支持向量机 | 第29-30页 |
| ·马氏距离判别 | 第30-31页 |
| ·位点保守性差异的比较 | 第31-33页 |
| ·WebLogo方法 | 第31-32页 |
| ·序列信息参量M_(ni) | 第32-33页 |
| ·t检验 | 第33-34页 |
| ·算法评价指标 | 第34-36页 |
| ·预测成功率评价指标 | 第34-35页 |
| ·ROC曲线 | 第35-36页 |
| 第三章 预测选择性5′/3′剪接位点 | 第36-55页 |
| ·选择性剪接位点和假剪接位点的分类 | 第36-39页 |
| ·数据集 | 第36-37页 |
| ·序列差异性分析 | 第37-38页 |
| ·基于序列信息进行预测分类 | 第38-39页 |
| ·选择性剪接位点和组成性剪接位点的分类 | 第39-44页 |
| ·数据集 | 第39-40页 |
| ·序列差异性分析 | 第40页 |
| ·基于序列信息进行预测分类 | 第40-44页 |
| ·选择性剪接位点和不含选择性剪接基因剪接位点的分类 | 第44-48页 |
| ·数据集 | 第45页 |
| ·序列差异性分析 | 第45-48页 |
| ·基于序列信息进行预测分类 | 第48页 |
| ·小鼠基因组中选择性剪接位点和组成性剪接位点的分类 | 第48-52页 |
| ·数据集 | 第49-50页 |
| ·基于序列信息进行预测分类 | 第50-52页 |
| ·用一个参数表述剪接位点竞争机制 | 第52-55页 |
| ·预测步骤 | 第53页 |
| ·预测结果 | 第53-55页 |
| 第四章 预测盒式外显子 | 第55-64页 |
| ·数据集 | 第55页 |
| ·序列特征分析 | 第55-59页 |
| ·基于序列信息进行分类预测 | 第59-60页 |
| ·回文序列特征 | 第60-61页 |
| ·与随机核酸序列进行比较 | 第61-64页 |
| 第五章 癌症特异性剪接位点的预测 | 第64-67页 |
| ·数据集 | 第64页 |
| ·位点保守性分析 | 第64-65页 |
| ·癌症特异性剪接位点的预测 | 第65-67页 |
| 第六章 把剪接位点分为四大类进行预测 | 第67-71页 |
| ·数据集 | 第67-68页 |
| ·选取序列信息参数 | 第68-69页 |
| ·预测结果 | 第69-71页 |
| 第七章 总结与展望 | 第71-74页 |
| ·本文工作总结 | 第71-73页 |
| ·工作展望 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-85页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86页 |