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高羊茅FaChit1基因的克隆与表达调控以及一种转基因植物新型检测方法的研究

中文摘要第1-7页
ABSTRACT第7-18页
缩略词语第18-21页
第一部分 高羊茅FACHIT1基因的克隆及其表达调控研究第21-119页
 第一章 文献综述第21-40页
  1 植物几丁质酶的分子生物学研究进展第21-27页
   ·植物几丁质酶的分布定位第22页
   ·植物几丁质酶的类型及其结构特征第22-25页
     ·Ⅰ类和Ⅱ类几丁质酶第22-24页
     ·Ⅲ类几丁质酶第24页
     ·Ⅳ类、Ⅴ类、Ⅵ类及Ⅶ类几丁质酶第24-25页
   ·植物几丁质酶的功能第25-27页
     ·抗真菌活性第25-26页
     ·参与植物的发育调控第26页
     ·其它一些功能第26-27页
   ·植物几丁质酶基因的结构第27-28页
   ·植物几丁质酶基因的表达调控第28-34页
   ·植物几丁质酶的应用前景第34-35页
   ·本研究的目的、意义和内容第35-40页
 第二章 高羊茅FACHIT1基因cDNA的克隆及其诱导表达第40-72页
   ·材料和试剂第40-41页
     ·主要试剂第40页
     ·其它有关材料及试剂第40页
     ·主要仪器第40-41页
   ·实验方法第41-58页
     ·植物材料与处理第41页
     ·总RNA的提取第41-42页
     ·cDNA第一链的合成第42-43页
       ·高羊茅FaChitl基因cDNA保守片段的克隆第43-48页
       ·RT-PCR简并引物的设计第43-44页
       ·RT-PCR反应体系及程序第44页
       ·RT-PCR反应产物的回收第44-45页
       ·扩增DNA片段与载体的连接第45-46页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第46页
       ·质粒DNA的大肠杆菌转化第46页
       ·重组质粒的提取第46-47页
       ·重组质粒DNA的限制性酶切检测第47-48页
       ·扩增DNA片段的序列测定及分析第48页
       ·RACE扩增cDNA的3'末端第48-50页
       ·引物设计及原理第48页
       ·反转录反应第48-49页
       ·嵌套式PCR反应第49-50页
         ·Outer PCR反应第49-50页
         ·Inner PCR反应第50页
       ·PCR反应产物的回收、克隆、测序及分析第50页
     ·RACE扩增cDNA的5'末端第50-55页
       ·引物设计及原理第50-51页
       ·去磷酸化处理第51页
       ·去除mRNA的5'帽子结构第51-52页
       ·5'RACE adaptor的连接第52-53页
       ·反转录反应第53-54页
       ·嵌套式PCR反应第54-55页
         ·Outer PCR反应第54页
         ·Inner PCR反应第54-55页
       ·PCR反应产物的回收、克隆、测序及分析第55页
     ·RNA blotting检测FaChitl基因的表达第55-58页
       ·杂交探针的制备第55页
       ·Northern blotting第55-58页
         ·RNA变性凝胶电泳第55-56页
         ·碱性条件下RNA向尼龙膜的毛细管转移第56-57页
         ·杂交第57页
         ·杂交信号的检测第57-58页
   ·结果与分析第58-70页
     ·总RNA的提取第58-59页
     ·FaChitl基因eDNA保守片段的克隆第59-61页
       ·FaChitl基因cDNA保守片段的测序结果分析第60-61页
     ·高羊茅FaChitl基因cDNA全长序列的克隆第61-62页
     ·FaChitl的CDS(Conserved Domain Sequence)搜索结果第62-63页
     ·FaChitl基因核苷酸及其对应的氨基酸序列第63-65页
     ·同源性及其保守结构域分析第65-68页
     ·系统进化树第68-69页
     ·FaChitl基因的表达分析第69-70页
       ·FaChitl基因在根及叶片组织中对真菌激发子诱导的反应第69页
       ·FaChitl基因在根及叶片组织中对乙烯、渗透以及机械损伤等胁迫处理的表达反应第69-70页
   ·讨论第70-72页
 第三章 高羊茅FACHIT1基因组DNA的克隆及其拷贝数的验定第72-87页
   ·材料和试剂第72页
     ·主要试剂第72页
     ·其它有关材料及试剂第72页
     ·主要仪器第72页
   ·实验方法第72-79页
     ·基因组DNA的提取第72-73页
     ·FaChitl启动子序列的克隆第73-77页
       ·BD Genome Walker~(TM)染色体步移原理第73-74页
       ·BD Genome Walker~(TM) DNA文库的构建第74-76页
       ·BD Genome Walker~(TM)染色体步移第76-77页
       ·PCR反应产物的回收、克隆、测序及分析第77页
     ·FaChitl基因组3'非翻译区(3'UTR)的克隆第77页
     ·FaChitl基因组序列的克隆第77-78页
     ·Southern blotting检测FaChitl基因的拷贝数第78-79页
       ·杂交探针的制备第78页
       ·Southern blotting检测第78-79页
         ·DNA的限制性酶切及电泳第78页
         ·碱性条件下DNA向尼龙膜的毛细管转移第78-79页
         ·杂交第79页
         ·杂交信号的检测第79页
   ·结果与分析第79-85页
     ·FaChitl基因启动子的克隆及序列分析第79-82页
     ·FaChitl 3'非翻译区基因组序列的克隆与分析第82-83页
     ·FaChitl基因组序列的克隆与分析第83-84页
     ·FaChitl基因的拷贝数第84-85页
   ·讨论第85-87页
 第四章 高羊茅FACHIT1启动子的功能分析第87-105页
   ·材料和试剂第87-88页
     ·主要试剂第87页
     ·其它有关材料及试剂第87页
     ·主要仪器第87-88页
   ·实验方法第88-93页
     ·不同长度FaChitl基因启动子与GUS基因融合植物表达载体的构建第88页
     ·植物表达载体的农杆菌转化第88-89页
       ·农杆菌感受态细胞的制备第88页
       ·冻融法转化农杆菌第88-89页
     ·农杆菌介导的烟草遗传转化第89-90页
     ·转基因烟草的PCR检测第90页
     ·转基因烟草的Southern杂交鉴定第90-91页
       ·转基因烟草的DNA提取第90页
       ·DNA的限制性酶切和电泳第90-91页
       ·杂交探针的制备第91页
       ·Southern杂交检测第91页
     ·转基因烟草的GUS荧光活性分析第91-93页
       ·转基因烟草的胁迫处理第91页
       ·转基因烟草的GUS荧光活性测定第91-93页
         ·新鲜转基因烟草叶片组织GUS蛋白的提取第91页
         ·GUS酶反应第91-92页
         ·荧光测定第92页
         ·GUS提取液蛋白含量测定第92-93页
         ·酶活力计算第93页
   ·结果与分析第93-103页
     ·不同长度的FaChitl启动子与GUS基因融合表达载体第93-95页
     ·含不同长度FaChitl启动子转基因烟草的获得及分子鉴定第95-98页
       ·转基因烟草的PCR鉴定第95-96页
       ·转基因烟草的Southern杂交鉴定第96-98页
     ·不同长度FaChitl启动子对多种胁迫的应答特征第98-102页
       ·不同长度FaChitl启动子对真菌激发子(Fungal elicitor)的应答特征第98-100页
       ·不同长度FaChitl启动子对干旱胁迫的反应第100-101页
       ·不同长度FaChitl基因启动子对乙烯胁迫的反应第101页
       ·不同长度FaChitl启动子对机械损伤胁迫的反应第101-102页
     ·pFaChitlP-Ⅰ转化系烟草中GUS基因的mRNA表达水平第102-103页
   ·讨论第103-105页
 第一部分小结第105-106页
 参考文献(REFERENCES)第106-119页
第二部分 一个新型的DNA生物传感器在转基因植物检测上的应用研究第119-150页
 1 综述第119-125页
   ·检测转基因植物的常规方法第119-120页
   ·DNA生物传感器第120-123页
     ·光学DNA生物传感器第121页
     ·声波DNA生物传感器第121-122页
     ·电化学DNA生物传感器第122-123页
   ·电化学DNA生物传感器的应用现状第123-124页
   ·研究内容、目的和意义第124-125页
 2 实验和方法第125-131页
   ·试剂及材料第125-126页
   ·目标序列的PCR扩增第126-127页
   ·DNA生物传感器在金电极表面的组装第127-131页
     ·金电极表面的生物化修饰第127-128页
     ·金电极表面的杂交第128页
     ·链亲和素与信号探针的结合第128页
     ·过氧化氢酶的生物素化标记第128页
     ·生物素化标记的过氧化氢酶与链亲和素的结合第128-129页
     ·电化学信号的检测第129-131页
 3 结果与分析第131-142页
   ·金电极表面聚苯胺的循环伏安值第131-132页
   ·传感器组装中各参数的优化第132-135页
     ·捕获探针浓度的优化第132页
     ·信号探针浓度的优化第132-133页
     ·链亲和素浓度的优化第133页
     ·生物素及过氧化氢酶浓度的优化第133-135页
   ·生物传感器对序列检测的特异性验定第135-138页
   ·生物传感器对序列检测的灵敏度第138-140页
   ·PCR产物的Southern杂交验定第140-142页
 4 讨论第142-143页
 5 第二部分小结第143-145页
 参考文献(References)第145-150页
攻读博士学位期间取得的研究成果第150-151页
致谢第151页

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