| 中文摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-25页 |
| 1 中药抗病毒研究现状 | 第12-16页 |
| ·中药抗病毒作用机理研究 | 第12-14页 |
| ·直接抗病毒 | 第12-13页 |
| ·间接抗病毒 | 第13-14页 |
| ·中药抗各类病毒的研究 | 第14-16页 |
| ·人免疫缺陷病毒(HIV) | 第14-15页 |
| ·乙型肝炎病毒(HBV) | 第15页 |
| ·呼吸道病毒 | 第15页 |
| ·柯萨奇病毒(CV) | 第15页 |
| ·单纯疱疹病毒(HSV) | 第15-16页 |
| 2 药效团研究现状 | 第16-22页 |
| ·药效团的发展历程 | 第16-17页 |
| ·基于配体构建药效团的方法 | 第17-21页 |
| ·Catalyst | 第17-20页 |
| ·DISCO | 第20-21页 |
| ·GASP | 第21页 |
| ·基于靶标构建药效团的方法 | 第21-22页 |
| ·小结 | 第22页 |
| 3 常用的分类识别系统 | 第22-25页 |
| ·神经网络 | 第22-23页 |
| ·贝叶斯网络 | 第23页 |
| ·决策树 | 第23页 |
| ·支持向量机 | 第23-24页 |
| ·小结 | 第24-25页 |
| 第二章 抗病毒相关药效团模型的构建 | 第25-67页 |
| 1 实验步骤 | 第25-30页 |
| ·训练集化合物的选择 | 第25页 |
| ·药效特征的定义 | 第25页 |
| ·构象分析 | 第25页 |
| ·HIPHOP药效团模型的计算 | 第25-26页 |
| ·HipHop算法 | 第25-26页 |
| ·分类预测模型的建立 | 第26页 |
| ·HYPOGEN药效团模型的计算 | 第26-27页 |
| ·药效团模型的优化 | 第27页 |
| ·药效团模型的评价 | 第27-30页 |
| 2 实验内容 | 第30-62页 |
| ·ICE抑制剂药效团模型的建立 | 第30-38页 |
| ·化合物的活性数据 | 第30-31页 |
| ·HipHop药效团模型的建立 | 第31-33页 |
| ·分类预测模型的建立 | 第33-35页 |
| ·HypoGen药效团模型的建立 | 第35-38页 |
| ·两种药效团计算方法的比较 | 第38页 |
| ·ETA受体拮抗剂药效团模型的建立 | 第38-46页 |
| ·样本集化合物 | 第38-42页 |
| ·HipHop药效团模型的建立 | 第42-43页 |
| ·HypoGen药效团模型的建立 | 第43-46页 |
| ·两种药效团计算方法的比较 | 第46页 |
| ·CDK2抑制剂药效团模型的建立 | 第46-54页 |
| ·样本集化合物 | 第47-49页 |
| ·HipHop药效团模型的建立 | 第49-52页 |
| ·HypoGen药效团模型的建立 | 第52-54页 |
| ·5-LOX抑制剂药效团模型的建立 | 第54-60页 |
| ·训练集化合物 | 第55页 |
| ·HipHop药效团模型的建立 | 第55-58页 |
| ·分类预测模型的建立和比较 | 第58-60页 |
| ·NA抑制剂药效团模型的建立 | 第60-61页 |
| ·训练集化合物 | 第60页 |
| ·HipHop药效团模型的构建 | 第60-61页 |
| ·CCR5受体拮抗剂药效团模型的建立 | 第61-62页 |
| 3 结论 | 第62-67页 |
| ·药效团模型结果总结 | 第63页 |
| ·药效团构建方法总结 | 第63-65页 |
| ·两种算法公共参数 | 第63-64页 |
| ·HipHop | 第64页 |
| ·HypoGen | 第64-65页 |
| ·基于配体构建药效团的三种常用计算方法比较 | 第65-67页 |
| ·药效特征的定义 | 第65页 |
| ·训练集的选择 | 第65页 |
| ·构象分析 | 第65-66页 |
| ·构建参数的选择及模型优化 | 第66页 |
| ·数据库搜索 | 第66-67页 |
| 第三章 基于三维药效团的中药抗病毒机理阐释 | 第67-75页 |
| 1 方法原理 | 第67-68页 |
| ·基本原理 | 第67页 |
| ·试验流程 | 第67-68页 |
| ·三维药效团模型 | 第67页 |
| ·搜索算法 | 第67-68页 |
| ·搜索结果分析 | 第68页 |
| 2 实验结果 | 第68-75页 |
| ·ICE抑制剂三维药效团搜索结果 | 第68-69页 |
| ·ETA受体拮抗剂三维药效团搜索结果 | 第69-70页 |
| ·CDK2/CYCLINA抑制剂三维药效团搜索结果 | 第70-71页 |
| ·5-LOX抑制剂三维药效团搜索结果 | 第71-73页 |
| ·NA抑制剂三维药效团搜索结果 | 第73-74页 |
| ·CCR5受体拮抗剂三维药效团搜索结果 | 第74页 |
| ·小结 | 第74-75页 |
| 第四章 总结 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 个人简历 | 第82-83页 |
| 发表论文 | 第83页 |