| 缩略词表 | 第5-6页 |
| 第一部分 用STR对恒河猴群遗传背景的研究 | 第6-39页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 一、前言 | 第9-11页 |
| 二、材料与方法 | 第11-20页 |
| 2.1 实验对象 | 第11-12页 |
| 2.2 实验材料 | 第12-13页 |
| 2.2.1 主要仪器 | 第12页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第12-13页 |
| 2.3 实验方法 | 第13-20页 |
| 2.3.1 恒河猴血液基因组DNA的提取 | 第13页 |
| 2.3.2 样本DNA的浓度、纯度检测 | 第13-14页 |
| 2.3.3 样本DNA完整性检测 | 第14页 |
| 2.3.4 荧光标记PCR扩增 | 第14-18页 |
| 2.3.5 电泳检测 | 第18页 |
| 2.3.6 PCR扩增产物的纯化 | 第18页 |
| 2.3.7 毛细管电泳检测 | 第18-19页 |
| 2.3.8 数据处理 | 第19页 |
| 2.3.9 数据分析 | 第19-20页 |
| 三、实验结果 | 第20-35页 |
| 3.1 检测结果 | 第20-26页 |
| 3.1.1 电泳检测结果 | 第20页 |
| 3.1.2 分型结果 | 第20-26页 |
| 3.2 遗传多样性分析 | 第26-35页 |
| 3.2.1 等位基因频率 | 第26-28页 |
| 3.2.2 种群遗传多样性 | 第28-30页 |
| 3.2.3 哈迪-温伯格平衡检测 | 第30-31页 |
| 3.2.4 UPGMA聚类分析 | 第31-34页 |
| 3.2.5 Nei's基因分化系数 | 第34-35页 |
| 四、讨论 | 第35-38页 |
| 4.1 RFLP、RAPD和mtDNA等遗传标记在恒河猴群体遗传学中的研究现状 | 第35-36页 |
| 4.2 使用STR位点研究恒河猴遗传结构的优势以及已取得的成果 | 第36-37页 |
| 4.3 群体遗传多样性 | 第37页 |
| 4.4 选取恒河猴群体的哈迪-温伯格平衡检测 | 第37-38页 |
| 小结 | 第38-39页 |
| 第二部分 封闭恒河猴群CCR5基因变异特征的分析 | 第39-54页 |
| 摘要 | 第39-40页 |
| ABSTRACT | 第40-41页 |
| 一、前言 | 第41-42页 |
| 二、材料与方法 | 第42-45页 |
| 2.1 实验对象 | 第42页 |
| 2.2 实验材料 | 第42-43页 |
| 2.2.1 主要仪器 | 第42页 |
| 2.2.2 主要试剂(盒) | 第42-43页 |
| 2.3 实验方法 | 第43-45页 |
| 2.3.1 恒河猴基因组DNA提取 | 第43页 |
| 2.3.2 样本DNA的浓度、纯度检测 | 第43页 |
| 2.3.3 样本DNA完整性检测 | 第43页 |
| 2.3.4 恒河猴CCR5基因的扩增及测序 | 第43-44页 |
| 2.3.5 恒河猴CCR5基因序列拼接 | 第44-45页 |
| 2.3.6 CCR5基因序列的比对分析 | 第45页 |
| 2.3.7 CCR5基因受选择压力的分析 | 第45页 |
| 三、实验结果与分析 | 第45-51页 |
| 3.1 基因组DNA以及PCR扩增产物的电泳检测结果 | 第45-46页 |
| 3.2 恒河猴群体CCR5全基因序列突变分析 | 第46-48页 |
| 3.3 恒河猴与人CCR5基因的差异分析 | 第48-50页 |
| 3.4 恒河猴、人类及部分非人灵长类动物CCR5基因核苷酸序列和氨基酸序列比对分析 | 第50页 |
| 3.5 CCR5基因受选择压力的分析 | 第50-51页 |
| 四、讨论 | 第51-53页 |
| 小结 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 附录1 聚类图中其他来源恒河猴等位基因频率 | 第60-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 研究生简历 | 第70-71页 |
