| 中文摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 英文缩写词表 | 第10-12页 |
| 第一章 综述部分 | 第12-25页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 技术路线 | 第13-14页 |
| 1.3 SmCPSs基因的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3.1 SmCPSs在丹参萜类代谢途径中的地位 | 第14页 |
| 1.3.2 SmCPS1是SmCPS基因家族中参与丹参酮类成分合成代谢的主要成员 | 第14-15页 |
| 1.3.3 SmCPSs的表达存在组织差异。 | 第15页 |
| 1.4 启动子区包含了基因表达的基础信息 | 第15-20页 |
| 1.4.1 启动子区概述 | 第15-17页 |
| 1.4.2 不同核心启动子导致不同的转录后调控事件 | 第17页 |
| 1.4.3 启动子区的顺式作用元件通过与对应的转录因子结合从而参与转录过程 | 第17-18页 |
| 1.4.4 启动子区转录因子顺式作用元件预测算法 | 第18-20页 |
| 1.5 DNA甲基化研究进展 | 第20-25页 |
| 1.5.1 DNA甲基化概述 | 第20页 |
| 1.5.2 植物DNA甲基化具有动态变化和可遗传的特性 | 第20-21页 |
| 1.5.3 DNA甲基化与基因表达的关系 | 第21-23页 |
| 1.5.4 植物组织差异性DNA甲基化研究进展 | 第23页 |
| 1.5.5 DNA甲基化的检测方法 | 第23-25页 |
| 第二章 不同遗传背景丹参SmCPS1启动子区多态性特征分析 | 第25-70页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-30页 |
| 2.1.1 仪器与试剂 | 第25-26页 |
| 2.1.2 材料 | 第26页 |
| 2.1.3 DNA提取 | 第26页 |
| 2.1.4 PCR扩增及测序 | 第26-27页 |
| 2.1.5 SmCPS1启动子区调控元件的预测 | 第27-28页 |
| 2.1.6 功能性多态性位点的鉴定 | 第28页 |
| 2.1.7 RNA提取与检测 | 第28-29页 |
| 2.1.8 cDNA的制备 | 第29页 |
| 2.1.9 不同遗传背景SmCPS1RNA的表达量检测 | 第29页 |
| 2.1.10 数据分析 | 第29-30页 |
| 2.2 结果 | 第30-60页 |
| 2.2.1 不同遗传背景丹参SmCPS1启动子区测序结果 | 第30-39页 |
| 2.2.2 不同区域SmCPS1序列多态性分析 | 第39-40页 |
| 2.2.3 丹参SmCPS1启动子区元件预测结果 | 第40-45页 |
| 2.2.4 系统发育分析 | 第45页 |
| 2.2.5 丹参SmCPS1功能性多态性位点的鉴定 | 第45-47页 |
| 2.2.6 不同遗传背景丹参根部SmCPS1表达量检测结果 | 第47-48页 |
| 2.2.7 SmCPS1序列多态性与表达的相关性 | 第48-50页 |
| 2.2.8 SmCPS1序列多态性与丹参酮类成分含量的相关性 | 第50-60页 |
| 2.2.9 SmCPS1表达量与丹参酮类成分含量的相关性 | 第60页 |
| 2.3 讨论 | 第60-69页 |
| 2.3.1 SmCPS1序列多态性位点的分布可能反映出参与其表达调控的关键区域 | 第61页 |
| 2.3.2 本研究对于功能性多态性位点的判断标准 | 第61-62页 |
| 2.3.3 SmCPS1序列多态性与丹参酮类成分含量的关系 | 第62-63页 |
| 2.3.4 SmCPS1序列多态性与SmCPS1相对表达量的关系 | 第63-64页 |
| 2.3.5 SmCPS1相对表达量与丹参酮类成分的关系 | 第64-65页 |
| 2.3.6 对SmCPS1序列多态性,SmCPS1表达量和丹参酮类成分含量相互关系的理解 | 第65-66页 |
| 2.3.7 存在多态性位点的转录因子结合位点对应的转录因子超家族 | 第66-69页 |
| 2.4 小结 | 第69-70页 |
| 第三章 丹参SmCPS1启动子区甲基化特征与表达的关系 | 第70-82页 |
| 3.1 材料与方法 | 第70-72页 |
| 3.1.1 仪器与试剂 | 第70页 |
| 3.1.2 材料 | 第70-71页 |
| 3.1.3 RNA提取 | 第71页 |
| 3.1.4 cDNA的制备 | 第71页 |
| 3.1.5 不同组织中SmCPS1基因表达量检测 | 第71页 |
| 3.1.6 重亚硫酸盐转化 | 第71页 |
| 3.1.7 重亚硫酸盐转化后的PCR扩增 | 第71页 |
| 3.1.8 目的片段的回收及测序 | 第71-72页 |
| 3.1.9 数据分析 | 第72页 |
| 3.2 结果 | 第72-77页 |
| 3.2.1 不同组织中SmCPS1表达量分析 | 第72-73页 |
| 3.2.2 丹参不同组织SmCPS1启动子区甲基化分布分析 | 第73-77页 |
| 3.3 讨论 | 第77-81页 |
| 3.3.1 不同组织中SmCPS1表达量可能与遗传背景或时间有关 | 第77页 |
| 3.3.2 SmCPS1启动子区甲基化分布特征 | 第77-78页 |
| 3.3.3 存在甲基化差异位点的顺式作用元件所属转录因子超家族 | 第78-79页 |
| 3.3.4 不同组织中SmCPS1启动子区甲基化与SmCPS1相对表达量的关系 | 第79-81页 |
| 3.4 小结 | 第81-82页 |
| 结论与展望 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-95页 |
| 在读期间公开发表的学术论文、专著及科研成果 | 第95-96页 |
