大黄鱼和黄姑鱼基因组选择研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第1章 引言 | 第12-24页 |
| 1.1 选择育种方法及其优缺点介绍 | 第12-15页 |
| 1.1.1 个体选择 | 第12页 |
| 1.1.2 家系选择 | 第12-13页 |
| 1.1.3 BLUP方法 | 第13-14页 |
| 1.1.4 标记辅助选择 | 第14页 |
| 1.1.5 GWAS研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2 基因组选择简介 | 第15-17页 |
| 1.2.1 基因组选择原理 | 第15-16页 |
| 1.2.2 基因组选择的优势 | 第16页 |
| 1.2.3 基因组选择研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 基因组预测模型 | 第17-21页 |
| 1.3.1 表型值的解释 | 第17页 |
| 1.3.2 基因组预测方法 | 第17-21页 |
| 1.3.3 预测能力 | 第21页 |
| 1.4 简化基因组测序 | 第21-22页 |
| 1.5 遗传参数估计 | 第22页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第22-24页 |
| 第2章 基因组选择算法研究 | 第24-37页 |
| 2.1 MixP的两种计算策略 | 第24-33页 |
| 2.1.1 FMixP的推导 | 第25-28页 |
| 2.1.2 MMixP的推导 | 第28-33页 |
| 2.2 FBayesC算法设计 | 第33-37页 |
| 2.2.1 FBayesC的推导 | 第33-36页 |
| 2.2.2 FBayesB推导结果 | 第36-37页 |
| 第3章 大黄鱼基因组育种研究 | 第37-79页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-46页 |
| 3.1.1 试验样本选取 | 第37页 |
| 3.1.2 表型性状 | 第37-38页 |
| 3.1.3 DNA提取 | 第38-39页 |
| 3.1.4 GSB建库与SNP分型 | 第39-40页 |
| 3.1.5 遗传参数估计 | 第40页 |
| 3.1.6 基因组预测 | 第40-43页 |
| 3.1.7 GWAS方法 | 第43-46页 |
| 3.2 结果与分析 | 第46-70页 |
| 3.2.1 性状遗传参数 | 第46-48页 |
| 3.2.2 基因组预测 | 第48-53页 |
| 3.2.3 GWAS结果 | 第53-70页 |
| 3.3 讨论 | 第70-79页 |
| 3.3.1 性状选取 | 第70页 |
| 3.3.2 遗传参数及育种策略 | 第70-72页 |
| 3.3.3 基因组预测结果比较 | 第72-75页 |
| 3.3.4 GWAS结果比较与基因挖掘 | 第75-79页 |
| 第4章 基因组育种成本节省策略 | 第79-90页 |
| 4.1 材料与方法 | 第79-81页 |
| 4.1.1 EP-GS方法 | 第80-81页 |
| 4.1.2 EP-GWAS方法 | 第81页 |
| 4.1.3 PS-GS方法 | 第81页 |
| 4.2 结果与分析 | 第81-88页 |
| 4.2.1 EP-GS结果 | 第81-83页 |
| 4.2.2 理想的参考群大小 | 第83-84页 |
| 4.2.3 EP-GWAS结果 | 第84-87页 |
| 4.2.4 PS-GS结果 | 第87-88页 |
| 4.3 讨论 | 第88-90页 |
| 4.3.1 EP-GS和PS-GS | 第88-89页 |
| 4.3.2 成本核算 | 第89页 |
| 4.3.3 实际操作方式 | 第89-90页 |
| 第5章 黄姑鱼基因组选择初步研究 | 第90-95页 |
| 5.1 材料与方法 | 第90-91页 |
| 5.1.1 试验群体与表型数据 | 第90-91页 |
| 5.1.2 基因组SNP数据挖掘 | 第91页 |
| 5.1.3 基因组预测 | 第91页 |
| 5.2 结果与分析 | 第91-93页 |
| 5.2.1 遗传参数估计 | 第91-93页 |
| 5.2.2 基因组预测结果 | 第93页 |
| 5.3 讨论 | 第93-95页 |
| 5.3.1 参考群体采样时期 | 第93页 |
| 5.3.2 参考群体构建方式 | 第93-95页 |
| 第6章 总结、创新点及展望 | 第95-98页 |
| 6.1 总结 | 第95-96页 |
| 6.2 创新点 | 第96页 |
| 6.3 展望 | 第96-98页 |
| 6.3.1 适合进行GS的性状 | 第96页 |
| 6.3.2 GS育种的应用前景 | 第96-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-113页 |
| 在校期间发表的论文 | 第113页 |
