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寄主miRNAs调控小麦与条锈菌互作的分子机理

摘要第6-9页
ABSTRACT第9-12页
第一章 文献综述第18-43页
    1.1 miRNAs概述第18-19页
    1.2 植物miRNAs研究进展第19-33页
        1.2.1 植物miRNAs的特点,产生及作用机制第19-21页
        1.2.2 植物miRNAs靶标基因的预测及验证第21-24页
        1.2.3 植物miRNAs与生长发育第24-25页
        1.2.4 植物miRNAs与抗逆反应第25-30页
        1.2.5 植物miRNAs的研究方法第30-31页
        1.2.6 麦类作物miRNAs研究进展第31-33页
    1.3 植物与病原物的互作机理第33-37页
        1.3.1 植物抗性基因第33-34页
        1.3.2 植物感病相关基因第34-36页
        1.3.3 植物与病原菌互作中的信号转导第36-37页
    1.4 小麦条锈病及小麦抗锈性第37-40页
        1.4.1 小麦条锈病的危害第37页
        1.4.2 小麦条锈菌的寄生专化型第37-38页
        1.4.3 小麦品种的抗锈性第38-40页
    1.5 小麦与条锈菌的互作研究进展第40-42页
        1.5.1 全生育期抗性小麦与条锈菌的互作机制第40-41页
        1.5.2 成株期抗性小麦与条锈菌的互作机制第41-42页
    1.6 本研究的目的与意义第42-43页
第二章 具有成株抗锈性小麦品种不同生长时期与条锈菌互作中差异表达的miRNAs及其靶标基因的分离与鉴定第43-73页
    2.1 前言第43-44页
    2.2 材料、试剂及仪器第44页
        2.2.1 材料第44页
        2.2.2 仪器及试剂第44页
    2.3 实验方法第44-51页
        2.3.1 胁迫处理与样品采集第44-45页
        2.3.2 总RNA提取与纯化第45-46页
        2.3.3 small RNA分离及建库测序第46-47页
        2.3.4 small RNA测序数据分析第47-48页
        2.3.5 降解组测序及数据分析第48页
        2.3.6 microarray分析第48-50页
        2.3.7 northern blot分析第50页
        2.3.8 cDNA合成及实时荧光定量PCR第50-51页
    2.4 结果与分析第51-71页
        2.4.1 small RNA测序结果概述第51-54页
        2.4.2 小麦已知miRNA的鉴定第54-55页
        2.4.3 小麦新的miRNA的鉴定第55-57页
        2.4.4 成株期兴资9104与CYR32互作过程中miRNA的表达情况分析第57-59页
        2.4.5 苗期兴资9104与CYR32互作过程中miRNA的表达情况分析第59-62页
        2.4.6 不同生长发育时期差异表达miRNA的鉴定第62页
        2.4.7 成株期小麦miRNA的靶标基因鉴定第62-66页
        2.4.8 苗期小麦miRNA的靶标基因鉴定第66-70页
        2.4.9 小麦miRNA靶标基因在不同时期的兴资9104应对条锈菌胁迫时的表达趋势分析第70页
        2.4.10 利用Pst基因组序列预测小麦miRNA的靶标基因第70-71页
    2.5 讨论与结论第71-73页
第三章 PN-2013靶标TaMDHAR调控小麦成株期抗锈性第73-105页
    3.1 前言第73-74页
    3.2 材料、试剂及仪器第74页
    3.3 实验方法第74-87页
        3.3.1 胁迫处理与样品采集第74页
        3.3.2 DNA、RNA提取及cDNA合成第74页
        3.3.3 TaMDHAR基因的电子克隆与RT-PCR扩增第74-78页
        3.3.4 序列分析第78-79页
        3.3.5 实时荧光定量PCR第79-80页
        3.3.6 利用共转化技术分析PN-2013和1136-P3对TaMDHAR的调控关系第80-82页
        3.3.7 BSMV-VIGS介导的基因沉默第82-85页
        3.3.8 植物组织中超氧化物歧化酶(SOD)活力测定第85-86页
        3.3.9 植物组织中过氧化氢酶(CAT)的活性测定第86页
        3.3.10 植物组织中抗坏血酸过氧化物酶(APX)的活性测定第86-87页
        3.3.11 植物组织中单脱氢抗坏血酸还原酶活性测定第87页
        3.3.12 植物组织中还原型抗坏血酸盐含量测定第87页
    3.4 结果与分析第87-102页
        3.4.1 1136-P3和PN-2013的结构分析第87-88页
        3.4.2 TaMDHAR的克隆及序列分析第88-93页
        3.4.3 miRNAs(1136-P3和PN-2013)均能够调控TaMDHAR的表达第93-95页
        3.4.4 在小麦与条锈菌互作中1136-P3、PN-2013与TaMDHAR的表达趋势第95-96页
        3.4.5 TaMDHAR沉默之后提高了小麦对条锈病的抗性第96-102页
    3.5 讨论与结论第102-105页
第四章 PC-395靶标TaULP5增强兴资9104苗期感病性第105-126页
    4.1 前言第105-106页
    4.2 材料、试剂及仪器第106页
    4.3 实验方法第106-111页
        4.3.1 胁迫处理与样品采集第106页
        4.3.2 DNA、RNA提取及cDNA合成第106页
        4.3.3 TaULP5基因的电子克隆与RT-PCR扩增第106-107页
        4.3.4 序列分析第107页
        4.3.5 实时荧光定量PCR第107-108页
        4.3.6 利用共转化技术分析PC-395对TaULP5的调控关系第108页
        4.3.7 TaULP5的亚细胞定位第108-109页
        4.3.8 酵母突变体互补分析第109-110页
        4.3.9 非生物胁迫条件下在酵母中TaULP5过表达分析第110-111页
        4.3.10 BSMV-VIGS介导的基因沉默第111页
    4.4 结果与分析第111-123页
        4.4.1 PC-395的结构分析第111-112页
        4.4.2 候选靶标基因的分离及序列分析第112-114页
        4.4.3 PC-395能够调控TaULP5的表达第114-117页
        4.4.4 TaULP5与PC-395在小麦与条锈菌互作中的表达趋势分析第117页
        4.4.5 酵母突变体中互补TaULP5能够部分恢复突变表型第117-119页
        4.4.6 TaULP5定位在细胞质中第119页
        4.4.7 酵母中过表达TaULP5提高了酵母抗非生物胁迫能力第119-120页
        4.4.8 TaULP5沉默之后提高了小麦对条锈病的抗性第120-123页
    4.5 讨论与结论第123-126页
第五章 tae-miR164靶标TaNAC1/22正向调控小麦全生育期抗锈性第126-147页
    5.1 前言第126页
    5.2 材料、试剂及仪器第126页
        5.2.1 材料第126页
        5.2.2 仪器及试剂第126页
    5.3 实验方法第126-131页
        5.3.1 胁迫处理与样品采集第126-127页
        5.3.2 DNA、RNA提取及cDNA合成第127页
        5.3.3 TaNAC21/22基因的电子克隆与RT-PCR扩增第127-129页
        5.3.4 序列分析第129页
        5.3.5 利用烟草叶片对tae-miR164和靶标基因进行共转化研究第129页
        5.3.6 实时荧光定量PCR第129-130页
        5.3.7 亚细胞定位分析第130页
        5.3.8 TaNAC21/22的转录激活功能分析第130-131页
        5.3.9 BSMV-VIGS介导的基因沉默第131页
    5.4 结果与分析第131-144页
        5.4.1 tae-miR164候选靶标基因的分离及序列分析第131-137页
        5.4.2 tae-miR164能够调控TaNAC21/22的表达第137-139页
        5.4.3 在小麦与条锈菌互作中tae-miR164与TaNAC21/22呈现了相异的表达趋势第139页
        5.4.4 TaNAC21/22定位在细胞核中第139-140页
        5.4.5 TaNAC21/22在酵母中展现了转录激活功能第140-142页
        5.4.6 TaNAC21/22沉默之后提高了小麦对条锈病的抗性第142-144页
    5.5 讨论与结论第144-147页
第六章 tae-miR408抑制TaCLP1转录负调控小麦全生育期抗锈性第147-165页
    6.1 前言第147-148页
    6.2 材料、试剂及仪器第148页
    6.3 实验方法第148-152页
        6.3.1 胁迫处理与样品采集第148页
        6.3.2 DNA、RNA提取及cDNA合成第148页
        6.3.3 TaCLP1基因的电子克隆与RT-PCR扩增第148-149页
        6.3.4 序列分析第149页
        6.3.5 实时荧光定量PCR第149-150页
        6.3.6 利用烟草叶片对tae-miR408和靶标基因进行共转化研究第150页
        6.3.7 高盐及铜离子胁迫条件下在酵母中TaCLP1过表达分析第150-152页
        6.3.8 BSMV-VIGS介导的基因沉默第152页
    6.4 结果与分析第152-163页
        6.4.1 tae-miR408候选靶标基因的分离及序列分析第152-156页
        6.4.2 tae-miR408能够调控TaCLP1的表达第156-158页
        6.4.3 在小麦与条锈菌互作中tae-miR408与TaCLP1呈现了相异的表达趋势第158-159页
        6.4.4 在酵母中过表达TaCLP1提高酵母耐高盐及铜离子胁迫的能力第159-160页
        6.4.5 TaCLP1沉默之后提高了小麦对条锈病的抗性第160-163页
    6.5 讨论与结论第163-165页
第七章 全文结论第165-167页
参考文献第167-186页
附录第186-239页
致谢第239-240页
作者简介第240-241页

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