摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-38页 |
·引言 | 第12-14页 |
·分子标记 | 第14-20页 |
·基于分子杂交技术的分子标记 | 第14页 |
·基于PCR 技术的分子标记 | 第14-17页 |
·随机引物PCR 标记 | 第15-16页 |
·特异引物PCR 标记 | 第16-17页 |
·基于限制性内切酶和PCR 结合的分子标记 | 第17-18页 |
·基于微阵列的分子标记 | 第18-20页 |
·SRAP 标记 | 第20页 |
·遗传图谱 | 第20-24页 |
·遗传图谱构建的理论基础 | 第21-22页 |
·作图群体的选择 | 第22-23页 |
·作图软件 | 第23-24页 |
·油菜分子标记遗传图谱研究进展 | 第24-27页 |
·芸薹属基因组研究进展 | 第27-29页 |
·DNA 测序 | 第29-36页 |
·第一代测序技术 | 第30-31页 |
·第二代测序技术 | 第31-35页 |
·第三代测序技术 | 第35-36页 |
·本研究的目的和意义 | 第36-38页 |
第二章 白菜型油菜超高密度遗传连锁图谱的构建和SOLEXA 序列的整合 | 第38-76页 |
·材料与方法 | 第38-47页 |
·材料 | 第38页 |
·方法 | 第38-47页 |
·DNA 的提取 | 第38页 |
·SRAP 和SSR 分析 | 第38-40页 |
·分子标记的统计 | 第40-41页 |
·遗传图谱的构建 | 第41-43页 |
·遗传图谱的比对 | 第43页 |
·Solexa 测序样品的准备 | 第43-45页 |
·Solexa 序列分析 | 第45-46页 |
·Solexa 序列的整合 | 第46-47页 |
·结果与分析 | 第47-68页 |
·SRAP 标记和SSR 标记 | 第47-48页 |
·超高密度遗传图谱的构建 | 第48-51页 |
·不同遗传图谱间的比对 | 第51-58页 |
·用SRAP 标记进行比对 | 第51-56页 |
·用SSR 标记进行比对 | 第56-58页 |
·Solexa 测序样品和测序结果 | 第58页 |
·与Solexa 序列对应的SRAP 标记的验证 | 第58-64页 |
·Solexa 序列和遗传图谱的连锁检验 | 第64-68页 |
·讨论 | 第68-74页 |
·遗传图谱构建 | 第68-71页 |
·SRAP 标记的特点 | 第68-69页 |
·SRAP 是一种构建超高密度遗传图谱的有效方法 | 第69-70页 |
·偏分离分子标记对遗传作图的影响 | 第70页 |
·相似度为1 的标记 | 第70-71页 |
·Solexa 序列的整合 | 第71-74页 |
·SRAP 引物对SRAP 标记在染色体分布的影响 | 第71-72页 |
·Solexa 序列计数对整合成功率的影响 | 第72页 |
·用QTL 分析软件进行连锁检验 | 第72-73页 |
·两种Solexa 序列整合方法效率的比较 | 第73-74页 |
·框架遗传图谱的应用 | 第74页 |
·结论 | 第74-76页 |
·小结 | 第74页 |
·创新点 | 第74-75页 |
·展望 | 第75-76页 |
参考文献 | 第76-93页 |
附录1 SRAP 引物及标签引物 | 第93-100页 |
附录2 9177 个SRAP 标记及其图谱位置 | 第100-124页 |
附录3 位点特异引物及其对应的SRAP 引物 | 第124-129页 |
附录4 位点特异引物对应的SOLEXA 序列(除去引物) | 第129-133页 |
缩略词 | 第133-135页 |
致谢 | 第135-136页 |
作者简介 | 第136页 |