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白菜型油菜超高密度遗传图谱的构建和Solexa序列的整合

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一章 文献综述第12-38页
   ·引言第12-14页
   ·分子标记第14-20页
     ·基于分子杂交技术的分子标记第14页
     ·基于PCR 技术的分子标记第14-17页
       ·随机引物PCR 标记第15-16页
       ·特异引物PCR 标记第16-17页
     ·基于限制性内切酶和PCR 结合的分子标记第17-18页
     ·基于微阵列的分子标记第18-20页
     ·SRAP 标记第20页
   ·遗传图谱第20-24页
     ·遗传图谱构建的理论基础第21-22页
     ·作图群体的选择第22-23页
     ·作图软件第23-24页
   ·油菜分子标记遗传图谱研究进展第24-27页
   ·芸薹属基因组研究进展第27-29页
   ·DNA 测序第29-36页
     ·第一代测序技术第30-31页
     ·第二代测序技术第31-35页
     ·第三代测序技术第35-36页
   ·本研究的目的和意义第36-38页
第二章 白菜型油菜超高密度遗传连锁图谱的构建和SOLEXA 序列的整合第38-76页
   ·材料与方法第38-47页
     ·材料第38页
     ·方法第38-47页
       ·DNA 的提取第38页
       ·SRAP 和SSR 分析第38-40页
       ·分子标记的统计第40-41页
       ·遗传图谱的构建第41-43页
       ·遗传图谱的比对第43页
       ·Solexa 测序样品的准备第43-45页
       ·Solexa 序列分析第45-46页
       ·Solexa 序列的整合第46-47页
   ·结果与分析第47-68页
     ·SRAP 标记和SSR 标记第47-48页
     ·超高密度遗传图谱的构建第48-51页
     ·不同遗传图谱间的比对第51-58页
       ·用SRAP 标记进行比对第51-56页
       ·用SSR 标记进行比对第56-58页
     ·Solexa 测序样品和测序结果第58页
     ·与Solexa 序列对应的SRAP 标记的验证第58-64页
     ·Solexa 序列和遗传图谱的连锁检验第64-68页
   ·讨论第68-74页
     ·遗传图谱构建第68-71页
       ·SRAP 标记的特点第68-69页
       ·SRAP 是一种构建超高密度遗传图谱的有效方法第69-70页
       ·偏分离分子标记对遗传作图的影响第70页
       ·相似度为1 的标记第70-71页
     ·Solexa 序列的整合第71-74页
       ·SRAP 引物对SRAP 标记在染色体分布的影响第71-72页
       ·Solexa 序列计数对整合成功率的影响第72页
       ·用QTL 分析软件进行连锁检验第72-73页
       ·两种Solexa 序列整合方法效率的比较第73-74页
     ·框架遗传图谱的应用第74页
   ·结论第74-76页
     ·小结第74页
     ·创新点第74-75页
     ·展望第75-76页
参考文献第76-93页
附录1 SRAP 引物及标签引物第93-100页
附录2 9177 个SRAP 标记及其图谱位置第100-124页
附录3 位点特异引物及其对应的SRAP 引物第124-129页
附录4 位点特异引物对应的SOLEXA 序列(除去引物)第129-133页
缩略词第133-135页
致谢第135-136页
作者简介第136页

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