DNA序列相似性比对算法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 绪论 | 第9-14页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外的研究现状 | 第10-12页 |
| 1.3 本文的主要工作 | 第12-14页 |
| 2 DNA序列相似性分析方法概述 | 第14-27页 |
| 2.1 DNA序列背景知识 | 第14-17页 |
| 2.1.1 DNA序列的相关概念 | 第14-16页 |
| 2.1.2 DNA序列比对的基本概念 | 第16-17页 |
| 2.2 DNA序列图形表示方法介绍 | 第17-21页 |
| 2.2.1 2D图形表示方法 | 第17-19页 |
| 2.2.2 3D图形表示方法 | 第19-20页 |
| 2.2.3 其他图形表示方法 | 第20-21页 |
| 2.3 DNA序列比对方法介绍 | 第21-26页 |
| 2.3.1 双序列比对方法 | 第22-24页 |
| 2.3.2 多序列比对方法 | 第24-26页 |
| 2.4 小结 | 第26-27页 |
| 3 SDTW算法的DNA序列相似性分析 | 第27-40页 |
| 3.1 DTW算法 | 第27-30页 |
| 3.1.1 DTW算法介绍 | 第27-28页 |
| 3.1.2 DTW算法原理 | 第28-30页 |
| 3.2 SDTW算法的DNA序列相似性分析 | 第30-35页 |
| 3.2.1 问题描述 | 第30-31页 |
| 3.2.2 DNA序列的时间序列表示 | 第31-32页 |
| 3.2.3 算法原理 | 第32-33页 |
| 3.2.4 算法的描述 | 第33-35页 |
| 3.2.5 算法的复杂度分析 | 第35页 |
| 3.3 仿真实验及分析 | 第35-39页 |
| 3.3.1 实验说明 | 第35-37页 |
| 3.3.2 结果分析 | 第37-39页 |
| 3.4 小结 | 第39-40页 |
| 4 基于蚁群动态规划算法的DNA序列相似性分析 | 第40-56页 |
| 4.1 动态规划算法 | 第40-42页 |
| 4.1.1 动态规划算法的介绍 | 第40页 |
| 4.1.2 动态规划算法的基本要素 | 第40-41页 |
| 4.1.3 动态规划算法的基本框架 | 第41-42页 |
| 4.2 基本蚁群算法 | 第42-47页 |
| 4.2.1 蚁群算法的介绍 | 第42-44页 |
| 4.2.2 蚁群算法流程图 | 第44-46页 |
| 4.2.3 蚁群算法的复杂性分析 | 第46-47页 |
| 4.3 改进的蚁群动态规划算法 | 第47-51页 |
| 4.3.1 问题描述 | 第47页 |
| 4.3.2 DNA序列转化为数字序列 | 第47-48页 |
| 4.3.3 算法的基本原理 | 第48-50页 |
| 4.3.4 算法描述 | 第50-51页 |
| 4.3.5 算法的复杂性分析 | 第51页 |
| 4.4 仿真实验及分析 | 第51-55页 |
| 4.5 小结 | 第55-56页 |
| 5 总结与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 研究工作总结 | 第56-57页 |
| 5.2 研究工作展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 攻读学位期间主要研究成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
