| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 1. 前言 | 第15-25页 |
| 1.1 海洋石油污染的现状与危害 | 第15-16页 |
| 1.2 低温海洋环境中石油降解菌研究现状 | 第16-19页 |
| 1.3 深海弯曲菌Thalassolituus的研究概况 | 第19-23页 |
| 1.4 课题研究意义和内容 | 第23-25页 |
| 2. 材料和方法 | 第25-45页 |
| 2.1 材料 | 第25-32页 |
| 2.1.1 样品及菌株来源 | 第25-28页 |
| 2.1.2 菌株与载体 | 第28页 |
| 2.1.3 主要试剂和药品 | 第28-29页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第29页 |
| 2.1.5 常用培养基和溶液 | 第29-31页 |
| 2.1.6 分析软件 | 第31-32页 |
| 2.2 基本实验方法 | 第32-38页 |
| 2.2.1 细菌单菌DNA的提取 | 第32-33页 |
| 2.2.2 菌群DNA的提取 | 第33-34页 |
| 2.2.3 PCR反应体系 | 第34页 |
| 2.2.4 PCR扩增程序 | 第34-35页 |
| 2.2.5 菌落PCR | 第35页 |
| 2.2.6 PCR产物纯化 | 第35-36页 |
| 2.2.7 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第36-37页 |
| 2.2.8 DGGE条带回收、分析 | 第37页 |
| 2.2.9 TA克隆 | 第37-38页 |
| 2.3 烷烃降解理化性质的研究方法 | 第38-43页 |
| 2.3.1 Thalassolituus属菌株分离 | 第38-39页 |
| 2.3.2 透射电镜(TEM)细胞形态观察 | 第39页 |
| 2.3.3 生长曲线测定 | 第39-40页 |
| 2.3.4 表面张力测定 | 第40页 |
| 2.3.5 细胞表面疏水性测定 | 第40-41页 |
| 2.3.6 细胞脂肪酸测定 | 第41-42页 |
| 2.3.7 碳源利用范围测定 | 第42页 |
| 2.3.8 石油烃利用范围测定 | 第42页 |
| 2.3.9 深海弯曲菌与其它菌群和单菌的竞争性培养实验 | 第42-43页 |
| 2.4 R6-15烷烃降解基因分析 | 第43-44页 |
| 2.4.1 基因组测序方法 | 第43-44页 |
| 2.4.2 烃降解和冷适应相关基因分析方法 | 第44页 |
| 2.5 深海弯曲菌可培养菌株分离 | 第44-45页 |
| 2.5.1 样品富集 | 第44页 |
| 2.5.2 降解单菌分离 | 第44-45页 |
| 3. 结果与讨论 | 第45-100页 |
| 3.1 深海弯曲菌的烷烃降解特性 | 第45-76页 |
| 3.1.1 深海弯曲菌的分离 | 第45-46页 |
| 3.1.2 透射电镜观察 | 第46-48页 |
| 3.1.3 生长曲线测定 | 第48-51页 |
| 3.1.4 表而张力测定 | 第51-52页 |
| 3.1.5 细胞表面疏水性测定 | 第52-53页 |
| 3.1.6 脂肪酸测定 | 第53-54页 |
| 3.1.7 碳源利用范围测定 | 第54-56页 |
| 3.1.8 石油烃利用范围测定 | 第56-60页 |
| 3.1.9 深海弯曲菌与其它菌群和单菌的竞争性培养 | 第60-76页 |
| 3.2 深海弯曲菌R6-15全基因组测序分析 | 第76-88页 |
| 3.2.1 基因组测序概况及统计 | 第76-79页 |
| 3.2.2 烷烃降解及冷适应相关基因分析 | 第79-88页 |
| 3.3 深海弯曲菌可培养菌分离及多样性分析 | 第88-94页 |
| 3.3.1 西太平洋表层海水中可培养石油烃降解菌分离 | 第88-92页 |
| 3.3.2 厦门近海表层海水中可培养石油烃降解菌分离 | 第92-94页 |
| 3.4 讨论 | 第94-100页 |
| 3.4.1 深海弯曲菌的分离培养及多样性分析 | 第94-95页 |
| 3.4.2 深海弯曲菌低温下烃类降解机制 | 第95-97页 |
| 3.4.3 深海弯曲菌低温下占优势的原因 | 第97-100页 |
| 4. 小结与展望 | 第100-103页 |
| 4.1 小结 | 第100-102页 |
| 4.2 展望 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |
| 附录 | 第112页 |
