| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-22页 |
| 1.1 口蹄疫及其防治 | 第11-12页 |
| 1.1.1 口蹄疫的概况 | 第11页 |
| 1.1.2 口蹄疫的防治策略 | 第11-12页 |
| 1.2 口蹄疫病毒 | 第12-18页 |
| 1.2.1 口蹄疫病毒的结构及扩散方式 | 第12-15页 |
| 1.2.2 衣壳蛋白及其酸敏感性研究进展 | 第15-17页 |
| 1.2.3 3D聚合酶抑制剂研究进展 | 第17-18页 |
| 1.3 理论与方法 | 第18-20页 |
| 1.3.1 分子动力学模拟 | 第18-19页 |
| 1.3.2 基于分子对接的虚拟筛选 | 第19-20页 |
| 1.4 计算机辅助药物设计技术在衣壳蛋白酸敏感机制研究及3D聚合酶抑制剂发现中的应用 | 第20-22页 |
| 第二章 口蹄疫病毒衣壳蛋白酸敏感分子机制的分子动力学模拟研究 | 第22-40页 |
| 2.1 背景介绍 | 第22页 |
| 2.2 实验准备和方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 模型构建 | 第22-24页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第24页 |
| 2.2.3 结合自由能分解 | 第24-25页 |
| 2.2.4 丙氨酸扫描计算 | 第25页 |
| 2.2.5 主成分分析 | 第25页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第25-38页 |
| 2.3.1 体系的平衡 | 第25-26页 |
| 2.3.2 酸性条件下衣壳蛋白VP2和VP3的构象变化 | 第26-28页 |
| 2.3.3 热点残基的识别 | 第28-30页 |
| 2.3.4 酸性条件下衣壳蛋白VP2和VP3解离的分子机制 | 第30-38页 |
| 2.4 本章小结 | 第38-40页 |
| 第三章 FMDV衣壳蛋白VP3上H3144质子化对其稳定性的影响. | 第40-49页 |
| 3.1 研究背景 | 第40页 |
| 3.2 实验准备与方法 | 第40-42页 |
| 3.2.1 模型构建 | 第40-41页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第41-42页 |
| 3.2.3 残基相互作用网络分析 | 第42页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第42-47页 |
| 3.3.1 体系的平衡 | 第42-43页 |
| 3.3.2 VP3上H3144的质子化导致的构象变化 | 第43-45页 |
| 3.3.3 VP3上H3144的质子化导致衣壳蛋白解离的分子机制 | 第45-47页 |
| 3.4 本章小结 | 第47-49页 |
| 第四章 口蹄疫病毒3D聚合酶非竞争性抑制剂的虚拟筛选 | 第49-59页 |
| 4.1 研究背景 | 第49-50页 |
| 4.2 实验准备与方法 | 第50-53页 |
| 4.2.1 蛋白晶体结构的准备 | 第50-51页 |
| 4.2.2 基于分子对接的虚拟筛选 | 第51-52页 |
| 4.2.3 病毒抑制实验 | 第52-53页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第53-57页 |
| 4.3.1 虚拟筛选蛋白结构的获得 | 第53-54页 |
| 4.3.2 虚拟筛选结果及后处理 | 第54-56页 |
| 4.3.3 病毒抑制实验结果分析 | 第56-57页 |
| 4.4 本章小结 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 在学期间的研究成果 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
