首页--医药、卫生论文--神经病学与精神病学论文--神经肌肉疾病论文--重症肌无力论文

重症肌无力差异LncRNAs的表达及生物信息学研究

摘要第4-7页
Abstract第7-10页
目录第11-15页
第一章 前言第15-17页
第二章 材料与方法第17-31页
    2.1 材料第17-20页
        2.1.1 重症肌无力血液样本及对照样本资料和处理第17-18页
        2.1.2 lncRNA芯片第18-20页
    2.2 lncRNA芯片实验试剂仪器第20-24页
        2.2.1 lncRNA主要试剂第20-21页
        2.2.2 主要仪器耗材第21页
        2.2.3 实验步骤第21-24页
    2.3 lncRNA数据分析第24-27页
        2.3.1 lncRNA及共表的mRNA均一及差异筛选的方法第24-25页
        2.3.2 差异基因共表达的筛选方法及共表达模式说明第25-26页
        2.3.3 差异lncRNA的基因功能注释第26-27页
        2.3.4 LncRNAs与其临近编码基因的基因组共表达精细作图第27页
        2.3.5 LncRNAs通过trans机制调控的靶基因第27页
    2.4 差异lncRNA的real-time PCR验证第27-31页
        2.4.1 试剂第27-28页
        2.4.2 验证样本的RNA提取方法第28-29页
        2.4.3 RNA提出质量检测第29页
        2.4.4 RNA逆转录第29-30页
        2.4.5 荧光定量PCR检测方法第30-31页
第三章 结果第31-117页
    第一部分:重症肌无力lncRNA及mRNA芯片结果第31-37页
        1.1 重症肌无力外周血标本和正常健康对照人外周血标本的收集第31-32页
        1.2 外周血标本的总RNA提取第32-34页
        1.3 重症肌无力及健康对照外周血样本lncRNA芯片及mRNA芯片筛选第34-37页
            1.3.1 OE_Biotech Human lncRNA芯片V2.0芯片检测第34-36页
            1.3.2 lncRNA芯片的数据分析第36-37页
    第二部分:重症肌无力并发胸腺瘤的lncRNA及mRNA结果分析第37-66页
        2.1 重症肌无力并发胸腺瘤的差异lncRNA及mRNA第37-47页
        2.2 重症肌无力并发胸腺瘤组与健康对照组差异lncRNA和mRNA的SAM分析第47页
        2.3 重症肌无力并发胸腺瘤组的差异lncRNA和mRNA的cluster分析第47-48页
        2.4 重症肌无力并发胸腺瘤组与正常对照组差异表达的lncRNA的共表达基因第48-60页
            2.4.1 上调lncRNA oebiotech_11933的共表达基因第49-50页
            2.4.2 上调LncRNAs oebiotech_11933和A_24_P927716的生物学功能注释参与的信号通路的关系第50-54页
            2.4.3 下调lncRNA A_21_P0010030和A_21_P0002844的共表达基因及功能注释第54-60页
        2.5 重症肌无力并发胸腺瘤组与正常组lncRNA功能预测网络图及统计特征第60-61页
        2.6 LncRNAs与其临近编码基因的基因组共表达精细作图第61-63页
        2.7 LncRNAs与通过trans机制调控的靶基因第63-66页
            2.7.1 重症肌无力并发胸腺瘤差异转录因子--LncRNAs二元组关系及其网络第64页
            2.7.2 重症肌无力并发胸腺瘤差异转录因子--LncRNAs—靶基因三元组关系及其生物学意义第64-66页
    第三部分:重症肌无力胸腺无异常的lncRNA及mRNA结果分析第66-89页
        3.1 重症肌无力胸腺无异常的差异lncRNA及mRNA第66-70页
        3.2 重症肌无力胸腺无异常的lncRNA和mRNA的SAM分析第70-71页
        3.3 重症肌无力胸腺无异常组与正常对照差异lncRNA和mRNA的cluster分析第71-72页
        3.4 重症肌无力胸腺无异常与正常对照组差异表达的lncRNA的共表达基因第72-84页
            3.4.1 重症肌无力胸腺无异常组与正常对照组上调lncRNA oebiotech_11933和lncRNA oebiotech_03926的共表达基因第73-75页
            3.4.2 上调LncRNAs oebiotech_11933和lncRNA_oebiotech_03926的生物学功能注释参与的信号通路的关系第75-78页
            3.4.3 下调 lncRNA_oebiotech02627 和 li_ncRNA_oebotech22482 的共表达基因及_功能注释第78-82页
            3.4.4 下调lncRNA oebiotech_22482共表达基因的GO和pathway分析第82-84页
        3.5 重症肌无力胸腺无异常组与正常组lncRNA功能预测网络图及统计特征第84-86页
        3.6 重症肌无力胸腺无异常组LNCRNAs与其临近编码基因的基因组共表达精细作图第86-87页
        3.7 LNCRNAs与通过trans机制调控的靶基因第87-89页
            3.7.1 重症肌无力胸腺无异常组差异LncRNAs--转录因子二元组关系及其网络第87-88页
            3.7.2 重症肌无力胸腺无异常组差异转录因子——LncRNAs--靶基因三元组关系及其生物学意义第88-89页
    第四部分:重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组的lncRNA及mRNA结果分析第89-117页
        4.1 重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组的lncRNA及mRNA第89-90页
        4.2 重症肌无力胸腺瘤组和重症肌无力胸腺无异常组差异lncRNA和mRNA的SAM分析第90-91页
        4.3 重症肌无力并发胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异lncRNA和mRNA的cluster分析第91-92页
        4.4 重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异表达lncRNA的共表达基因第92-103页
            4.4.1 上调lncRNA oebiotech_13222和lncRNAA_19_P00315959的共表达基因第93-94页
            4.4.2 上调lncRNA oebiotech_13222共表达基因的GO和pathway分析及功能注释第94-95页
            4.4.3 上调lncRNA A_19_P00315959在重症肌无力有无胸腺瘤异常的中的共表达基因的GO和pathway分析第95-97页
            4.4.4 重症肌无力并发胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组中下调IncRNAoebiotech_22652和lncRNA oebiotech_16223的共表达基因第97-99页
            4.4.5 下调lncRNA oebiotech_22652的GO和pathway及基因功能注释第99-101页
            4.4.6 下调lncRNA oebiotech_16223的GO和pathway及基因功能注释第101-103页
        4.5 重症肌无力差异lncRNA及mRNA的整合分析第103-113页
            4.5.1 重症肌无力差异lncRNA的整合分析第103-108页
            4.5.2 重症肌无力差异mRNA的整合分析第108-112页
            4.5.3 重症肌无力并发胸腺瘤与重症肌无力胸腺无异常的差异lncRNA功能预测网络图及统计特征第112-113页
        4.6 重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异LncRNAs其临近编码基因的基因组共表达精细作图第113-114页
        4.7 重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异LncRNAs与通过TRANS机制调控的靶基因第114-117页
            4.7.1 重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异转录因子--LncRNAs二元组关系及其网络第114-115页
            4.7.2 重症肌无力胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异转录因子-LncRNAs-靶基因三元组关系及其生物学意义第115-117页
第四章 讨论第117-131页
    IncRNA芯片在重症肌无力中研究的创新性第117-119页
    IncRNA在重症肌无力中的异常研究第119页
    重症肌无力并发胸腺瘤组整体差异比重症肌无力胸腺无异常组的差异多第119-120页
    重症肌无力并发胸腺瘤组与正常对照组差异第120-123页
    重症肌无力胸腺无异常组与正常对照组差异第123-125页
    重症肌无力并发胸腺瘤组与重症肌无力胸腺无异常组差异第125-128页
    重症肌无力共同差异变化IncRNA与mRNA第128页
    IncRNA的cis分析第128-129页
    IncRNA 的 trans 分析第129-131页
第五章 结论第131-132页
参考文献第132-141页
综述第141-150页
    参考文献第146-150页
研究成果第150-151页
致谢第151页

论文共151页,点击 下载论文
上一篇:肾细胞癌中有机阳离子转运体OCT2转录抑制机理研究—从表观遗传调控到化学治疗
下一篇:中国ACS患者氯吡格雷代谢相关基因多态性分布及其与近期临床终点的关联