| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 概述 | 第11-28页 |
| 1 户用沼气 | 第11-17页 |
| 1.1 户用沼气的现状 | 第11-12页 |
| 1.2 沼气发酵的机理 | 第12-13页 |
| 1.3 沼气发酵微生物 | 第13-17页 |
| 1.4 沼气发酵微生物的相互影响 | 第17页 |
| 2 沼气发酵原核生物的研究进展 | 第17-24页 |
| 2.1 标记基因研究微生物群落结构 | 第19-20页 |
| 2.2 宏组学研究微生物的功能和活性 | 第20-24页 |
| 3 农村户用沼气发酵原核生物研究的基本思路 | 第24-26页 |
| 4 本研究的立足点及意义 | 第26-28页 |
| 第二章 云南不同气候区域沼气发酵系统原核生物群落空间动态 | 第28-66页 |
| 1 材料与方法 | 第28-32页 |
| 1.1 样品采集 | 第28-30页 |
| 1.2 理化性质的测定 | 第30页 |
| 1.3 环境样品DNA的提取 | 第30页 |
| 1.4 原核生物16S rRNA基因扩增和纯化 | 第30-31页 |
| 1.5 文库的构建与测序 | 第31页 |
| 1.6 数据分析 | 第31-32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-55页 |
| 2.1 沼气池理化性质分析 | 第32-34页 |
| 2.2 测序结果分析 | 第34-35页 |
| 2.3 多样性分析 | 第35-39页 |
| 2.4 分类学分析 | 第39-49页 |
| 2.5 不同气候区域沼气发酵原核生物多样性差异 | 第49-53页 |
| 2.6 非生物环境因子的相关性分析 | 第53-55页 |
| 3 讨论 | 第55-66页 |
| 3.1 云南不同气候区域沼气系统中原核生物多样性 | 第55-60页 |
| 3.2 云南与不同地区的沼气发酵原核生物多样性比较 | 第60-62页 |
| 3.3 不同方法研究云南沼气发酵原核生物群落动态比较 | 第62页 |
| 3.4 细菌群落与非生物因子相关性 | 第62-64页 |
| 3.5 古菌群落与非生物因子相关性 | 第64-66页 |
| 第三章 DGGE研究模拟(热带)沼气发酵过程中的原核生物时间动态变化 | 第66-79页 |
| 1 材料与方法 | 第66-70页 |
| 1.1 模拟发酵系统参数 | 第66-67页 |
| 1.2 样品采集与保存 | 第67页 |
| 1.3 原核生物基因组DNA提取 | 第67页 |
| 1.4 细菌高变区片段的扩增 | 第67-68页 |
| 1.5 古菌高变区片段的扩增 | 第68-69页 |
| 1.6 DGGE变性梯度凝胶电泳 | 第69-70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-76页 |
| 2.1 原核生物基因组DNA提取 | 第70-71页 |
| 2.2 DGGE图像结果分析 | 第71-74页 |
| 2.3 细菌DGGE指纹图谱聚类分析 | 第74-75页 |
| 2.4 古菌DGGE指纹图谱聚类 | 第75-76页 |
| 3 讨论 | 第76-79页 |
| 3.1 DGGE图谱初步揭示沼气发酵原核生物的动态变化 | 第76-77页 |
| 3.2 模拟沼气发酵过程的原核生物演替规律 | 第77-79页 |
| 第四章 模拟沼气发酵系统模型中原核生物的时间动态变化 | 第79-106页 |
| 1 材料与方法 | 第79-80页 |
| 1.1 模拟实验的数据 | 第79页 |
| 1.2 沼气产量的测定 | 第79页 |
| 1.3 沼气中甲烷含量的测定 | 第79-80页 |
| 1.4 发酵液pH值的测定 | 第80页 |
| 1.5 发酵混合物理化性质的测定 | 第80页 |
| 1.6 原核生物基因组DNA提取和扩增 | 第80页 |
| 1.7 高通量测序和数据分析 | 第80页 |
| 2 结果与分析 | 第80-100页 |
| 2.1 模拟沼气发酵过程中的理化性质变化 | 第80-84页 |
| 2.2 Illumina测序结果 | 第84-87页 |
| 2.3 OTU分析 | 第87-88页 |
| 2.4 分类学分析 | 第88-97页 |
| 2.5 模拟沼气发酵过程原核生物群落演替 | 第97-99页 |
| 2.6 沼气发酵原核生物于非生物环境因子的相关性分析 | 第99-100页 |
| 3 讨论 | 第100-106页 |
| 3.1 模拟沼气发酵原核生物多样性 | 第100-102页 |
| 3.2 沼气发酵不同阶段的原核生物变化 | 第102-104页 |
| 3.3 模拟沼气发酵系统与原生沼气发酵系统的原核生物多样性比较 | 第104-105页 |
| 3.4 模拟沼气发酵原核生物与非生物因子相关性 | 第105-106页 |
| 第五章 结论与展望 | 第106-110页 |
| 1 总结 | 第106-108页 |
| 2 展望与设想 | 第108-110页 |
| 参考文献 | 第110-127页 |
| 攻读博±学位期发表的学术论文和研究成果 | 第127-129页 |
| 致谢 | 第129页 |
