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肺炎链球菌荚膜基因转录及其调控机制的研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
主要英文缩略词对照表第9-10页
第1章 引言第10-24页
    1.1 肺炎链球菌概述第10-11页
        1.1.1 肺炎链球菌的侵染和定植第10-11页
        1.1.2 肺炎链球菌的抗药性第11页
    1.2 肺炎链球菌的逃逸机制第11-12页
    1.3 荚膜多糖是肺炎链球菌逃逸免疫系统的关键结构第12-14页
    1.4 肺炎链球菌表型多样性的决定因素第14-17页
        1.4.1 肺炎链球菌的自然转化能力第14-16页
        1.4.2 肺炎链球菌中非自然转化导致的特定位点的同源重组第16-17页
    1.5 肺炎链球菌中荚膜多糖所面临的科学问题和拟解决的问题第17-22页
    1.6 论文的研究方法第22-23页
    1.7 本论文的研究意义第23页
    1.8 本论文的研究结构第23-24页
第2章 实验材料和方法第24-33页
    2.1 实验材料第24-25页
        2.1.1 实验菌株和质粒第24页
        2.1.2 实验所需试剂第24页
        2.1.3 实验仪器第24-25页
    2.2 实验方法第25-33页
        2.2.1 细菌培养第25页
        2.2.2 肺炎链球菌基因组DNA和大肠杆菌中质粒的提取第25-26页
        2.2.3 肺炎链球菌血清型的鉴定第26页
        2.2.4 肺炎链球菌自然转化实验第26-27页
        2.2.5 luc荧光蛋白报告系统的构建和测定第27页
        2.2.6 肺炎链球菌的基因敲除和回补菌株的构建第27-28页
        2.2.7 肺炎链球菌生长速率的测定第28页
        2.2.8 肺炎链球菌荚膜多糖的测定第28-29页
        2.2.9 肺炎链球菌与细胞的粘附实验第29页
        2.2.10 RNA提取和Northern印迹第29页
        2.2.11 逆转录PCR和实时定量PCR第29-30页
        2.2.12 引物延伸鉴定转录起始位点第30页
        2.2.13 肺炎链球菌的动物感染实验第30-31页
        2.2.14 七价疫苗抗体制备第31页
        2.2.15 统计分析第31-32页
        2.2.16 伦理申明第32-33页
第3章 针对肺炎链球菌荚膜多糖启动子和操纵子的研究第33-56页
    3.1 确定肺炎链球菌D39菌株中17个荚膜合成相关基因的共转录第33-35页
    3.2 鉴定肺炎链球菌D39的转录起始位点第35-36页
    3.3 确定肺炎链球菌D39荚膜基因上游序列对cps转录水平的影响第36-38页
    3.4 确定SS序列中影响荚膜基因转录水平的关键区域第38-39页
    3.5 确定肺炎链球菌D39荚膜基因上游dexB和cps2A之间的序列对荚膜合成的影响第39-40页
    3.6 确定肺炎链球菌TIGR4荚膜基因上游SS序列对cps转录水平和荚膜合成的影响第40-41页
    3.7 确定肺炎链球菌D39荚膜基因上游序列对粘附真核细胞的影响第41-42页
    3.8 确定D39荚膜基因上游序列对肺炎链球菌毒力的影响第42-44页
    3.9 肺炎链球菌荚膜多糖基因簇中保守基因cpsABCD对荚膜基因转录水平的影响第44-45页
    3.10 讨论第45-49页
    3.11 小结第49-56页
第4章 肺炎链球菌多样性荚膜启动子的生物学意义第56-77页
    4.1 侵袭性肺炎链球菌荚膜基因上游序列组成和核苷酸多态性分析第56-57页
    4.2 确定22种IPD荚膜基因上游序列对转录水平的影响第57-59页
    4.3 IPD荚膜基因上游序列的内在变化能调节荚膜的合成量第59-60页
    4.4 IPD荚膜基因上游序列的变化能调节与宿主细胞的粘附和致病性第60-63页
    4.5 肺炎链球菌血清型 6B多样性荚膜启动子在D39中的影响第63-64页
    4.6 血清型 6B多样性荚膜启动子在ST858(type 6B)中的影响第64-66页
    4.7 讨论第66-69页
        4.7.1 肺炎链球菌可以通过荚膜基因的转录变化调节荚膜的合成第67-68页
        4.7.2 肺炎链球菌多样性的荚膜启动子序列和致病性之间的关系第68页
        4.7.3 肺炎链球菌多样性的荚膜启动子序列是自然选择的结果第68-69页
        4.7.4 肺炎链球菌的自然转化能力是致使荚膜启动子多样性的主要机制第69页
    4.8 小结第69-77页
第5章 荚膜启动子core和SS序列中核苷酸功能的鉴定第77-87页
    5.1 荧光报告系统检测core序列中起关键作用的位点第77-78页
    5.2 荧光报告系统检测SS序列中起关键作用的位点第78-81页
    5.3 讨论第81页
    5.4 小结第81-87页
第6章 总结和展望第87-94页
    6.1 论文总结第87-88页
    6.2 论文展望第88-94页
        6.2.1 氧气浓度影响肺炎链球菌荚膜合成的思考第88-89页
        6.2.2 糖水化合物影响肺炎链球菌荚膜合成的思考第89-90页
        6.2.3 上皮细胞影响肺炎链球菌荚膜合成的思考第90页
        6.2.4 血液成分影响肺炎链球菌荚膜合成的思考第90-91页
        6.2.5 生物被膜形成对肺炎链球菌荚膜合成影响的思考第91-92页
        6.2.6 肺炎链球菌荚膜基因cpsABCD对荚膜合成的影响第92页
        6.2.7 SpxB和SpxR对肺炎链球菌荚膜合成的影响第92-93页
        6.2.8 限制修饰系统对肺炎链球菌荚膜合成的影响第93-94页
参考文献第94-109页
致谢第109-111页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第111页

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