| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 主要符号与英文缩写表 | 第18-19页 |
| 1 吲哚的微生物转化研究进展 | 第19-43页 |
| 1.1 吲哚的来源及其生物学特性 | 第19-29页 |
| 1.1.1 吲哚的物化性质、来源及危害 | 第19-24页 |
| 1.1.2 吲哚在微生物间的转运 | 第24-26页 |
| 1.1.3 吲哚对微生物的信号分子作用 | 第26-29页 |
| 1.2 吲哚的微生物转化研究 | 第29-40页 |
| 1.2.1 吲哚的微生物好氧降解研究 | 第29-34页 |
| 1.2.2 吲哚的微生物厌氧降解研究 | 第34-36页 |
| 1.2.3 吲哚的微生物转化合成靛蓝研究 | 第36-40页 |
| 1.3 本论文的选题依据及研究内容 | 第40-43页 |
| 1.3.1 本论文的选题依据 | 第40-41页 |
| 1.3.2 本论文的研究内容及意义 | 第41-43页 |
| 2 吲哚好氧生物转化微生物群落解析 | 第43-62页 |
| 2.1 材料与方法 | 第43-47页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第43-44页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第44-47页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第47-61页 |
| 2.2.1 实际焦化废水污泥微生物群落分析 | 第47-50页 |
| 2.2.2 吲哚废水反应器运行与产物分析 | 第50-52页 |
| 2.2.3 反应器污泥微生物群落多样性分析 | 第52-54页 |
| 2.2.4 反应器污泥微生物群落结构分析 | 第54-57页 |
| 2.2.5 反应器污泥中吲哚降解菌分析 | 第57-61页 |
| 2.3 本章小结 | 第61-62页 |
| 3 吲哚降解菌的筛选及Cupriavidus sp. SHE组学分析 | 第62-80页 |
| 3.1 材料与方法 | 第62-66页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第62-63页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第63-66页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第66-79页 |
| 3.2.1 吲哚降解菌株的筛选和鉴定 | 第66-67页 |
| 3.2.2 吲哚降解菌株降解特性 | 第67-70页 |
| 3.2.3 贪铜菌SHE降解吲哚途径解析 | 第70-73页 |
| 3.2.4 贪铜菌SHE基因组分析 | 第73-75页 |
| 3.2.5 贪铜菌SHE比较蛋白质组解析 | 第75-79页 |
| 3.3 本章小结 | 第79-80页 |
| 4 菌株Cupriavidus sp. SHE降解吲哚机制解析 | 第80-102页 |
| 4.1 材料与方法 | 第80-87页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第80-82页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第82-87页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第87-101页 |
| 4.2.1 吲哚加氧酶基因簇结构及荧光定量分析 | 第87-88页 |
| 4.2.2 吲哚加氧酶基因簇基因敲除及功能验证 | 第88-93页 |
| 4.2.3 邻氨基苯甲酸代谢基因簇结构分析及荧光定量 | 第93-95页 |
| 4.2.4 邻氨基苯甲酸代谢基因簇基因敲除及功能验证 | 第95-99页 |
| 4.2.5 菌株SHE降解吲哚的代谢途径确定 | 第99-101页 |
| 4.3 本章小结 | 第101-102页 |
| 5 吲哚加氧酶特性及其转化吲哚研究 | 第102-126页 |
| 5.1 材料与方法 | 第102-105页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第102-103页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第103-105页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第105-125页 |
| 5.2.1 吲哚加氧酶IndA生物信息学分析 | 第105-111页 |
| 5.2.2 吲哚加氧酶IndA酶学性质研究 | 第111-116页 |
| 5.2.3 重组大肠杆菌IND_AB合成靛蓝可行性研究 | 第116-118页 |
| 5.2.4 重组大肠杆菌IND_AB合成靛蓝环境因素优化 | 第118-120页 |
| 5.2.5 重组大肠杆菌IND_AB合成靛蓝培养基优化 | 第120-125页 |
| 5.3 本章小结 | 第125-126页 |
| 6 结论、创新点、建议 | 第126-128页 |
| 6.1 主要结论 | 第126-127页 |
| 6.2 创新点摘要 | 第127页 |
| 6.3 建议 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-142页 |
| 附录A 菌株SHE基因组中加氧酶总结列表 | 第142-147页 |
| 附录B 菌株SHE蛋白质组检测到的显著变化蛋白总结列表 | 第147-152页 |
| 附录C 菌株SHE中邻氨基苯甲酸辅酶A连接酶基因she1810序列 | 第152-153页 |
| 附录D 菌株SHE中吲哚加氧酶基因she5652序列 | 第153-154页 |
| 作者简介 | 第154-155页 |
| 攻读博士学位期间科研成果 | 第155-157页 |
| 致谢 | 第157页 |
