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介观耗散粒子动力学模拟程序并行化与性能优化

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
第一章 绪论第11-17页
   ·研究背景第11-15页
     ·分子模拟研究背景第11-13页
     ·并行计算研究背景第13-15页
   ·课题主要研究内容第15页
   ·论文的章节安排第15-16页
   ·本章小结第16-17页
第二章 耗散粒子动力学模拟第17-25页
   ·背景介绍第17-18页
   ·耗散粒子动力计算第18-20页
   ·串行模拟程序第20-23页
   ·本章小结第23-25页
第三章 DPD模拟程序并行化第25-39页
   ·作用力与力的作用范围第25-26页
   ·周期性边界条件第26-29页
   ·消息传递与MPI第29-33页
     ·并行编程模式第29-30页
     ·MPI基础第30-33页
   ·空间域分解算法第33-36页
   ·并行化流程第36-37页
   ·本章小结第37-39页
第四章 实验与分析第39-47页
   ·实验实例与参数选取第39-40页
     ·实例特性第39页
     ·作用参数第39-40页
   ·实验平台第40-41页
   ·SGE作业脚本和常用命令第41-43页
   ·性能分析第43-45页
   ·本章小结第45-47页
第五章 润湿现象的多体耗散粒子动力学模拟第47-55页
   ·引言第47页
   ·背景介绍第47-48页
   ·润湿现象的基本理论第48-50页
     ·润湿现象本质第48页
     ·表面张力第48-50页
   ·多体耗散粒子动力学模拟方法第50-51页
   ·润湿现象的多体DPD模拟实验实例第51-52页
   ·润湿现象的多体DPD模拟结果第52-53页
   ·本章小结第53-55页
第六章 结论与展望第55-57页
   ·结论第55页
   ·展望第55-57页
参考文献第57-59页
致谢第59-61页
研究成果及发表的学术论文第61-63页
作者和导师简介第63-64页
硕士研究生学位论文答辩委员会决议书第64-65页

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