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Ⅰ一个编码木聚糖水解酶基因,OsXYN1的功能解析 Ⅱ拟南芥中两个具有不同底物特异性的核苷酸转移酶共同介导microRNA降解的研究

中文摘要第7-11页
ABSTRACT第11-14页
Ⅰ.一个编码木聚糖水解酶基因,OSXYN1的功能解析第15-59页
    一 文献综述第15-25页
        1.1 次生细胞壁为植物细胞提供保护和机械支撑第15页
        1.2 细胞壁的组成成分第15-16页
        1.3 纤维素的生物合成与生物能源利用的遗传改良第16-18页
            1.3.1 纤维素的生物合成第16-17页
            1.3.2 纤维素合成相关基因遗传改良第17-18页
        1.4 木质素的生物合成与生物能源利用第18-20页
            1.4.1 木质素的生物合成第18-19页
            1.4.2 木质素合成相关基因的遗传改良第19-20页
        1.5 木聚糖的生物合成与遗传改良第20-22页
            1.5.1 木聚糖的生物合成第20-22页
            1.5.2 木聚糖合成相关基因的遗传改良第22页
        1.6 次生细胞壁生物合成的转录调控第22-25页
        1.7 开题设想第25页
    二 实验材料第25-27页
        2.1 实验材料第25-26页
        2.2 实验菌株和克隆载体第26页
        2.3 主要分子生物学试剂以及试剂盒第26页
        2.4 主要仪器设备第26页
        2.5 实验中合成的DNA寡聚核苷酸序列第26-27页
    三 实验技术方法第27-31页
        3.1 农艺性状调查第27页
        3.2 水稻原生质体的制备与转化第27-28页
        3.3 基因枪转化洋葱表皮细胞第28-29页
        3.4 原位杂交技术第29页
        3.5 细胞壁单糖组分分析第29-30页
        3.6 叶片中细胞可溶性寡聚糖含量测定第30-31页
        3.7 茎秆中纤维素酶活性检测第31页
        3.8 木聚糖内切酶活性检测第31页
        3.9 载体构建第31页
        3.10 OsXYN1蛋白原核纯化第31页
    四 实验结果第31-49页
        4.1 OSXYN1的突变导致多种农艺性状的改变第31-35页
        4.2 OSXYN1的突变导致叶绿体结构以及茎秆细胞初生细胞壁沉积异常第35-36页
        4.3 OSXYN1-1的遗传分析与基因定位第36-39页
        4.4 OsXYN1的表达时期与部位第39-41页
        4.5 OsXYN1为细胞膜结合蛋白第41-43页
        4.6 OSXYN1-1突变体茎秆中细胞壁单糖组分分析第43-45页
        4.7 OSXYN1-1突变体叶片中含有ARA的可溶性寡聚糖含量增高第45-47页
        4.8 OSXYN1的突变导致细胞壁生物合成受阻第47-49页
    五 讨论第49-52页
        5.1 OsXYN1是重要的影响"源、库、流"多性状的关键基因具有重要的育种运用价值第49页
        5.2 OsXYN1编码糖苷水解酶与木聚糖中含有阿拉伯糖的侧链的水解相关第49-51页
        5.3 OsXYN1影响次生细胞壁的形成第51-52页
    六 文献引用第52-59页
Ⅱ.拟南芥中两个具有不同底物特异性的核苷酸转移酶共同介导第59-125页
    一 文献综述第59-73页
        1.1 有关小RNA的研究历史第59-61页
            1.1.1 PTGS第59-60页
            1.1.2 PTGS和RNA干涉(RNAi)第60页
            1.1.3 依赖RNA的DNA甲基化修饰(RdDM)第60-61页
        1.2 MIRNA的生物合成、作用机理与降解机制第61-72页
            1.2.1 miRNA的生物合成第61-67页
            1.2.2 RISC沉默复合体抑制靶基因的表达第67-70页
            1.2.3 有关miRNA降解的研究第70-72页
        1.3 开题设想第72-73页
    二 实验材料及方法第73-77页
        2.1 实验材料第73页
        2.2 实验菌株、克隆载体第73-74页
        2.3 主要分子生物学试剂与试剂盒第74页
        2.4 主要仪器设备第74-75页
        2.5 实验中合成的DNA,RNA寡核苷酸序列第75-77页
    三 实验方法第77-87页
        3.1 候选核苷酸转移酶同源性分析第77页
        3.2 PCR扩增以及PCR产物回收第77-78页
        3.3 载体构建第78页
            互补载体的构建第78页
            原核蛋白表达载体的构建第78页
        3.4 拟南芥的遗传转化第78-79页
        3.5 DIRTY法提取拟南芥DNA第79-80页
        3.6 RNA提取以及小RNA的富集第80-81页
            RNA提取(TRI试剂提取法)第80页
            小RNA富集第80-81页
        3.7 高通量小RNA库的构建与测序分析第81-82页
        3.8 定量RT-PCR分析第82页
        3.9 NORTHERN杂交实验第82-84页
        3.10 MIRNA的加尾分析第84-85页
        3.11 蛋白的原核纯化以及活性检测第85页
        3.12 AGO1以及相结合的小RNA免疫共沉淀第85-86页
        3.13 作用于AGO1-BOUND MIRNA的核苷酸转移酶活性检测第86页
        3.14 URT1尿嘧啶化修饰后,AGO1结合MIRNA剪切活性检测第86-87页
        3.15 PHB体外转录第87页
    四 实验结果与分析第87-116页
        4.1 URT1负责HEN1-8突变体部分MIRNA的尿嘧啶修饰第87-93页
        4.2 URT1和HESO1共同介导MIR158的3'末端尿嘧啶化加尾作用第93-97页
        4.3 在体外URT1具有核苷酸转移酶活性第97-99页
        4.4 URT1和HESO1相继加尾MIR173同时降低相应TA-SIRNA的生物合成第99-102页
        4.5 URT1和HESO1在体外表现出不同的底物特异性第102-105页
        4.6 HESO1和URT1作用于AGO1结合的MIRNA第105-109页
        4.7 HEN1背景下URT1将MIR171A由21-NT加尾成为22-NT促使激发PHASIRNA生物合成。第109-113页
        4.8 URT1加尾修饰MIR165/6降低其剪切活性第113-116页
    五 讨论第116-119页
        5.1 同为核苷酸转移酶,URT1、HESO1不仅具有共性也具有各自的独特性第116-117页
        5.2 RISC中AGO1结合MIRNA的加尾及加尾后对RISC复合体的影响第117-119页
    六 参考文献第119-125页
附录1 原生质体制备过程中所需试剂第125-127页
在读期间发发表的文章第127页
专利第127-128页
致谢第128-130页

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