| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-43页 |
| 1.1 脂肪沉积在猪育种中的重要作用 | 第12-16页 |
| 1.1.1 猪肉消费在我国的整体情况 | 第12页 |
| 1.1.2 脂肪沉积影响生猪的生产效率 | 第12-13页 |
| 1.1.3 脂肪沉积影响猪肉品质 | 第13-14页 |
| 1.1.4 脂肪沉积影响猪的繁殖性能 | 第14-15页 |
| 1.1.5 猪是很好的研究肥胖问题的动物模型 | 第15-16页 |
| 1.2 脂肪分化、发育研究 | 第16-25页 |
| 1.2.1 脂肪组织 | 第16页 |
| 1.2.2 脂肪细胞的来源和分化 | 第16-20页 |
| 1.2.3 脂肪代谢的基本过程 | 第20-21页 |
| 1.2.4 猪脂肪组织的发育规律 | 第21-22页 |
| 1.2.5 脂肪组织的功能 | 第22-24页 |
| 1.2.6 肝脏的功能 | 第24-25页 |
| 1.3 猪脂肪功能基因组研究 | 第25-40页 |
| 1.3.1 DNA 水平 | 第26-31页 |
| 1.3.2 RNA 水平 | 第31-37页 |
| 1.3.3 蛋白质水平 | 第37-40页 |
| 1.4 猪育种选择手段 | 第40-41页 |
| 1.4.1 常规育种 | 第40页 |
| 1.4.2 分子育种 | 第40-41页 |
| 1.5 本研究的目的意义、主要内容 | 第41-43页 |
| 第二章 试验群体构建及脂肪对肉质的影响 | 第43-57页 |
| 2.1 试验材料 | 第43页 |
| 2.1.1 试验群体 | 第43页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第43页 |
| 2.2 试验方法 | 第43-48页 |
| 2.2.1 群体的背膘活体测定 | 第43-44页 |
| 2.2.2 极端群体的选择 | 第44页 |
| 2.2.3 屠宰并取样 | 第44页 |
| 2.2.4 肉品质性状的测定 | 第44-47页 |
| 2.2.5 统计分析 | 第47-48页 |
| 2.3 试验结果 | 第48-55页 |
| 2.3.1 极端个体的选择及校正背膘厚度的比较 | 第48-49页 |
| 2.3.2 脂肪相关性状的比较 | 第49-50页 |
| 2.3.3 肉品质性状的比较 | 第50-51页 |
| 2.3.4 单位面积肌肉纤维数目的比较 | 第51-53页 |
| 2.3.5 单位面积脂肪细胞数的比较 | 第53-55页 |
| 2.4 讨论 | 第55-56页 |
| 2.5 小结 | 第56-57页 |
| 第三章 不同表型松辽黑猪脂肪组织、肝脏转录组测序与基因组重测序 | 第57-87页 |
| 3.1 试验材料 | 第57-58页 |
| 3.1.1 试验动物与采样 | 第57-58页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第58页 |
| 3.1.3 主要仪器和设备 | 第58页 |
| 3.2 试验方法 | 第58-63页 |
| 3.2.1 松辽黑猪脂肪组织的转录组测序 | 第58-60页 |
| 3.2.2 松辽黑猪肝脏组织的转录组测序 | 第60页 |
| 3.2.3 定量PCR的验证 | 第60-62页 |
| 3.2.4 松辽黑猪全基因组的重测序 | 第62-63页 |
| 3.3 试验结果 | 第63-83页 |
| 3.3.1 总RNA的质检结果 | 第63-65页 |
| 3.3.2 松辽黑猪脂肪组织转录组测序 | 第65-72页 |
| 3.3.3 松辽黑猪肝脏转录组测序 | 第72-78页 |
| 3.3.4 荧光定量PCR测序验证转录组测序的结果 | 第78-80页 |
| 3.3.5 松辽黑猪基因组重测序 | 第80-82页 |
| 3.3.6 整合分析松辽黑猪转录组测序与重测序数据 | 第82-83页 |
| 3.4 讨论 | 第83-85页 |
| 3.5 小结 | 第85-87页 |
| 第四章 不同表型长白猪脂肪组织、肝脏转录组测序与全基因组重测序 | 第87-110页 |
| 4.1 试验材料 | 第87页 |
| 4.1.1 试验动物与采样 | 第87页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第87页 |
| 4.1.3 主要仪器和设备 | 第87页 |
| 4.2 试验方法 | 第87-88页 |
| 4.3 试验结果 | 第88-107页 |
| 4.3.1 总RNA的质检结果 | 第88-89页 |
| 4.3.2 长白猪脂肪组织转录组测序 | 第89-97页 |
| 4.3.3 长白猪肝脏转录组测序 | 第97-104页 |
| 4.3.4 荧光定量PCR测序验证转录组测序的结果 | 第104页 |
| 4.3.5 长白猪基因组重测序 | 第104-107页 |
| 4.3.6 整合分析长白猪脂肪组织转录组测序与基因组重测序数据 | 第107页 |
| 4.4 讨论 | 第107-109页 |
| 4.5 小结 | 第109-110页 |
| 第五章 整合转录组与QTL数据分析 | 第110-124页 |
| 5.1 转录组比较分析 | 第110-113页 |
| 5.1.1 松辽黑猪和长白猪脂肪组织中差异表达基因的比较 | 第110-111页 |
| 5.1.2 松辽黑猪和长白猪肝脏中差异表达基因的比较 | 第111页 |
| 5.1.3 本研究结果与其它相关研究的比较 | 第111-113页 |
| 5.2 与猪脂肪性状相关QTL数据库的比较 | 第113-123页 |
| 5.2.1 松辽黑猪差异表达基因与脂肪相关QTL的比较 | 第113-115页 |
| 5.2.2 长白猪差异表达基因与脂肪相关QTL的比较 | 第115-123页 |
| 5.3 小结 | 第123-124页 |
| 第六章 部分候选基因与脂肪性状的遗传分析 | 第124-132页 |
| 6.1 试验材料 | 第124-125页 |
| 6.1.1 试验群体 | 第124页 |
| 6.1.2 主要试剂 | 第124页 |
| 6.1.3 主要仪器 | 第124-125页 |
| 6.2 试验方法 | 第125-128页 |
| 6.2.1 群体表型测定 | 第125页 |
| 6.2.2 猪尾组织及耳组织的基因组DNA提取 | 第125-126页 |
| 6.2.3 分型SNP位点的选择 | 第126页 |
| 6.2.4 飞行质谱SNP位点分型 | 第126-127页 |
| 6.2.5 多态位点与背膘厚度的关联分析 | 第127-128页 |
| 6.3 试验结果 | 第128-130页 |
| 6.3.1 猪基因组DNA提取结果 | 第128页 |
| 6.3.2 质谱SNP分型结果 | 第128-129页 |
| 6.3.3 多态位点与背膘厚度的关联分析 | 第129-130页 |
| 6.4 讨论 | 第130-131页 |
| 6.5 小结 | 第131-132页 |
| 第七章 结论 | 第132-133页 |
| 参考文献 | 第133-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
| 附录 | 第144-177页 |
| 个人简介 | 第177页 |
